125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1429 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1429  major facilitator transporter  100 
 
 
466 aa  891    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218982  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0192  major facilitator transporter  60.18 
 
 
469 aa  509  1e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0083  major facilitator transporter  58.73 
 
 
462 aa  502  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.339646  normal  0.26187 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0160  major facilitator transporter  59.64 
 
 
462 aa  499  1e-140  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0022  major facilitator transporter  59.23 
 
 
463 aa  501  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0027  major facilitator superfamily MFS_1  59.19 
 
 
465 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453112  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0322  major facilitator transporter  58.74 
 
 
467 aa  474  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169916  normal  0.209035 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0721  major facilitator transporter  56.83 
 
 
465 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1817  hypothetical protein  45.82 
 
 
455 aa  378  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404559  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3421  major facilitator transporter  49.34 
 
 
466 aa  373  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564111  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4238  major facilitator superfamily MFS_1  43.38 
 
 
462 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.239966 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3337  major facilitator superfamily (MFS) transporter  49.43 
 
 
443 aa  372  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3914  major facilitator superfamily MFS_1  42.92 
 
 
462 aa  368  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.133818 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1085  major facilitator transporter  45.43 
 
 
493 aa  364  2e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.445039  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4369  hypothetical protein  44.21 
 
 
440 aa  361  1e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.486519  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3188  major facilitator transporter  45.94 
 
 
463 aa  359  5e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.988714 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0343  major facilitator transporter  46.24 
 
 
454 aa  356  5e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.911823 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0020  major facilitator transporter  45.11 
 
 
456 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.482167  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2658  major facilitator transporter  44.03 
 
 
469 aa  310  2e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.494745  normal  0.637588 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2937  major facilitator superfamily transporter  38.76 
 
 
435 aa  301  2e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1317  major facilitator transporter  39.3 
 
 
474 aa  296  5e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.8065  hitchhiker  0.00000263926 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2662  major facilitator transporter  41.88 
 
 
460 aa  289  8e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0030  major facilitator transporter  46.47 
 
 
456 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550857  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1362  major facilitator transporter  46.03 
 
 
456 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3661  major facilitator transporter  43.74 
 
 
426 aa  278  1e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1316  major facilitator transporter  38.44 
 
 
492 aa  275  1.0000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.387007  hitchhiker  0.0000142592 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0334  hypothetical protein  37.04 
 
 
424 aa  264  3e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2130  major facilitator family transporter  34.54 
 
 
435 aa  261  2e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0315  hypothetical protein  36.47 
 
 
424 aa  259  6e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0193  transporter, MFS superfamily  34.76 
 
 
460 aa  258  2e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1010  major facilitator transporter  38.86 
 
 
429 aa  257  4e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1842  major facilitator superfamily MFS_1  35.83 
 
 
451 aa  226  9e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1324  MFS transporter family protein  33.86 
 
 
425 aa  211  2e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1654  major facilitator transporter  32.66 
 
 
416 aa  210  5e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1522  major facilitator superfamily MFS_1  31.22 
 
 
426 aa  208  1e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.101861  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1624  major facilitator superfamily MFS_1  32.09 
 
 
421 aa  204  2e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767884  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4202  hypothetical protein  35.12 
 
 
479 aa  202  7e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.246317  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1472  major facilitator superfamily MFS_1  31.21 
 
 
419 aa  190  5.999999999999999e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.905727  normal  0.384031 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3661  major facilitator superfamily MFS_1  33.95 
 
 
467 aa  186  7e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1012  major facilitator superfamily MFS_1  31.81 
 
 
428 aa  184  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.389524 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0568  major facilitator superfamily MFS_1  30.79 
 
 
468 aa  175  9.999999999999999e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00685546 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3166  major facilitator superfamily MFS_1  32.69 
 
 
462 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.704444  normal  0.18034 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3874  major facilitator transporter  32.54 
 
 
467 aa  169  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0574  major facilitator superfamily MFS_1  32.27 
 
 
440 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0936  MFS transporter family protein  28.85 
 
 
458 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0635  major facilitator superfamily MFS_1  31.74 
 
 
456 aa  163  6e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.636916  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2368  major facilitator superfamily MFS_1  29.36 
 
 
445 aa  161  3e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.854492  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1700  major facilitator superfamily MFS_1  30.63 
 
 
472 aa  157  4e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25210  major facilitator superfamily permease  30.97 
 
