128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1010 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1010  major facilitator transporter  100 
 
 		 429 aa  846    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2937  major facilitator superfamily transporter  62.7 
 
 		 435 aa  519  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2130  major facilitator family transporter  49.52 
 
 		 435 aa  414  1e-114  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0193  transporter, MFS superfamily  49.28 
 
 		 460 aa  410  1e-113  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3661  major facilitator transporter  50 
 
 		 426 aa  377  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0334  hypothetical protein  46 
 
 		 424 aa  359  4e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0315  hypothetical protein  45.89 
 
 		 424 aa  360  4e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1842  major facilitator superfamily MFS_1  47.14 
 
 		 451 aa  333  5e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0022  major facilitator transporter  41.18 
 
 		 463 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0192  major facilitator transporter  41.89 
 
 		 469 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0027  major facilitator superfamily MFS_1  40.95 
 
 		 465 aa  309  5e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453112  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0160  major facilitator transporter  41.44 
 
 		 462 aa  309  5.9999999999999995e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0083  major facilitator transporter  40.5 
 
 		 462 aa  302  7.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.339646  normal  0.26187 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0721  major facilitator transporter  38.61 
 
 		 465 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4238  major facilitator superfamily MFS_1  37.17 
 
 		 462 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.239966 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1429  major facilitator transporter  39 
 
 		 466 aa  280  3e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3914  major facilitator superfamily MFS_1  36.95 
 
 		 462 aa  280  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.133818 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0322  major facilitator transporter  40 
 
 		 467 aa  278  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169916  normal  0.209035 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4369  hypothetical protein  41.08 
 
 		 440 aa  275  1.0000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.486519  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1817  hypothetical protein  37.39 
 
 		 455 aa  270  5e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404559  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1085  major facilitator transporter  37.36 
 
 		 493 aa  260  3e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.445039  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3661  major facilitator superfamily MFS_1  37.76 
 
 		 467 aa  260  3e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1317  major facilitator transporter  34.21 
 
 		 474 aa  256  5e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.8065  hitchhiker  0.00000263926 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1522  major facilitator superfamily MFS_1  35.34 
 
 		 426 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.101861  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1316  major facilitator transporter  38.28 
 
 		 492 aa  254  2.0000000000000002e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.387007  hitchhiker  0.0000142592 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3188  major facilitator transporter  38.05 
 
 		 463 aa  249  5e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.988714 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3874  major facilitator transporter  38.67 
 
 		 467 aa  248  1e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1472  major facilitator superfamily MFS_1  35.58 
 
 		 419 aa  247  2e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.905727  normal  0.384031 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3337  major facilitator superfamily (MFS) transporter  35.57 
 
 		 443 aa  245  9.999999999999999e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2368  major facilitator superfamily MFS_1  35.33 
 
 		 445 aa  244  1.9999999999999999e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.854492  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0635  major facilitator superfamily MFS_1  35.87 
 
 		 456 aa  242  1e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.636916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1012  major facilitator superfamily MFS_1  36.24 
 
 		 428 aa  238  1e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.389524 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1624  major facilitator superfamily MFS_1  34.42 
 
 		 421 aa  238  1e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767884  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3421  major facilitator transporter  38.04 
 
 		 466 aa  238  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564111  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1654  major facilitator transporter  35.75 
 
 		 416 aa  237  2e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0574  major facilitator superfamily MFS_1  36.48 
 
 		 440 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1324  MFS transporter family protein  34.22 
 
 		 425 aa  234  3e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0936  MFS transporter family protein  34.17 
 
 		 458 aa  226  6e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0568  major facilitator superfamily MFS_1  35.24 
 
 		 468 aa  222  9.999999999999999e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685546 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0343  major facilitator transporter  33.48 
 
 		 454 aa  221  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.911823 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3166  major facilitator superfamily MFS_1  35.48 
 
 		 462 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.704444  normal  0.18034 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25210  major facilitator superfamily permease  32.48 
 
 		 449 aa  217  2.9999999999999998e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.302409  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2658  major facilitator transporter  35.18 
 
 		 469 aa  216  8e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.494745  normal  0.637588 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18980  major facilitator superfamily permease  32.4 
 
 		 440 aa  214  1.9999999999999998e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.273601  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2546  major facilitator transporter  32.85 
 
 		 449 aa  212  9e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.146508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2662  major facilitator transporter  33.48 
 
 		 460 aa  208  1e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1700  major facilitator superfamily MFS_1  31.46 
 
