125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2044 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2044  major facilitator transporter  100 
 
 		 436 aa  863    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0220318 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2515  major facilitator superfamily MFS_1  72.87 
 
 		 433 aa  582  1.0000000000000001e-165  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2758  major facilitator transporter  55.32 
 
 		 447 aa  482  1e-135  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1274  putative integral membrane protein  56.16 
 
 		 430 aa  433  1e-120  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0146  major facilitator superfamily MFS_1  38.85 
 
 		 414 aa  257  3e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.243784  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1842  major facilitator superfamily MFS_1  37.59 
 
 		 451 aa  234  3e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0297  major facilitator superfamily MFS_1  36.84 
 
 		 441 aa  233  7.000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.321668  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2069  major facilitator transporter  34.61 
 
 		 460 aa  216  5.9999999999999996e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.692197  normal  0.259713 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1472  major facilitator superfamily MFS_1  33.02 
 
 		 419 aa  216  9e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.905727  normal  0.384031 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2014  major facilitator transporter  35.53 
 
 		 426 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.273868  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1012  major facilitator superfamily MFS_1  34.91 
 
 		 428 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.389524 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0936  MFS transporter family protein  32.36 
 
 		 458 aa  210  5e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1624  major facilitator superfamily MFS_1  31.22 
 
 		 421 aa  206  9e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767884  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1522  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 		 426 aa  205  2e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.101861  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1324  MFS transporter family protein  31.16 
 
 		 425 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0586  major facilitator superfamily MFS_1  31.86 
 
 		 444 aa  192  8e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1654  major facilitator transporter  29.16 
 
 		 416 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1854  major facilitator superfamily permease/ BtlA-like  31.78 
 
 		 440 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000121925  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2937  major facilitator superfamily transporter  29.93 
 
 		 435 aa  176  8e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0334  hypothetical protein  30.7 
 
 		 424 aa  166  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0315  hypothetical protein  30.35 
 
 		 424 aa  164  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22460  major facilitator superfamily MFS_1  27.55 
 
 		 421 aa  158  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2130  major facilitator family transporter  28.74 
 
 		 435 aa  154  2.9999999999999998e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3661  major facilitator transporter  31.08 
 
 		 426 aa  152  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0193  transporter, MFS superfamily  27.79 
 
 		 460 aa  150  6e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1010  major facilitator transporter  29.36 
 
 		 429 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2328  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 465 aa  146  6e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2708  major facilitator superfamily MFS_1  29.53 
 
 		 450 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0342766  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2277  major facilitator superfamily MFS_1  29.5 
 
 		 469 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.419016  normal  0.219783 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1904  major facilitator superfamily MFS_1  26.56 
 
 		 430 aa  141  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3421  major facilitator transporter  28.17 
 
 		 466 aa  133  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564111  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2301  major facilitator superfamily permease  27.7 
 
 		 453 aa  133  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.334509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1758  putative transporter  27.42 
 
 		 460 aa  133  6.999999999999999e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0335  major facilitator superfamily MFS_1  29.02 
 
 		 454 aa  133  7.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.121875 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0022  major facilitator transporter  27.48 
 
 		 463 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3164  major facilitator superfamily permease  27 
 
 		 453 aa  127  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21750  major facilitator superfamily permease  27.25 
 
 		 474 aa  127  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.109771  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0192  major facilitator transporter  25.97 
 
 		 469 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1720  major facilitator transporter  31.5 
 
 		 454 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.493867 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0343  major facilitator transporter  26.4 
 
 		 454 aa  122  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.911823 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2003  permease  23 
 
 		 435 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.307053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0390  major facilitator superfamily permease  28.73 
 
 		 446 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.778281  normal  0.55351 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1801  major facilitator superfamily protein  27.42 
 
 		 448 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.640412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2713  major facilitator superfamily MFS_1  28.33 
 
 		 424 aa  120  3.9999999999999996e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3202  major facilitator superfamily MFS_1  27.35 
 
 		 444 aa  120  6e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0030  permease  24.54 
 
 		 437 aa  120  7e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345375  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3264  hypothetical protein  26.15 
 
 		 408 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2972  major facilitator superfamily MFS_1  28.31 
 
 		 442 aa  117  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.737462  normal  0.183542 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01490  major facilitator superfamily permease  25.85 
 
 		 408 aa  115  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0591182  normal  0.340851 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3166  major facilitator superfamily MFS_1  27.63 
 
