52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0506 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0506  putative permease  100 
 
 		 210 aa  428  1e-119  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0846  glycoside-Pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  50.74 
 
 		 416 aa  200  1.9999999999999998e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02710  Major Facilitator Superfamily transporter  36.67 
 
 		 428 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2979  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 		 421 aa  131  7.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0876079  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1832  glycoside-Pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  47.58 
 
 		 353 aa  113  2.0000000000000002e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1988  major facilitator superfamily MFS_1  30.19 
 
 		 425 aa  105  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3996  major facilitator transporter  31.75 
 
 		 438 aa  95.9  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03160  Na+/melibiose symporter-like transporter  33.87 
 
 		 419 aa  88.6  6e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3775  major facilitator superfamily MFS_1  30.33 
 
 		 425 aa  84.3  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0427  major facilitator superfamily MFS_1  23.56 
 
 		 426 aa  82.4  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0806  major facilitator transporter  28.23 
 
 		 419 aa  80.9  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1330  Na+/sugar symporter  27.47 
 
 		 545 aa  76.6  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4387  major facilitator superfamily MFS_1  28.88 
 
 		 429 aa  76.3  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.591192  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2528  major facilitator superfamily MFS_1  26.21 
 
 		 451 aa  75.5  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2534  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 		 446 aa  75.1  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3554  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 423 aa  71.6  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0255  major facilitator transporter  29.95 
 
 		 440 aa  69.7  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1439  major facilitator superfamily MFS_1  28.27 
 
 		 426 aa  68.6  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0835777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4281  major facilitator superfamily MFS_1  28.28 
 
 		 423 aa  68.2  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.502977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2779  major facilitator transporter  24.69 
 
 		 443 aa  67.4  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.617635  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0034  major facilitator superfamily MFS_1  27.88 
 
 		 435 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6833  transporter, major facilitator superfamily  25.79 
 
 		 423 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal  0.570568 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3224  major facilitator superfamily MFS_1  26.51 
 
 		 433 aa  58.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0616  major facilitator superfamily MFS_1  25.97 
 
 		 443 aa  55.1  0.0000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0461422  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14174  predicted protein  25.53 
 
 		 405 aa  54.3  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3267  major facilitator transporter  24.85 
 
 		 415 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0780681  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2955  major facilitator superfamily MFS_1  25.87 
 
 		 405 aa  51.6  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1836  major facilitator transporter  22.4 
 
 		 440 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.860837  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2450  major facilitator superfamily MFS_1  29.89 
 
 		 407 aa  47  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.557384  normal  0.479748 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3242  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 		 401 aa  45.1  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.21 
 
 		 483 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2038  putative multidrug resistance protein  33.9 
 
 		 391 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3423e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2004  multidrug resistance protein  33.9 
 
 		 391 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.627866  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1832  multidrug resistance protein  33.9 
 
 		 391 aa  44.3  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.71931  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1862  multidrug resistance protein  33.9 
 
 		 391 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.94 
 
 		 475 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  34.25 
 
 		 403 aa  43.5  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2117  putative multidrug resistance protein  32.2 
 
 		 391 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.521892  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4967  major facilitator transporter  23.53 
 
 		 440 aa  43.5  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.880384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0892  major facilitator transporter  26.76 
 
 		 424 aa  43.9  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.805867  normal  0.497197 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4605  major facilitator family transporter  37.5 
 
 		 441 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.657733  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2991  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 		 419 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3129  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 		 419 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0344  major facilitator transporter  26.83 
 
 		 433 aa  42.7  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1280  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.92 
 
 		 459 aa  42.7  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.086672  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0161  major facilitator superfamily permease  24.72 
 
 		 392 aa  42.7  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4624  major facilitator family transporter  39.73 
 
 		 441 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0497223  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4590  major facilitator family transporter  39.73 
 
 		 441 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04650  arabinose efflux permease family protein  26.46 
 
 		 405 aa  42  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 407 aa  42.4  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1734  transporter, putative  30.69 
 
 		 400 aa  42.4  0.006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.184297  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10910  major facilitator transporter  24.09 
 
 		 419 aa  41.6  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0129173  normal  0.971248 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>