142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2937 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2937  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 
435 aa  860    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1010  major facilitator transporter  62.7 
 
 
429 aa  477  1e-133  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2130  major facilitator family transporter  50.72 
 
 
435 aa  413  1e-114  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0193  transporter, MFS superfamily  50.24 
 
 
460 aa  406  1.0000000000000001e-112  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3661  major facilitator transporter  50.49 
 
 
426 aa  378  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0334  hypothetical protein  42.07 
 
 
424 aa  340  2.9999999999999998e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1842  major facilitator superfamily MFS_1  47.16 
 
 
451 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0315  hypothetical protein  41.63 
 
 
424 aa  337  2.9999999999999997e-91  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0022  major facilitator transporter  40.77 
 
 
463 aa  306  7e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0160  major facilitator transporter  40.44 
 
 
462 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0083  major facilitator transporter  39.16 
 
 
462 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.339646  normal  0.26187 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0192  major facilitator transporter  40.44 
 
 
469 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1429  major facilitator transporter  38.76 
 
 
466 aa  301  2e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218982  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0027  major facilitator superfamily MFS_1  38.74 
 
 
465 aa  293  5e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453112  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3914  major facilitator superfamily MFS_1  37.72 
 
 
462 aa  292  7e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.133818 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4238  major facilitator superfamily MFS_1  36.38 
 
 
462 aa  292  8e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.239966 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0322  major facilitator transporter  41.07 
 
 
467 aa  291  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169916  normal  0.209035 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0721  major facilitator transporter  37.01 
 
 
465 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1817  hypothetical protein  36.2 
 
 
455 aa  276  6e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404559  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4369  hypothetical protein  38.01 
 
 
440 aa  270  2.9999999999999997e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.486519  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1085  major facilitator transporter  35.44 
 
 
493 aa  256  7e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.445039  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0568  major facilitator superfamily MFS_1  38.21 
 
 
468 aa  252  9.000000000000001e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00685546 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1316  major facilitator transporter  37.34 
 
 
492 aa  252  1e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.387007  hitchhiker  0.0000142592 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1317  major facilitator transporter  34.14 
 
 
474 aa  251  1e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.8065  hitchhiker  0.00000263926 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3421  major facilitator transporter  35.04 
 
 
466 aa  250  3e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564111  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0635  major facilitator superfamily MFS_1  39.26 
 
 
456 aa  246  4e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.636916  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3188  major facilitator transporter  35.71 
 
 
463 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.988714 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2368  major facilitator superfamily MFS_1  36.4 
 
 
445 aa  243  5e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.854492  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3337  major facilitator superfamily (MFS) transporter  34.03 
 
 
443 aa  240  4e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1522  major facilitator superfamily MFS_1  33.81 
 
 
426 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.101861  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0343  major facilitator transporter  34.35 
 
 
454 aa  233  7.000000000000001e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.911823 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3661  major facilitator superfamily MFS_1  34.25 
 
 
467 aa  232  1e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3874  major facilitator transporter  35.65 
 
 
467 aa  229  5e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1654  major facilitator transporter  33.97 
 
 
416 aa  227  4e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0574  major facilitator superfamily MFS_1  36.87 
 
 
440 aa  223  4e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1624  major facilitator superfamily MFS_1  32.34 
 
 
421 aa  222  8e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767884  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1472  major facilitator superfamily MFS_1  31.89 
 
 
419 aa  221  9.999999999999999e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.905727  normal  0.384031 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18980  major facilitator superfamily permease  34.77 
 
 
440 aa  219  1e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.273601  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3166  major facilitator superfamily MFS_1  36.11 
 
 
462 aa  218  2e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.704444  normal  0.18034 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2662  major facilitator transporter  31.59 
 
 
460 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1700  major facilitator superfamily MFS_1  35.12 
 
 
472 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1324  MFS transporter family protein  31.16 
 
 
425 aa  212  1e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0936  MFS transporter family protein  33.03 
 
 
458 aa  211  2e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1012  major facilitator superfamily MFS_1  31.99 
 
 
428 aa  207  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.389524 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2546  major facilitator transporter  32.62 
 
 
449 aa  202  7e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.146508  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2658  major facilitator transporter  36.3 
 
 
469 aa  202  8e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.494745  normal  0.637588 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25210  major facilitator superfamily permease  31.95 
 
 
449 aa  201  9.999999999999999e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.302409  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0020  major facilitator transporter  35.15 
 