 		 462 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.704444  normal  0.18034 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2251  major facilitator superfamily MFS_1  23.79 
 
 		 439 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0027  major facilitator superfamily MFS_1  25.89 
 
 		 465 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453112  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0160  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 462 aa  113  5e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0373  major facilitator transporter  26.13 
 
 		 427 aa  113  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000110963  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3786  major facilitator superfamily MFS_1  27.79 
 
 		 412 aa  113  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0458  hypothetical protein  26.13 
 
 		 427 aa  113  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000401747  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1276  hypothetical protein  25.35 
 
 		 431 aa  113  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.322939  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0507  hypothetical protein  26.13 
 
 		 427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.130258  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0083  major facilitator transporter  25.51 
 
 		 462 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.339646  normal  0.26187 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1429  major facilitator transporter  27.37 
 
 		 466 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218982  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4238  major facilitator superfamily MFS_1  23.99 
 
 		 462 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.239966 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1838  major facilitator superfamily MFS_1  25.8 
 
 		 439 aa  111  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.047376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0322  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 467 aa  110  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169916  normal  0.209035 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14630  major facilitator superfamily permease  28.18 
 
 		 462 aa  110  7.000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415319 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2342  hypothetical protein  28.92 
 
 		 464 aa  109  8.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00968844 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3914  major facilitator superfamily MFS_1  23.6 
 
 		 462 aa  109  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.133818 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1217  major facilitator superfamily MFS_1  26.78 
 
 		 432 aa  108  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2485  hypothetical protein  28.54 
 
 		 464 aa  108  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1893  major facilitator superfamily MFS_1  28.29 
 
 		 458 aa  107  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.117856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0507  hypothetical protein  26.13 
 
 		 427 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0379  hypothetical protein  26.13 
 
 		 427 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000021693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0370  major facilitator superfamily permease  26.13 
 
 		 427 aa  107  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.902830000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0367  major facilitator superfamily permease  26.13 
 
 		 427 aa  107  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000714912  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0393  hypothetical protein  26.13 
 
 		 427 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0437  hypothetical protein  26.13 
 
 		 427 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2368  major facilitator superfamily MFS_1  23.79 
 
 		 445 aa  107  5e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.854492  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0379  major facilitator transporter  25 
 
 		 427 aa  105  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000550837  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4866  hypothetical protein  25.89 
 
 		 427 aa  104  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0657  major facilitator transporter  30.26 
 
 		 449 aa  104  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.651323  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3411  major facilitator superfamily MFS_1  29.04 
 
 		 469 aa  104  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0406  major facilitator superfamily MFS_1  23.51 
 
 		 404 aa  102  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0721  major facilitator transporter  26.5 
 
 		 465 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25210  major facilitator superfamily permease  25.17 
 
 		 449 aa  101  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.302409  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0568  major facilitator superfamily MFS_1  24.65 
 
 		 468 aa  100  4e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685546 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0635  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 		 456 aa  100  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.636916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3337  major facilitator superfamily (MFS) transporter  27.09 
 
 		 443 aa  99  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0574  major facilitator superfamily MFS_1  25.66 
 
 		 440 aa  97.4  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5507  major facilitator superfamily permease/BtlA- like protein  27.4 
 
 		 451 aa  96.3  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.462661  normal  0.0808457 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2546  major facilitator transporter  26.85 
 
 		 449 aa  96.3  9e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.146508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3450  major facilitator transporter  25.77 
 
 		 436 aa  95.5  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4369  hypothetical protein  24.82 
 
 		 440 aa  95.5  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.486519  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18980  major facilitator superfamily permease  25.69 
 
 		 440 aa  94  5e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.273601  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3874  major facilitator transporter  26.14 
 
 		 467 aa  93.2  7e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3661  major facilitator superfamily MFS_1  25.89 
 
 		 467 aa  92.8  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1700  major facilitator superfamily MFS_1  25.17 
 
 		 472 aa  91.3  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4097  major facilitator superfamily transporter  26.26 
 
 		 443 aa  90.5  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2670  major facilitator transporter  28.76 
 
 		 458 aa  89.4  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.88531  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1090  putative permease  23.81 
 
 		 425 aa  89  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0778903  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1085  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 493 aa  87  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.445039  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1817  hypothetical protein  25.29 
 
 		 455 aa  86.3  9e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>