27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45818 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_45818  predicted protein  100 
 
 		 583 aa  1209    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0729495  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14174  predicted protein  25.85 
 
 		 405 aa  141  3.9999999999999997e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2528  major facilitator superfamily MFS_1  29.05 
 
 		 451 aa  61.6  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1439  major facilitator superfamily MFS_1  27.54 
 
 		 426 aa  59.3  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0835777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3775  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 425 aa  58.2  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0892  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 424 aa  57.4  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.805867  normal  0.497197 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4281  major facilitator superfamily MFS_1  27.56 
 
 		 423 aa  56.6  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.502977  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0454  major facilitator superfamily MFS_1  28.8 
 
 		 404 aa  56.6  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal  0.684757 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2534  major facilitator superfamily MFS_1  29.33 
 
 		 446 aa  55.5  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03160  Na+/melibiose symporter-like transporter  29.73 
 
 		 419 aa  55.5  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3554  major facilitator transporter  26.51 
 
 		 423 aa  53.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0427  major facilitator superfamily MFS_1  27.84 
 
 		 426 aa  53.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2955  major facilitator superfamily MFS_1  30.06 
 
 		 405 aa  52.8  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3224  major facilitator superfamily MFS_1  26.99 
 
 		 433 aa  51.2  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6833  transporter, major facilitator superfamily  26.96 
 
 		 423 aa  51.2  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal  0.570568 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3996  major facilitator transporter  27.7 
 
 		 438 aa  50.4  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3267  major facilitator transporter  27.33 
 
 		 415 aa  47.8  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0780681  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0034  major facilitator superfamily MFS_1  26.09 
 
 		 435 aa  47.8  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0806  major facilitator transporter  27.47 
 
 		 419 aa  46.6  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1988  major facilitator superfamily MFS_1  26.34 
 
 		 425 aa  46.6  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2979  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 		 421 aa  46.2  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0876079  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0726  putative multidrug resistance protein  28.87 
 
 		 487 aa  46.2  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1836  major facilitator transporter  24.89 
 
 		 440 aa  45.4  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.860837  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2450  major facilitator superfamily MFS_1  24.53 
 
 		 407 aa  44.7  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.557384  normal  0.479748 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0898  major facilitator superfamily permease  24.3 
 
 		 454 aa  44.7  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02289  sucrose transporter, putative (Eurofung)  20.92 
 
 		 635 aa  44.3  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4387  major facilitator superfamily MFS_1  23.87 
 
 		 429 aa  43.5  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.591192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>