54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1089 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1089  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 509 aa  1026    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.339374  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05075  putative sugar transporter  37.77 
 
 		 507 aa  347  4e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0544446  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1657  major facilitator transporter  40.71 
 
 		 518 aa  346  6e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1403  major facilitator transporter  38.31 
 
 		 505 aa  345  2e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.206645  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1021  major facilitator superfamily MFS_1  40.37 
 
 		 495 aa  341  2e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2738  major facilitator transporter  40.35 
 
 		 510 aa  341  2e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.934726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1874  major facilitator transporter  38.89 
 
 		 524 aa  339  8e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322942  normal  0.129685 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2003  major facilitator transporter  37.59 
 
 		 530 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2108  major facilitator transporter  37.84 
 
 		 531 aa  334  2e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.753085 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1925  major facilitator transporter  38.03 
 
 		 531 aa  334  3e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1870  major facilitator transporter  37.84 
 
 		 531 aa  333  6e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2011  major facilitator superfamily MFS_1  37.17 
 
 		 551 aa  331  2e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000990966  hitchhiker  0.000202625 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2452  major facilitator transporter  37.17 
 
 		 551 aa  331  2e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2347  major facilitator transporter  37.48 
 
 		 551 aa  330  3e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1776  major facilitator transporter  38.14 
 
 		 519 aa  330  4e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0516559  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2336  major facilitator transporter  36.98 
 
 		 551 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2187  major facilitator transporter  36.81 
 
 		 502 aa  326  7e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1015  major facilitator transporter  36.84 
 
 		 502 aa  326  7e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2202  major facilitator transporter  37.4 
 
 		 551 aa  323  4e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000401875 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0599  transporter, putative  39.04 
 
 		 501 aa  323  4e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870524  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2458  transporter, putative  37.5 
 
 		 529 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0864  major facilitator transporter  37.98 
 
 		 441 aa  309  9e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01240  sugar transporter  37.95 
 
 		 428 aa  304  2.0000000000000002e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.686511  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1886  major facilitator transporter  39.39 
 
 		 501 aa  298  2e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.156331  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3953  major facilitator superfamily MFS_1  36.29 
 
 		 457 aa  294  2e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02413  sugar transporter  39.79 
 
 		 443 aa  293  5e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01889  sugar transporter  34.4 
 
 		 493 aa  292  1e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.660327  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1877  major facilitator transporter  37.55 
 
 		 458 aa  290  3e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0975  hypothetical protein  33.94 
 
 		 498 aa  290  5.0000000000000004e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.798408  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4087  major facilitator transporter  39.17 
 
 		 514 aa  289  8e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0596  major facilitator transporter  36.79 
 
 		 500 aa  286  9e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.377823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5086  major facilitator superfamily MFS_1  35.8 
 
 		 457 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0501179  normal  0.911731 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1500  major facilitator transporter  56.67 
 
 		 448 aa  239  5.999999999999999e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.21091 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0893  major facilitator superfamily permease  28.97 
 
 		 450 aa  237  4e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0994  major facilitator superfamily permease  29.28 
 
 		 450 aa  234  2.0000000000000002e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.211502  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0087  major facilitator transporter  29.42 
 
 		 457 aa  217  2.9999999999999998e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000315537  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0898  major facilitator superfamily permease  26.82 
 
 		 454 aa  217  4e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0053  major facilitator transporter  28.91 
 
 		 449 aa  216  9e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000090495  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1614  major facilitator transporter  28.29 
 
 		 448 aa  207  4e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000115723  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0832  major facilitator superfamily permease  27.35 
 
 		 453 aa  207  5e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000561592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0084  major facilitator transporter  26.33 
 
 		 461 aa  176  9e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380135  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0041  major facilitator superfamily permease  26.1 
 
 		 471 aa  174  3.9999999999999995e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000141077  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2441  transporter, putative  33.33 
 
 		 453 aa  139  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0973262  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01510  conserved hypothetical protein  32.43 
 
 		 459 aa  77.8  0.0000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02289  sucrose transporter, putative (Eurofung)  28.08 
 
 		 635 aa  65.5  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1269  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.95 
 
 		 465 aa  55.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.727469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2885  major facilitator transporter  25.11 
 
 		 432 aa  53.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00035649  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2049  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  31.25 
 
 		 469 aa  52.8  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01690  conserved hypothetical protein  34.48 
 
 		 674 aa  50.8  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.887535  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0034  major facilitator superfamily MFS_1  32.71 
 
 		 435 aa  47.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02710  Major Facilitator Superfamily transporter  30.56 
 
 		 428 aa  47  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0846  glycoside-Pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  25 
 
 		 416 aa  44.7  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03160  Na+/melibiose symporter-like transporter  37.08 
 
 		 419 aa  44.3  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0523  major facilitator transporter  27.24 
 
 		 416 aa  43.5  0.009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>