146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1522 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1522  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 426 aa  845    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.101861  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1624  major facilitator superfamily MFS_1  77.51 
 
 		 421 aa  621  1e-177  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767884  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1324  MFS transporter family protein  74.39 
 
 		 425 aa  601  1.0000000000000001e-171  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1654  major facilitator transporter  74.82 
 
 		 416 aa  596  1e-169  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1012  major facilitator superfamily MFS_1  70.34 
 
 		 428 aa  565  1e-160  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.389524 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1472  major facilitator superfamily MFS_1  70 
 
 		 419 aa  554  1e-156  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.905727  normal  0.384031 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0936  MFS transporter family protein  60.78 
 
 		 458 aa  513  1e-144  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1842  major facilitator superfamily MFS_1  38.12 
 
 		 451 aa  256  7e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0146  major facilitator superfamily MFS_1  35.78 
 
 		 414 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.243784  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1010  major facilitator transporter  35.42 
 
 		 429 aa  237  3e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2937  major facilitator superfamily transporter  33.81 
 
 		 435 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0334  hypothetical protein  33.65 
 
 		 424 aa  233  6e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22460  major facilitator superfamily MFS_1  33.09 
 
 		 421 aa  230  3e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0315  hypothetical protein  33.33 
 
 		 424 aa  227  3e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2130  major facilitator family transporter  33.89 
 
 		 435 aa  219  8.999999999999998e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3661  major facilitator transporter  33.82 
 
 		 426 aa  216  5e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0022  major facilitator transporter  31.78 
 
 		 463 aa  216  8e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0193  transporter, MFS superfamily  33.89 
 
 		 460 aa  215  9.999999999999999e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0192  major facilitator transporter  31.33 
 
 		 469 aa  212  9e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1854  major facilitator superfamily permease/ BtlA-like  34.35 
 
 		 440 aa  210  3e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000121925  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2251  major facilitator superfamily MFS_1  30.48 
 
 		 439 aa  210  4e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1429  major facilitator transporter  31.22 
 
 		 466 aa  208  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0160  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 462 aa  208  2e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2758  major facilitator transporter  32.2 
 
 		 447 aa  207  2e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2069  major facilitator transporter  33.51 
 
 		 460 aa  207  2e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.692197  normal  0.259713 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1274  putative integral membrane protein  32.61 
 
 		 430 aa  206  5e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0083  major facilitator transporter  30.89 
 
 		 462 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.339646  normal  0.26187 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0030  permease  30.48 
 
 		 437 aa  204  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345375  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0027  major facilitator superfamily MFS_1  31.6 
 
 		 465 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453112  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0297  major facilitator superfamily MFS_1  33.17 
 
 		 441 aa  193  4e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.321668  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0379  major facilitator transporter  31.73 
 
 		 427 aa  193  5e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000550837  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0458  hypothetical protein  31.79 
 
 		 427 aa  192  7e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000401747  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0507  hypothetical protein  31.68 
 
 		 427 aa  192  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.130258  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0373  major facilitator transporter  31.79 
 
 		 427 aa  191  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000110963  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0507  hypothetical protein  31.68 
 
 		 427 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4866  hypothetical protein  31.52 
 
 		 427 aa  190  4e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0379  hypothetical protein  31.68 
 
 		 427 aa  190  5e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000021693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0370  major facilitator superfamily permease  31.68 
 
 		 427 aa  190  5e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.902830000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0367  major facilitator superfamily permease  31.68 
 
 		 427 aa  190  5e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000714912  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0393  hypothetical protein  31.68 
 
 		 427 aa  190  5e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0437  hypothetical protein  31.68 
 
 		 427 aa  190  5e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0721  major facilitator transporter  29.75 
 
 		 465 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2515  major facilitator superfamily MFS_1  31.7 
 
 		 433 aa  187  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0322  major facilitator transporter  30.22 
 
 		 467 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169916  normal  0.209035 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3202  major facilitator superfamily MFS_1  32.32 
 
 		 444 aa  182  7e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1217  major facilitator superfamily MFS_1  34.55 
 
 		 432 aa  181  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2044  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 436 aa  181  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0220318 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2713  major facilitator superfamily MFS_1  30.43 
 
 		 424 aa  179  8e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2014  major facilitator transporter  29.83 
 
 		 426 aa  179  1e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.273868  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3337  major facilitator superfamily (MFS) transporter  29.56 
 
