134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0936 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0936  MFS transporter family protein  100 
 
 		 458 aa  915    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1624  major facilitator superfamily MFS_1  65.75 
 
 		 421 aa  552  1e-156  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767884  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1522  major facilitator superfamily MFS_1  60.78 
 
 		 426 aa  526  1e-148  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.101861  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1654  major facilitator transporter  63.82 
 
 		 416 aa  514  1e-144  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1324  MFS transporter family protein  62.07 
 
 		 425 aa  499  1e-140  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1472  major facilitator superfamily MFS_1  61.16 
 
 		 419 aa  491  1e-137  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.905727  normal  0.384031 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1012  major facilitator superfamily MFS_1  57.99 
 
 		 428 aa  484  1e-136  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.389524 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1842  major facilitator superfamily MFS_1  37.92 
 
 		 451 aa  262  1e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0146  major facilitator superfamily MFS_1  35.35 
 
 		 414 aa  249  7e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.243784  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2758  major facilitator transporter  32.33 
 
 		 447 aa  221  3e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2937  major facilitator superfamily transporter  33.03 
 
 		 435 aa  219  6e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1010  major facilitator transporter  33.94 
 
 		 429 aa  218  2e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22460  major facilitator superfamily MFS_1  29.46 
 
 		 421 aa  213  7.999999999999999e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2130  major facilitator family transporter  32.89 
 
 		 435 aa  210  4e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1274  putative integral membrane protein  32.41 
 
 		 430 aa  208  1e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1854  major facilitator superfamily permease/ BtlA-like  34.02 
 
 		 440 aa  206  5e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000121925  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0193  transporter, MFS superfamily  32.67 
 
 		 460 aa  207  5e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0334  hypothetical protein  31.03 
 
 		 424 aa  204  2e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0315  hypothetical protein  30.8 
 
 		 424 aa  204  2e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0083  major facilitator transporter  29.96 
 
 		 462 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.339646  normal  0.26187 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0027  major facilitator superfamily MFS_1  29.58 
 
 		 465 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453112  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0507  hypothetical protein  31.65 
 
 		 427 aa  196  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.130258  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0022  major facilitator transporter  29.39 
 
 		 463 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0458  hypothetical protein  32.27 
 
 		 427 aa  194  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000401747  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2515  major facilitator superfamily MFS_1  31.47 
 
 		 433 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0507  hypothetical protein  31.65 
 
 		 427 aa  193  4e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3661  major facilitator transporter  32.1 
 
 		 426 aa  193  7e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4866  hypothetical protein  31.42 
 
 		 427 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0379  hypothetical protein  32.27 
 
 		 427 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000021693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0370  major facilitator superfamily permease  32.27 
 
 		 427 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.902830000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0367  major facilitator superfamily permease  32.27 
 
 		 427 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000714912  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0393  hypothetical protein  32.27 
 
 		 427 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2044  major facilitator transporter  32.36 
 
 		 436 aa  191  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0220318 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0437  hypothetical protein  32.27 
 
 		 427 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0373  major facilitator transporter  32.04 
 
 		 427 aa  189  7e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000110963  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0192  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 469 aa  189  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0160  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 462 aa  187  3e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1217  major facilitator superfamily MFS_1  33.41 
 
 		 432 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0406  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 404 aa  181  2e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0721  major facilitator transporter  30.15 
 
 		 465 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2251  major facilitator superfamily MFS_1  28.93 
 
 		 439 aa  177  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0379  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 427 aa  177  4e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000550837  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3786  major facilitator superfamily MFS_1  28.94 
 
 		 412 aa  176  6e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2069  major facilitator transporter  31.42 
 
 		 460 aa  175  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.692197  normal  0.259713 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0030  permease  29.19 
 
 		 437 aa  176  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345375  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3264  hypothetical protein  31.9 
 
 		 408 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1429  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 466 aa  172  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218982  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3202  major facilitator superfamily MFS_1  28.84 
 
 		 444 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2301  major facilitator superfamily permease  31.86 
 
 		 453 aa  170  4e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.334509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0322  major facilitator transporter  27.57 
 
 		 467 aa  168  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169916  normal  0.209035 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3164  major facilitator superfamily permease  31.42 
 
 		 453 aa  166  9e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2713  major facilitator superfamily MFS_1  28.67 
 
