64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3267 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3267  major facilitator transporter  100 
 
 		 415 aa  820    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0780681  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0427  major facilitator superfamily MFS_1  37.41 
 
 		 426 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1988  major facilitator superfamily MFS_1  35.59 
 
 		 425 aa  216  5e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3554  major facilitator transporter  34.41 
 
 		 423 aa  204  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0806  major facilitator transporter  35.17 
 
 		 419 aa  199  6e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0255  major facilitator transporter  32.78 
 
 		 440 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4281  major facilitator superfamily MFS_1  31.91 
 
 		 423 aa  181  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.502977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0034  major facilitator superfamily MFS_1  34.18 
 
 		 435 aa  174  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3996  major facilitator transporter  32.37 
 
 		 438 aa  165  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2528  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 		 451 aa  154  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02710  Major Facilitator Superfamily transporter  32.6 
 
 		 428 aa  151  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3775  major facilitator superfamily MFS_1  31.07 
 
 		 425 aa  149  9e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6833  transporter, major facilitator superfamily  32.93 
 
 		 423 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal  0.570568 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2979  major facilitator superfamily MFS_1  30.86 
 
 		 421 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0876079  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4387  major facilitator superfamily MFS_1  32.92 
 
 		 429 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.591192  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3224  major facilitator superfamily MFS_1  32.45 
 
 		 433 aa  134  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2534  major facilitator superfamily MFS_1  28.29 
 
 		 446 aa  128  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03160  Na+/melibiose symporter-like transporter  33.91 
 
 		 419 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2779  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 443 aa  119  7.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.617635  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1836  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 440 aa  115  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.860837  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0454  major facilitator superfamily MFS_1  29.48 
 
 		 404 aa  111  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal  0.684757 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2450  major facilitator superfamily MFS_1  30.91 
 
 		 407 aa  109  8.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.557384  normal  0.479748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1439  major facilitator superfamily MFS_1  29.43 
 
 		 426 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0835777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0846  glycoside-Pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  26.89 
 
 		 416 aa  108  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2955  major facilitator superfamily MFS_1  28.54 
 
 		 405 aa  107  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0892  major facilitator transporter  29.75 
 
 		 424 aa  105  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.805867  normal  0.497197 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0921  major facilitator transporter  27.34 
 
 		 402 aa  85.1  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1610  major facilitator transporter  28.31 
 
 		 404 aa  77.8  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14174  predicted protein  24.93 
 
 		 405 aa  77.4  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1832  glycoside-Pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  22.98 
 
 		 353 aa  67  0.0000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45818  predicted protein  27.33 
 
 		 583 aa  56.6  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0729495  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2885  major facilitator transporter  24.32 
 
 		 432 aa  56.6  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00035649  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0506  putative permease  24.85 
 
 		 210 aa  53.9  0.000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01889  sugar transporter  36.36 
 
 		 493 aa  52  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.660327  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1330  Na+/sugar symporter  24.07 
 
 		 545 aa  52  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0975  hypothetical protein  34.55 
 
 		 498 aa  49.7  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.798408  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0898  major facilitator superfamily permease  21.76 
 
 		 454 aa  49.3  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2237  general substrate transporter  26.01 
 
 		 444 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4415  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  58.82 
 
 		 552 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2187  major facilitator transporter  34.57 
 
 		 502 aa  48.5  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3149  major facilitator superfamily MFS_1  54.55 
 
 		 460 aa  48.5  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4479  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  58.82 
 
 		 552 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.176062 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3666  major facilitator transporter  25.68 
 
 		 444 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.262449 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1877  major facilitator transporter  23.88 
 
 		 458 aa  47.8  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0599  transporter, putative  38.37 
 
 		 501 aa  47.4  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2063  major facilitator transporter  25.68 
 
 		 444 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4290  major facilitator superfamily MFS_1  24.83 
 
 		 468 aa  47.4  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.720009 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1015  major facilitator transporter  31.72 
 
 		 502 aa  47  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1387  major facilitator superfamily transport protein  38.71 
 
 		 468 aa  46.6  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0294045  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3738  hypothetical protein  42.86 
 
 		 467 aa  46.6  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00183877  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5039  major facilitator transporter  29.63 
 
 		 410 aa  46.6  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0462  major facilitator family transporter  38.67 
 
 		 436 aa  45.8  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  27.71 
 
 		 407 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0532  major facilitator family transporter  38.67 
 
 		 436 aa  45.8  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1403  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 505 aa  44.7  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.206645  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01490  major facilitator superfamily permease  25.5 
 
 		 408 aa  44.7  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0591182  normal  0.340851 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3075  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  39.13 
 
 		 482 aa  43.9  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.818183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4087  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 514 aa  43.9  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05681  GPH family sugar transporter  58.62 
 
 		 480 aa  43.9  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17501  GPH family sugar transporter  50 
 
 		 467 aa  43.5  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.276796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0200  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  50 
 
 		 544 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0894  putative GPH family sugar transporter  50 
 
 		 451 aa  43.5  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.351001  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2233  general substrate transporter  25.08 
 
 		 444 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.527639 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1326  major facilitator transporter  28.39 
 
 		 464 aa  43.1  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.367254  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>