 
456 aa  194  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.482167  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2758  major facilitator transporter  28.5 
 
 
447 aa  189  1e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3637  major facilitator transporter  32.58 
 
 
454 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35063  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3710  major facilitator superfamily transporter  32.58 
 
 
454 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.417195  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3642  major facilitator transporter  32.58 
 
 
454 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.266137  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22460  major facilitator superfamily MFS_1  31.78 
 
 
421 aa  186  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4097  major facilitator superfamily transporter  31.34 
 
 
443 aa  181  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4202  hypothetical protein  31.2 
 
 
479 aa  171  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.246317  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0146  major facilitator superfamily MFS_1  28.54 
 
 
414 aa  171  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.243784  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1854  major facilitator superfamily permease/ BtlA-like  29.48 
 
 
440 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000121925  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1274  putative integral membrane protein  29.98 
 
 
430 aa  166  9e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12530  leucine and alanine rich integral membrane protein  30.97 
 
 
445 aa  160  4e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0104482 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0030  major facilitator transporter  32.42 
 
 
456 aa  159  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550857  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1362  major facilitator transporter  32.19 
 
 
456 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2044  major facilitator transporter  29.93 
 
 
436 aa  155  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0220318 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2515  major facilitator superfamily MFS_1  30.14 
 
 
433 aa  153  5.9999999999999996e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3450  major facilitator transporter  31.38 
 
 
436 aa  150  4e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0458  hypothetical protein  27.59 
 
 
427 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000401747  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0507  hypothetical protein  27.79 
 
 
427 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0507  hypothetical protein  27.59 
 
 
427 aa  146  6e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.130258  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3786  major facilitator superfamily MFS_1  29.52 
 
 
412 aa  146  6e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2251  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 
439 aa  146  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0379  hypothetical protein  27.55 
 
 
427 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000021693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0370  major facilitator superfamily permease  27.55 
 
 
427 aa  145  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.902830000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0367  major facilitator superfamily permease  27.55 
 
 
427 aa  145  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000714912  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0393  hypothetical protein  27.55 
 
 
427 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0437  hypothetical protein  27.55 
 
 
427 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0373  major facilitator transporter  27.36 
 
 
427 aa  144  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000110963  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4866  hypothetical protein  27.27 
 
 
427 aa  143  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0379  major facilitator transporter  28.33 
 
 
427 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000550837  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0030  permease  24.19 
 
 
437 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345375  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2069  major facilitator transporter  28.54 
 
 
460 aa  140  3e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.692197  normal  0.259713 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0297  major facilitator superfamily MFS_1  29.85 
 
 
441 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.321668  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5507  major facilitator superfamily permease/BtlA- like protein  28.26 
 
 
451 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.462661  normal  0.0808457 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1838  major facilitator superfamily MFS_1  30.39 
 
 
439 aa  137  5e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.047376  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21750  major facilitator superfamily permease  25.94 
 
 
474 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.109771  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1801  major facilitator superfamily protein  27.71 
 
 
448 aa  134  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.640412  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3164  major facilitator superfamily permease  27.82 
 
 
453 aa  134  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263181  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3202  major facilitator superfamily MFS_1  28.11 
 
 
444 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1090  putative permease  26.33 
 
 
425 aa  134  5e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0778903  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1217  major facilitator superfamily MFS_1  26.2 
 
 
432 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0586  major facilitator superfamily MFS_1  27.29 
 
 
444 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2972  major facilitator superfamily MFS_1  27.29 
 
 
442 aa  129  8.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.737462  normal  0.183542 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1276  hypothetical protein  27.36 
 
 
431 aa  129  9.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.322939  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2301  major facilitator superfamily permease  26.44 
 
 
453 aa  127  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.334509  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0657  major facilitator transporter  29.67 
 
 
449 aa  125  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.651323  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1758  putative transporter  27.17 
 
 
460 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0335  major facilitator superfamily MFS_1  28.86 
 
 
454 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.121875 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01490  major facilitator superfamily permease  24.13 
 
 
408 aa  118  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0591182  normal  0.340851 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2328  major facilitator transporter  26.17 
 
 
465 aa  118  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1904  major facilitator superfamily MFS_1  22.2 
 
 
430 aa  116  8.999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2003  permease  22.27 
 
 
435 aa  116  8.999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.307053  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1893  major facilitator superfamily MFS_1  26.71 
 
 
458 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.117856  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>