 		 472 aa  202  9.999999999999999e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2758  major facilitator transporter  29.14 
 
 		 447 aa  191  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3637  major facilitator transporter  32.63 
 
 		 454 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35063  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3710  major facilitator superfamily transporter  32.63 
 
 		 454 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.417195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3642  major facilitator transporter  32.63 
 
 		 454 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.266137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0020  major facilitator transporter  36.47 
 
 		 456 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.482167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4097  major facilitator superfamily transporter  31.44 
 
 		 443 aa  187  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22460  major facilitator superfamily MFS_1  32 
 
 		 421 aa  180  4.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12530  leucine and alanine rich integral membrane protein  30.41 
 
 		 445 aa  179  8e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0104482 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4202  hypothetical protein  31.35 
 
 		 479 aa  179  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.246317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1274  putative integral membrane protein  32.48 
 
 		 430 aa  168  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0030  major facilitator transporter  33.88 
 
 		 456 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1362  major facilitator transporter  33.64 
 
 		 456 aa  159  7e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1854  major facilitator superfamily permease/ BtlA-like  30.3 
 
 		 440 aa  158  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000121925  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0146  major facilitator superfamily MFS_1  27.68 
 
 		 414 aa  154  4e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.243784  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0458  hypothetical protein  28.88 
 
 		 427 aa  153  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000401747  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3786  major facilitator superfamily MFS_1  29.12 
 
 		 412 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0507  hypothetical protein  29.3 
 
 		 427 aa  152  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.130258  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0297  major facilitator superfamily MFS_1  30.1 
 
 		 441 aa  152  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.321668  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0507  hypothetical protein  29.02 
 
 		 427 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0373  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 427 aa  149  7e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000110963  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3202  major facilitator superfamily MFS_1  27 
 
 		 444 aa  149  7e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0379  hypothetical protein  29.06 
 
 		 427 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000021693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0370  major facilitator superfamily permease  29.06 
 
 		 427 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.902830000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0367  major facilitator superfamily permease  29.06 
 
 		 427 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000714912  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0393  hypothetical protein  29.06 
 
 		 427 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0437  hypothetical protein  29.06 
 
 		 427 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3164  major facilitator superfamily permease  29.41 
 
 		 453 aa  147  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3450  major facilitator transporter  28.47 
 
 		 436 aa  145  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4866  hypothetical protein  28.78 
 
 		 427 aa  145  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2515  major facilitator superfamily MFS_1  29.57 
 
 		 433 aa  145  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0379  major facilitator transporter  30.49 
 
 		 427 aa  144  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000550837  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2251  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 		 439 aa  143  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01490  major facilitator superfamily permease  26.82 
 
 		 408 aa  143  8e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0591182  normal  0.340851 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2044  major facilitator transporter  29.36 
 
 		 436 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0220318 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0030  permease  25.41 
 
 		 437 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345375  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2301  major facilitator superfamily permease  29.26 
 
 		 453 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.334509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2069  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 460 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.692197  normal  0.259713 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1838  major facilitator superfamily MFS_1  30.73 
 
 		 439 aa  136  7.000000000000001e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.047376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1276  hypothetical protein  27.88 
 
 		 431 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.322939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2014  major facilitator transporter  25.94 
 
 		 426 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.273868  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0387  major facilitator transporter  29.59 
 
 		 437 aa  127  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0133748  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2972  major facilitator superfamily MFS_1  27.64 
 
 		 442 aa  126  9e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.737462  normal  0.183542 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0586  major facilitator superfamily MFS_1  26.29 
 
 		 444 aa  125  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1801  major facilitator superfamily protein  27.57 
 
 		 448 aa  124  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.640412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5507  major facilitator superfamily permease/BtlA- like protein  27.99 
 
 		 451 aa  124  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.462661  normal  0.0808457 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2708  major facilitator superfamily MFS_1  29.28 
 
 		 450 aa  122  9e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0342766  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2713  major facilitator superfamily MFS_1  25.61 
 
 		 424 aa  122  9e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0335  major facilitator superfamily MFS_1  30.24 
 
 		 454 aa  122  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.121875 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2003  permease  25.47 
 
 		 435 aa  121  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.307053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1217  major facilitator superfamily MFS_1  27.98 
 
 		 432 aa  121  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1090  putative permease  26.81 
 
 		 425 aa  121  3e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0778903  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0390  major facilitator superfamily permease  27.36 
 
 		 446 aa  119  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.778281  normal  0.55351 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1758  putative transporter  26.78 
 
 		 460 aa  116  8.999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>