55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4387 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4387  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 429 aa  813    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.591192  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2779  major facilitator transporter  40.63 
 
 		 443 aa  260  4e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.617635  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0427  major facilitator superfamily MFS_1  34.52 
 
 		 426 aa  206  5e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4281  major facilitator superfamily MFS_1  34.59 
 
 		 423 aa  190  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.502977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1988  major facilitator superfamily MFS_1  33.73 
 
 		 425 aa  189  9e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0806  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 419 aa  169  7e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3996  major facilitator transporter  35.34 
 
 		 438 aa  169  8e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0034  major facilitator superfamily MFS_1  35.04 
 
 		 435 aa  164  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3554  major facilitator transporter  33.01 
 
 		 423 aa  154  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6833  transporter, major facilitator superfamily  34.04 
 
 		 423 aa  153  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal  0.570568 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1836  major facilitator transporter  31.68 
 
 		 440 aa  151  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.860837  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0255  major facilitator transporter  32.82 
 
 		 440 aa  150  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3775  major facilitator superfamily MFS_1  32.35 
 
 		 425 aa  140  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3267  major facilitator transporter  30.91 
 
 		 415 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0780681  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1439  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 426 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0835777  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3224  major facilitator superfamily MFS_1  35.51 
 
 		 433 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2528  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 		 451 aa  131  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2979  major facilitator superfamily MFS_1  31.74 
 
 		 421 aa  121  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0876079  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0846  glycoside-Pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  28.77 
 
 		 416 aa  117  5e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2534  major facilitator superfamily MFS_1  30.21 
 
 		 446 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02710  Major Facilitator Superfamily transporter  26.73 
 
 		 428 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03160  Na+/melibiose symporter-like transporter  29.71 
 
 		 419 aa  102  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2955  major facilitator superfamily MFS_1  28.2 
 
 		 405 aa  87  6e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0921  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 402 aa  80.9  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0506  putative permease  29.41 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0454  major facilitator superfamily MFS_1  24.62 
 
 		 404 aa  76.6  0.0000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal  0.684757 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0892  major facilitator transporter  27.95 
 
 		 424 aa  73.9  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.805867  normal  0.497197 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1832  glycoside-Pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  24.28 
 
 		 353 aa  73.6  0.000000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1610  major facilitator transporter  28.43 
 
 		 404 aa  67  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14174  predicted protein  24.64 
 
 		 405 aa  65.5  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2450  major facilitator superfamily MFS_1  24.46 
 
 		 407 aa  57.4  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.557384  normal  0.479748 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1015  major facilitator transporter  27.34 
 
 		 502 aa  52.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0356  major facilitator superfamily MFS_1  25.65 
 
 		 411 aa  50.4  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1500  major facilitator transporter  33.02 
 
 		 448 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.21091 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2382  hypothetical protein  24.38 
 
 		 387 aa  48.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1177  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 399 aa  47.8  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.670552 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2529  hypothetical protein  24.14 
 
 		 387 aa  47  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1147  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.58 
 
 		 702 aa  47  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.624322  normal  0.188028 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  27.23 
 
 		 408 aa  46.6  0.0009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1511  major facilitator transporter  27.34 
 
 		 399 aa  46.2  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0864  major facilitator transporter  31.53 
 
 		 441 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0455  hypothetical protein  26.27 
 
 		 394 aa  45.8  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0616  major facilitator superfamily MFS_1  26.27 
 
 		 394 aa  45.8  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  29.55 
 
 		 457 aa  45.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2885  major facilitator transporter  21.5 
 
 		 432 aa  45.1  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00035649  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2187  major facilitator transporter  29.05 
 
 		 502 aa  44.3  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3431  major facilitator superfamily MFS_1  31.46 
 
 		 404 aa  44.3  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00698685  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0936  MFS transporter family protein  28.85 
 
 		 458 aa  44.3  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1624  major facilitator superfamily MFS_1  25.08 
 
 		 421 aa  43.9  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767884  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3077  major facilitator transporter  30.69 
 
 		 456 aa  43.9  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374174  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  29.15 
 
 		 457 aa  43.5  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1403  major facilitator transporter  31.71 
 
 		 505 aa  43.1  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.206645  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5767  major facilitator family transporter  27.39 
 
 		 438 aa  43.1  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.554362  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1330  Na+/sugar symporter  22.1 
 
 		 545 aa  43.1  0.009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01510  conserved hypothetical protein  25.82 
 
 		 459 aa  43.1  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>