 		 443 aa  178  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3450  major facilitator transporter  29.68 
 
 		 436 aa  177  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4238  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 		 462 aa  178  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.239966 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3914  major facilitator superfamily MFS_1  28.09 
 
 		 462 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.133818 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0586  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 		 444 aa  177  3e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3164  major facilitator superfamily permease  31.49 
 
 		 453 aa  177  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3421  major facilitator transporter  28.98 
 
 		 466 aa  175  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564111  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2301  major facilitator superfamily permease  31.55 
 
 		 453 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.334509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1838  major facilitator superfamily MFS_1  31.89 
 
 		 439 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.047376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3786  major facilitator superfamily MFS_1  29.75 
 
 		 412 aa  172  9e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0343  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 454 aa  171  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.911823 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0406  major facilitator superfamily MFS_1  29.31 
 
 		 404 aa  170  5e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0335  major facilitator superfamily MFS_1  30.38 
 
 		 454 aa  169  7e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.121875 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1276  hypothetical protein  28.94 
 
 		 431 aa  168  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.322939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01490  major facilitator superfamily permease  27.8 
 
 		 408 aa  168  2e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0591182  normal  0.340851 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1090  putative permease  29.89 
 
 		 425 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0778903  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3874  major facilitator transporter  32.2 
 
 		 467 aa  167  5e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1904  major facilitator superfamily MFS_1  28.37 
 
 		 430 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1758  putative transporter  32.38 
 
 		 460 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1817  hypothetical protein  27.64 
 
 		 455 aa  164  4.0000000000000004e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404559  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1801  major facilitator superfamily protein  30.3 
 
 		 448 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.640412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4369  hypothetical protein  27.97 
 
 		 440 aa  162  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.486519  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3661  major facilitator superfamily MFS_1  30.54 
 
 		 467 aa  161  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2277  major facilitator superfamily MFS_1  29 
 
 		 469 aa  159  7e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.419016  normal  0.219783 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2328  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 465 aa  159  8e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1317  major facilitator transporter  28.44 
 
 		 474 aa  159  9e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.8065  hitchhiker  0.00000263926 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1893  major facilitator superfamily MFS_1  30.43 
 
 		 458 aa  159  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.117856  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3264  hypothetical protein  30 
 
 		 408 aa  158  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1316  major facilitator transporter  28.51 
 
 		 492 aa  157  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.387007  hitchhiker  0.0000142592 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0387  major facilitator transporter  32.12 
 
 		 437 aa  157  4e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0133748  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2972  major facilitator superfamily MFS_1  30.68 
 
 		 442 aa  155  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.737462  normal  0.183542 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1085  major facilitator transporter  27.46 
 
 		 493 aa  154  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.445039  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2658  major facilitator transporter  28.51 
 
 		 469 aa  154  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.494745  normal  0.637588 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0657  major facilitator transporter  31.16 
 
 		 449 aa  152  8e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.651323  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3188  major facilitator transporter  27.29 
 
 		 463 aa  152  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.988714 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0574  major facilitator superfamily MFS_1  28.18 
 
 		 440 aa  149  9e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2003  permease  26.3 
 
 		 435 aa  147  5e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.307053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21750  major facilitator superfamily permease  26.43 
 
 		 474 aa  146  8.000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.109771  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2708  major facilitator superfamily MFS_1  29.12 
 
 		 450 aa  146  9e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0342766  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2748  major facilitator transporter  24.82 
 
 		 439 aa  146  9e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437943  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0150  major facilitator transporter  25.12 
 
 		 443 aa  145  9e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1720  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 454 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.493867 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0390  major facilitator superfamily permease  29.91 
 
 		 446 aa  144  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.778281  normal  0.55351 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2368  major facilitator superfamily MFS_1  28.37 
 
 		 445 aa  142  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.854492  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5507  major facilitator superfamily permease/BtlA- like protein  28.41 
 
 		 451 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.462661  normal  0.0808457 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0635  major facilitator superfamily MFS_1  29.55 
 
 		 456 aa  140  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.636916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2485  hypothetical protein  28.77 
 
 		 464 aa  138  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2342  hypothetical protein  27.91 
 
 		 464 aa  137  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00968844 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2662  major facilitator transporter  26.44 
 
 		 460 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0020  major facilitator transporter  29 
 
 		 456 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.482167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2546  major facilitator transporter  26.17 
 
 		 449 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.146508  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>