 		 424 aa  164  3e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1276  hypothetical protein  29.49 
 
 		 431 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.322939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1838  major facilitator superfamily MFS_1  31.17 
 
 		 439 aa  163  6e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.047376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01490  major facilitator superfamily permease  27.42 
 
 		 408 aa  162  1e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0591182  normal  0.340851 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1904  major facilitator superfamily MFS_1  27.63 
 
 		 430 aa  160  4e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0335  major facilitator superfamily MFS_1  29.46 
 
 		 454 aa  158  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.121875 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1090  putative permease  27.67 
 
 		 425 aa  155  2e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0778903  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0297  major facilitator superfamily MFS_1  28.84 
 
 		 441 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.321668  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3450  major facilitator transporter  28.73 
 
 		 436 aa  152  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2972  major facilitator superfamily MFS_1  29.66 
 
 		 442 aa  151  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.737462  normal  0.183542 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0586  major facilitator superfamily MFS_1  26.56 
 
 		 444 aa  150  4e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2003  permease  26.3 
 
 		 435 aa  150  5e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.307053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1893  major facilitator superfamily MFS_1  31.4 
 
 		 458 aa  150  6e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.117856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0343  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 454 aa  148  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.911823 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0387  major facilitator transporter  30.52 
 
 		 437 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0133748  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0657  major facilitator transporter  30.75 
 
 		 449 aa  147  5e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.651323  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3337  major facilitator superfamily (MFS) transporter  26.62 
 
 		 443 aa  147  6e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2014  major facilitator transporter  26.64 
 
 		 426 aa  145  1e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.273868  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4238  major facilitator superfamily MFS_1  24.89 
 
 		 462 aa  144  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.239966 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1317  major facilitator transporter  25.89 
 
 		 474 aa  143  5e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.8065  hitchhiker  0.00000263926 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3421  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 466 aa  142  9e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564111  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1801  major facilitator superfamily protein  27.65 
 
 		 448 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.640412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3914  major facilitator superfamily MFS_1  24.46 
 
 		 462 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.133818 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0568  major facilitator superfamily MFS_1  28.44 
 
 		 468 aa  139  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685546 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2328  major facilitator transporter  27.74 
 
 		 465 aa  139  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1085  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 493 aa  138  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.445039  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1758  putative transporter  28.86 
 
 		 460 aa  137  4e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2277  major facilitator superfamily MFS_1  27.1 
 
 		 469 aa  137  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.419016  normal  0.219783 
 
 
-
 
NC_004310  BR1817  hypothetical protein  25.37 
 
 		 455 aa  135  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404559  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2342  hypothetical protein  29.45 
 
 		 464 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00968844 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1316  major facilitator transporter  25.75 
 
 		 492 aa  134  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.387007  hitchhiker  0.0000142592 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4369  hypothetical protein  25.28 
 
 		 440 aa  134  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.486519  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3188  major facilitator transporter  23.77 
 
 		 463 aa  133  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.988714 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21750  major facilitator superfamily permease  24.72 
 
 		 474 aa  133  7.999999999999999e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.109771  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14630  major facilitator superfamily permease  28.63 
 
 		 462 aa  132  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415319 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2368  major facilitator superfamily MFS_1  25.55 
 
 		 445 aa  132  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.854492  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2485  hypothetical protein  29.23 
 
 		 464 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2708  major facilitator superfamily MFS_1  28.51 
 
 		 450 aa  131  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0342766  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0390  major facilitator superfamily permease  29.38 
 
 		 446 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.778281  normal  0.55351 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0635  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 456 aa  130  7.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.636916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2658  major facilitator transporter  26.53 
 
 		 469 aa  129  8.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.494745  normal  0.637588 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0150  major facilitator transporter  25.55 
 
 		 443 aa  128  2.0000000000000002e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2546  major facilitator transporter  27.55 
 
 		 449 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.146508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2748  major facilitator transporter  24.95 
 
 		 439 aa  128  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437943  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3661  major facilitator superfamily MFS_1  26.78 
 
 		 467 aa  128  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3166  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 		 462 aa  127  6e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.704444  normal  0.18034 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0020  major facilitator transporter  28.48 
 
 		 456 aa  126  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.482167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2662  major facilitator transporter  27.48 
 
 		 460 aa  126  9e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4097  major facilitator superfamily transporter  28.85 
 
 		 443 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>