121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3188 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3188  major facilitator transporter  100 
 
 		 463 aa  902    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.988714 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4238  major facilitator superfamily MFS_1  69.69 
 
 		 462 aa  635    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.239966 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3914  major facilitator superfamily MFS_1  68.58 
 
 		 462 aa  627  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.133818 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4369  hypothetical protein  69.48 
 
 		 440 aa  598  1e-170  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.486519  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1817  hypothetical protein  59.69 
 
 		 455 aa  556  1e-157  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404559  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1085  major facilitator transporter  60.31 
 
 		 493 aa  547  1e-154  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.445039  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0083  major facilitator transporter  47.74 
 
 		 462 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.339646  normal  0.26187 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0192  major facilitator transporter  47.47 
 
 		 469 aa  396  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0721  major facilitator transporter  46.67 
 
 		 465 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1429  major facilitator transporter  47.39 
 
 		 466 aa  389  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0027  major facilitator superfamily MFS_1  46.58 
 
 		 465 aa  388  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453112  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0160  major facilitator transporter  46.15 
 
 		 462 aa  387  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0022  major facilitator transporter  46.71 
 
 		 463 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0322  major facilitator transporter  45.41 
 
 		 467 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169916  normal  0.209035 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3421  major facilitator transporter  41.39 
 
 		 466 aa  310  4e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564111  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1317  major facilitator transporter  38.08 
 
 		 474 aa  291  2e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.8065  hitchhiker  0.00000263926 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0343  major facilitator transporter  36.04 
 
 		 454 aa  280  5e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.911823 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3337  major facilitator superfamily (MFS) transporter  36.45 
 
 		 443 aa  279  9e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2937  major facilitator superfamily transporter  37.05 
 
 		 435 aa  277  2e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0315  hypothetical protein  38 
 
 		 424 aa  273  6e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1316  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 492 aa  271  2e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.387007  hitchhiker  0.0000142592 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2130  major facilitator family transporter  36.2 
 
 		 435 aa  270  4e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0193  transporter, MFS superfamily  35.98 
 
 		 460 aa  267  2.9999999999999995e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0334  hypothetical protein  36.22 
 
 		 424 aa  262  1e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1010  major facilitator transporter  38.75 
 
 		 429 aa  259  6e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3661  major facilitator transporter  38.24 
 
 		 426 aa  246  6e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2658  major facilitator transporter  36.17 
 
 		 469 aa  243  3.9999999999999997e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.494745  normal  0.637588 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0020  major facilitator transporter  37.69 
 
 		 456 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.482167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2662  major facilitator transporter  34.84 
 
 		 460 aa  238  1e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0030  major facilitator transporter  36.59 
 
 		 456 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4202  hypothetical protein  35.6 
 
 		 479 aa  214  3.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.246317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1362  major facilitator transporter  35.97 
 
 		 456 aa  213  7e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1842  major facilitator superfamily MFS_1  34.35 
 
 		 451 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3661  major facilitator superfamily MFS_1  31.4 
 
 		 467 aa  191  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3166  major facilitator superfamily MFS_1  31.21 
 
 		 462 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.704444  normal  0.18034 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3874  major facilitator transporter  33.09 
 
 		 467 aa  181  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1522  major facilitator superfamily MFS_1  27.93 
 
 		 426 aa  180  4e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.101861  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1700  major facilitator superfamily MFS_1  30.45 
 
 		 472 aa  177  4e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0568  major facilitator superfamily MFS_1  29.69 
 
 		 468 aa  171  3e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685546 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0635  major facilitator superfamily MFS_1  30.32 
 
 		 456 aa  169  7e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.636916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1012  major facilitator superfamily MFS_1  27.58 
 
 		 428 aa  166  8e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.389524 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18980  major facilitator superfamily permease  30.46 
 
 		 440 aa  166  9e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.273601  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1654  major facilitator transporter  26.8 
 
 		 416 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1624  major facilitator superfamily MFS_1  27.15 
 
 		 421 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767884  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1472  major facilitator superfamily MFS_1  27.09 
 
 		 419 aa  159  1e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.905727  normal  0.384031 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2368  major facilitator superfamily MFS_1  29.65 
 
 		 445 aa  158  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.854492  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1324  MFS transporter family protein  27.03 
 
 		 425 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25210  major facilitator superfamily permease  29.57 
 
 		 449 aa  155  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.302409  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0574  major facilitator superfamily MFS_1  29.6 
 
