94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1439 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1439  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 426 aa  839    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0835777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4281  major facilitator superfamily MFS_1  40.1 
 
 		 423 aa  256  5e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.502977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3775  major facilitator superfamily MFS_1  37.53 
 
 		 425 aa  232  9e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3996  major facilitator transporter  38.2 
 
 		 438 aa  230  4e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6833  transporter, major facilitator superfamily  40.05 
 
 		 423 aa  226  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal  0.570568 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3224  major facilitator superfamily MFS_1  41.22 
 
 		 433 aa  225  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0034  major facilitator superfamily MFS_1  34.36 
 
 		 435 aa  205  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0255  major facilitator transporter  32.96 
 
 		 440 aa  191  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1988  major facilitator superfamily MFS_1  33.99 
 
 		 425 aa  190  5e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0427  major facilitator superfamily MFS_1  36.39 
 
 		 426 aa  187  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3554  major facilitator transporter  31.97 
 
 		 423 aa  179  5.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2979  major facilitator superfamily MFS_1  34.34 
 
 		 421 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0876079  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2528  major facilitator superfamily MFS_1  30.41 
 
 		 451 aa  160  5e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0806  major facilitator transporter  30.68 
 
 		 419 aa  160  6e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02710  Major Facilitator Superfamily transporter  32.33 
 
 		 428 aa  152  8.999999999999999e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4387  major facilitator superfamily MFS_1  33.06 
 
 		 429 aa  136  7.000000000000001e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.591192  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2779  major facilitator transporter  29.79 
 
 		 443 aa  131  3e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.617635  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3267  major facilitator transporter  30.03 
 
 		 415 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0780681  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2534  major facilitator superfamily MFS_1  26.88 
 
 		 446 aa  119  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0846  glycoside-Pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  26.3 
 
 		 416 aa  117  3e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2450  major facilitator superfamily MFS_1  30.62 
 
 		 407 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.557384  normal  0.479748 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03160  Na+/melibiose symporter-like transporter  30.77 
 
 		 419 aa  113  6e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2955  major facilitator superfamily MFS_1  29.64 
 
 		 405 aa  106  6e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0454  major facilitator superfamily MFS_1  27.22 
 
 		 404 aa  93.6  6e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal  0.684757 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1836  major facilitator transporter  27.61 
 
 		 440 aa  92.8  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.860837  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0892  major facilitator transporter  30.43 
 
 		 424 aa  88.2  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.805867  normal  0.497197 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1832  glycoside-Pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  26.11 
 
 		 353 aa  83.6  0.000000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0506  putative permease  29.32 
 
 		 210 aa  75.1  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45818  predicted protein  27.54 
 
 		 583 aa  66.2  0.0000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0729495  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14174  predicted protein  25.28 
 
 		 405 aa  66.2  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0523  major facilitator transporter  24.26 
 
 		 416 aa  63.9  0.000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1406  major facilitator transporter  23.1 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000773977  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2885  major facilitator transporter  23.72 
 
 		 432 aa  58.2  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00035649  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1330  Na+/sugar symporter  23.63 
 
 		 545 aa  58.2  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2559  major facilitator superfamily MFS_1  27.74 
 
 		 400 aa  52.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.71803  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1599  major facilitator transporter  23.76 
 
 		 421 aa  50.8  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2463  major facilitator superfamily MFS_1  30.61 
 
 		 438 aa  50.1  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.132377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1767  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.86 
 
 		 397 aa  49.3  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0616  major facilitator superfamily MFS_1  24.34 
 
 		 443 aa  49.3  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0461422  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1810  major facilitator superfamily MFS_1  35.58 
 
 		 491 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174923  hitchhiker  0.00284389 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1610  major facilitator transporter  23.8 
 
 		 404 aa  48.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03538  hypothetical protein  29.31 
 
 		 391 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1459  major facilitator superfamily MFS_1  35.14 
 
 		 411 aa  47.8  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.135074  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4212  multidrug efflux system protein MdtL  29.31 
 
