72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3224 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3224  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 433 aa  828    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6833  transporter, major facilitator superfamily  64.11 
 
 		 423 aa  436  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal  0.570568 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4281  major facilitator superfamily MFS_1  56.28 
 
 		 423 aa  430  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.502977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3996  major facilitator transporter  47.21 
 
 		 438 aa  343  2.9999999999999997e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0034  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 		 435 aa  342  8e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0255  major facilitator transporter  46.1 
 
 		 440 aa  317  4e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3775  major facilitator superfamily MFS_1  43.65 
 
 		 425 aa  304  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1439  major facilitator superfamily MFS_1  41.46 
 
 		 426 aa  257  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0835777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3554  major facilitator transporter  36.71 
 
 		 423 aa  247  3e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0427  major facilitator superfamily MFS_1  36.95 
 
 		 426 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1988  major facilitator superfamily MFS_1  36.56 
 
 		 425 aa  209  6e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0806  major facilitator transporter  36.63 
 
 		 419 aa  191  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2779  major facilitator transporter  34.21 
 
 		 443 aa  173  5e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.617635  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3267  major facilitator transporter  30.27 
 
 		 415 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0780681  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2534  major facilitator superfamily MFS_1  31.74 
 
 		 446 aa  157  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2528  major facilitator superfamily MFS_1  32.28 
 
 		 451 aa  154  4e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4387  major facilitator superfamily MFS_1  35.58 
 
 		 429 aa  152  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.591192  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2979  major facilitator superfamily MFS_1  31.22 
 
 		 421 aa  150  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0876079  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02710  Major Facilitator Superfamily transporter  32.5 
 
 		 428 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03160  Na+/melibiose symporter-like transporter  35.91 
 
 		 419 aa  145  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0454  major facilitator superfamily MFS_1  31.49 
 
 		 404 aa  145  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal  0.684757 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1836  major facilitator transporter  32.79 
 
 		 440 aa  129  9.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.860837  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2450  major facilitator superfamily MFS_1  29.8 
 
 		 407 aa  127  5e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.557384  normal  0.479748 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2955  major facilitator superfamily MFS_1  30.5 
 
 		 405 aa  124  5e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0846  glycoside-Pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  28.35 
 
 		 416 aa  123  6e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0892  major facilitator transporter  29.23 
 
 		 424 aa  98.6  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.805867  normal  0.497197 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1832  glycoside-Pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  27.04 
 
 		 353 aa  82.4  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1610  major facilitator transporter  26.53 
 
 		 404 aa  80.5  0.00000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1330  Na+/sugar symporter  27.09 
 
 		 545 aa  78.2  0.0000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14174  predicted protein  28.65 
 
 		 405 aa  74.3  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0921  major facilitator transporter  26.12 
 
 		 402 aa  72.4  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0506  putative permease  25.79 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6354  major facilitator transporter  26.93 
 
 		 442 aa  57  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1886  major facilitator transporter  34.29 
 
 		 501 aa  54.3  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.156331  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5086  major facilitator superfamily MFS_1  23.95 
 
 		 457 aa  53.9  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0501179  normal  0.911731 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0523  major facilitator transporter  22.95 
 
 		 416 aa  53.9  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  24.22 
 
 		 411 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45818  predicted protein  26.99 
 
 		 583 aa  51.6  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0729495  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3149  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 460 aa  48.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1877  major facilitator transporter  26.24 
 
 		 458 aa  48.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1369  major facilitator superfamily MFS_1  29.17 
 
 		 521 aa  47.8  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.845322  normal  0.437127 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4087  major facilitator transporter  31 
 
 		 514 aa  47.4  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  22.51 
 
 		 411 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  27.53 
 
 		 430 aa  47  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  33.87 
 
 		 394 aa  46.6  0.0009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2462  major facilitator superfamily MFS_1  32.17 
 
 		 411 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000109307  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0248  major facilitator transporter  32.35 
 
 		 486 aa  45.8  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.135747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2738  major facilitator transporter  38.16 
 
 		 510 aa  45.8  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.934726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1599  major facilitator transporter  27.76 
 
 		 421 aa  46.2  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1657  major facilitator transporter  28.27 
 
 		 518 aa  45.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1500  major facilitator transporter  38.16 
 
 		 448 aa  45.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.21091 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2904  tetracycline resistance protein  22.32 
 
 		 411 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.316872  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2202  major facilitator transporter  33.96 
 
 		 551 aa  45.1  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000401875 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1403  major facilitator transporter  31.62 
 
 		 505 aa  45.1  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.206645  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1874  major facilitator transporter  35.44 
 
 		 524 aa  44.7  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322942  normal  0.129685 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01889  sugar transporter  57.14 
 
 		 493 aa  44.7  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.660327  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2885  major facilitator transporter  18.05 
 
 		 432 aa  45.1  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00035649  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1089  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 		 509 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.339374  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0975  hypothetical protein  30.95 
 
 		 498 aa  44.7  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.798408  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2003  major facilitator transporter  34.57 
 
 		 530 aa  44.3  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1406  major facilitator transporter  24.05 
 
 		 401 aa  43.9  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000773977  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3400  tranporter transmembrane protein  27.88 
 
 		 421 aa  43.9  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1015  major facilitator transporter  29.08 
 
 		 502 aa  43.9  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1702  major facilitator superfamily MFS_1  26.43 
 
 		 438 aa  43.9  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101015  normal  0.0466104 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0616  major facilitator superfamily MFS_1  21.89 
 
 		 443 aa  43.5  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0461422  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0467  general substrate transporter  23.25 
 
 		 434 aa  43.5  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000495817  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  25.07 
 
 		 410 aa  43.5  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  26.9 
 
 		 445 aa  43.1  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2011  major facilitator superfamily MFS_1  23.53 
 
 		 551 aa  43.1  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000990966  hitchhiker  0.000202625 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2452  major facilitator transporter  23.53 
 
 		 551 aa  43.1  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3431  major facilitator superfamily MFS_1  31.03 
 
 		 404 aa  43.1  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00698685  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2336  major facilitator transporter  23.53 
 
 		 551 aa  43.1  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>