 
449 aa  155  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.302409  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2069  major facilitator transporter  30.37 
 
 
460 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.692197  normal  0.259713 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18980  major facilitator superfamily permease  31.49 
 
 
440 aa  144  3e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.273601  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0146  major facilitator superfamily MFS_1  27.69 
 
 
414 aa  137  5e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.243784  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0586  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 
444 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22460  major facilitator superfamily MFS_1  26.15 
 
 
421 aa  129  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0297  major facilitator superfamily MFS_1  29.14 
 
 
441 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.321668  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2758  major facilitator transporter  27.16 
 
 
447 aa  125  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1854  major facilitator superfamily permease/ BtlA-like  26.42 
 
 
440 aa  123  8e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000121925  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2546  major facilitator transporter  28.79 
 
 
449 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.146508  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1274  putative integral membrane protein  27.49 
 
 
430 aa  113  7.000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2708  major facilitator superfamily MFS_1  28.14 
 
 
450 aa  113  7.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0342766  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3637  major facilitator transporter  29.45 
 
 
454 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35063  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3710  major facilitator superfamily transporter  29.45 
 
 
454 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.417195  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3642  major facilitator transporter  29.45 
 
 
454 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.266137  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2014  major facilitator transporter  27.23 
 
 
426 aa  111  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.273868  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4097  major facilitator superfamily transporter  28.44 
 
 
443 aa  110  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0406  major facilitator superfamily MFS_1  28.26 
 
 
404 aa  106  9e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0458  hypothetical protein  23.98 
 
 
427 aa  105  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000401747  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0335  major facilitator superfamily MFS_1  27.79 
 
 
454 aa  104  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.121875 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5507  major facilitator superfamily permease/BtlA- like protein  27.09 
 
 
451 aa  103  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.462661  normal  0.0808457 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0507  hypothetical protein  23.53 
 
 
427 aa  102  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.130258  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0373  major facilitator transporter  23.46 
 
 
427 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000110963  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1904  major facilitator superfamily MFS_1  23.18 
 
 
430 aa  102  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0387  major facilitator transporter  28.18 
 
 
437 aa  101  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0133748  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2277  major facilitator superfamily MFS_1  25.68 
 
 
469 aa  100  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.419016  normal  0.219783 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2748  major facilitator transporter  21.47 
 
 
439 aa  100  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437943  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21750  major facilitator superfamily permease  24.95 
 
 
474 aa  100  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.109771  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1893  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 
458 aa  100  6e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.117856  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0507  hypothetical protein  23.42 
 
 
427 aa  100  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0030  permease  22.34 
 
 
437 aa  100  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345375  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0379  hypothetical protein  23.42 
 
 
427 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000021693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0370  major facilitator superfamily permease  23.42 
 
 
427 aa  99  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.902830000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0367  major facilitator superfamily permease  23.42 
 
 
427 aa  99  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000714912  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0393  hypothetical protein  23.42 
 
 
427 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0657  major facilitator transporter  29.58 
 
 
449 aa  99.4  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.651323  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0437  hypothetical protein  23.42 
 
 
427 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0379  major facilitator transporter  23.89 
 
 
427 aa  98.2  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000550837  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2515  major facilitator superfamily MFS_1  23.86 
 
 
433 aa  95.5  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2251  major facilitator superfamily MFS_1  21.29 
 
 
439 aa  94  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1276  hypothetical protein  23.13 
 
 
431 aa  93.2  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.322939  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2044  major facilitator transporter  25.97 
 
 
436 aa  91.7  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0220318 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1090  putative permease  23.98 
 
 
425 aa  91.3  3e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0778903  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3786  major facilitator superfamily MFS_1  25.83 
 
 
412 aa  90.5  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1758  putative transporter  26.67 
 
 
460 aa  90.1  8e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2301  major facilitator superfamily permease  26.14 
 
 
453 aa  90.1  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.334509  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2972  major facilitator superfamily MFS_1  24.39 
 
 
442 aa  89.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.737462  normal  0.183542 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3450  major facilitator transporter  23.85 
 
 
436 aa  89  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01490  major facilitator superfamily permease  23.98 
 
 
408 aa  88.2  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0591182  normal  0.340851 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2003  permease  22.61 
 
 
435 aa  87.8  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.307053  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5316  major facilitator superfamily MFS_1  24.24 
 
 
572 aa  87.4  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2713  major facilitator superfamily MFS_1  23.67 
 
 
424 aa  85.9  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>