 		 391 aa  47.8  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4284  multidrug efflux system protein MdtL  29.31 
 
 		 391 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4257  major facilitator superfamily MFS_1  29.31 
 
 		 391 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03594  multidrug efflux system protein  29.31 
 
 		 391 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3924  multidrug efflux system protein MdtL  29.31 
 
 		 391 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3431  major facilitator superfamily MFS_1  29.28 
 
 		 404 aa  47.4  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00698685  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3000  major facilitator superfamily transporter  33.04 
 
 		 397 aa  47.4  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  32.38 
 
 		 423 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3161  major facilitator superfamily MFS_1  34.95 
 
 		 442 aa  47  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.586334 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  32.38 
 
 		 423 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3567  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 402 aa  47  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1864  major facilitator transporter  30.46 
 
 		 417 aa  46.6  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.436032 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4939  major facilitator transporter  33.08 
 
 		 414 aa  46.2  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 407 aa  46.2  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0599  transporter, putative  30.59 
 
 		 501 aa  46.2  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4219  multidrug efflux system protein MdtL  28.74 
 
 		 391 aa  46.2  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3365  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  23.96 
 
 		 433 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00021546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  25.88 
 
 		 410 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  24.92 
 
 		 396 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2343  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.97 
 
 		 524 aa  45.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132405  normal  0.210612 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3149  major facilitator superfamily MFS_1  38.1 
 
 		 460 aa  45.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54022  probable hexose transporter  28.77 
 
 		 500 aa  45.4  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4077  multidrug efflux system protein MdtL  28.74 
 
 		 391 aa  45.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5141  multidrug efflux system protein MdtL  28.74 
 
 		 391 aa  45.8  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.280757 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2355  major facilitator superfamily MFS_1  23.77 
 
 		 385 aa  44.7  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0728  General substrate transporter  24.68 
 
 		 454 aa  44.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3953  major facilitator superfamily MFS_1  36.84 
 
 		 457 aa  44.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3053  major facilitator transporter  30.48 
 
 		 425 aa  44.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0798  transporter, putative  23.47 
 
 		 442 aa  44.3  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5623  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  26.23 
 
 		 431 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.119091 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2578  major facilitator superfamily transporter  31.88 
 
 		 426 aa  44.3  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0148068 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5039  major facilitator transporter  31.5 
 
 		 410 aa  44.3  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1790  major facilitator transporter  27.04 
 
 		 403 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1646  general substrate transporter  25.12 
 
 		 439 aa  43.9  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2273  general substrate transporter  27.19 
 
 		 440 aa  44.3  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.979998  normal  0.381458 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 		 395 aa  44.3  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0991  major facilitator transporter  32.17 
 
 		 416 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00118055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.81 
 
 		 485 aa  43.9  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4579  major facilitator transporter  34.25 
 
 		 487 aa  43.9  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0832  major facilitator family transporter  25.84 
 
 		 632 aa  43.5  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6371  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  25.9 
 
 		 431 aa  43.5  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.86681 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2104  major facilitator family transporter  27.71 
 
 		 432 aa  43.5  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.386264  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3060  transporter transmembrane protein  25.99 
 
 		 433 aa  43.5  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2667  general substrate transporter  26.74 
 
 		 437 aa  43.5  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.180535  normal  0.174811 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2454  major facilitator transporter  34.15 
 
 		 389 aa  43.5  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117931  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0888  major facilitator family transporter  25.84 
 
 		 632 aa  43.5  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5520  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  26.92 
 
 		 432 aa  43.1  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.112643 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1089  major facilitator superfamily MFS_1  38.71 
 
 		 509 aa  43.1  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.339374  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4917  major facilitator transporter  26.74 
 
 		 419 aa  43.1  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04660  Major Facilitator Superfamily transporter  40 
 
 		 393 aa  43.1  0.009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1657  major facilitator transporter  31.76 
 
 		 518 aa  43.1  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>