 		 440 aa  150  4e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0936  MFS transporter family protein  24.53 
 
 		 458 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1854  major facilitator superfamily permease/ BtlA-like  25.5 
 
 		 440 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000121925  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1090  putative permease  28.71 
 
 		 425 aa  129  9.000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0778903  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0030  permease  26.05 
 
 		 437 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345375  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22460  major facilitator superfamily MFS_1  26.49 
 
 		 421 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2546  major facilitator transporter  27.71 
 
 		 449 aa  124  5e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.146508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5507  major facilitator superfamily permease/BtlA- like protein  26.5 
 
 		 451 aa  121  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.462661  normal  0.0808457 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2708  major facilitator superfamily MFS_1  28.7 
 
 		 450 aa  121  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0342766  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0146  major facilitator superfamily MFS_1  24.72 
 
 		 414 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.243784  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1758  putative transporter  27.97 
 
 		 460 aa  119  9e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1893  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 		 458 aa  118  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.117856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4097  major facilitator superfamily transporter  28.41 
 
 		 443 aa  117  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0379  hypothetical protein  26.07 
 
 		 427 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000021693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0370  major facilitator superfamily permease  26.07 
 
 		 427 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.902830000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0367  major facilitator superfamily permease  26.07 
 
 		 427 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000714912  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0393  hypothetical protein  26.07 
 
 		 427 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4866  hypothetical protein  26.07 
 
 		 427 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0437  hypothetical protein  26.07 
 
 		 427 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0373  major facilitator transporter  26.12 
 
 		 427 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000110963  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3637  major facilitator transporter  28.17 
 
 		 454 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35063  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3710  major facilitator superfamily transporter  28.17 
 
 		 454 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.417195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3642  major facilitator transporter  28.17 
 
 		 454 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.266137  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2277  major facilitator superfamily MFS_1  26.2 
 
 		 469 aa  114  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.419016  normal  0.219783 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0379  major facilitator transporter  24.89 
 
 		 427 aa  114  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000550837  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0458  hypothetical protein  26.28 
 
 		 427 aa  114  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000401747  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0507  hypothetical protein  25.67 
 
 		 427 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0507  hypothetical protein  25.67 
 
 		 427 aa  113  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.130258  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2301  major facilitator superfamily permease  27.51 
 
 		 453 aa  110  8.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.334509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14630  major facilitator superfamily permease  26.04 
 
 		 462 aa  109  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415319 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2251  major facilitator superfamily MFS_1  21.61 
 
 		 439 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01490  major facilitator superfamily permease  23.17 
 
 		 408 aa  108  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0591182  normal  0.340851 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2069  major facilitator transporter  24.27 
 
 		 460 aa  107  7e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.692197  normal  0.259713 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5316  major facilitator superfamily MFS_1  24.63 
 
 		 572 aa  106  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2972  major facilitator superfamily MFS_1  25.88 
 
 		 442 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.737462  normal  0.183542 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3164  major facilitator superfamily permease  26.87 
 
 		 453 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263181  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1801  major facilitator superfamily protein  26.28 
 
 		 448 aa  105  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.640412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2328  major facilitator transporter  25.05 
 
 		 465 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3786  major facilitator superfamily MFS_1  24.83 
 
 		 412 aa  105  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21750  major facilitator superfamily permease  23.86 
 
 		 474 aa  105  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.109771  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1274  putative integral membrane protein  23.37 
 
 		 430 aa  102  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0390  major facilitator superfamily permease  26.15 
 
 		 446 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.778281  normal  0.55351 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3202  major facilitator superfamily MFS_1  23.8 
 
 		 444 aa  101  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1276  hypothetical protein  25.93 
 
 		 431 aa  99  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.322939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2758  major facilitator transporter  24.13 
 
 		 447 aa  98.6  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1904  major facilitator superfamily MFS_1  22.58 
 
 		 430 aa  98.6  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2003  permease  23.68 
 
 		 435 aa  97.4  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.307053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2713  major facilitator superfamily MFS_1  24.04 
 
 		 424 aa  96.3  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12530  leucine and alanine rich integral membrane protein  25.39 
 
 		 445 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0104482 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0586  major facilitator superfamily MFS_1  24.03 
 
 		 444 aa  95.5  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0297  major facilitator superfamily MFS_1  23.77 
 
 		 441 aa  95.1  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.321668  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3450  major facilitator transporter  23.2 
 
 		 436 aa  94  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>