120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3914 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3914  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 462 aa  906    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.133818 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4369  hypothetical protein  74.43 
 
 		 440 aa  649    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.486519  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4238  major facilitator superfamily MFS_1  95.45 
 
 		 462 aa  874    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.239966 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3188  major facilitator transporter  68.58 
 
 		 463 aa  579  1e-164  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.988714 
 
 
-
 
NC_004310  BR1817  hypothetical protein  61.38 
 
 		 455 aa  567  1e-160  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404559  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1085  major facilitator transporter  60.4 
 
 		 493 aa  559  1e-158  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.445039  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0083  major facilitator transporter  46.31 
 
 		 462 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.339646  normal  0.26187 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0027  major facilitator superfamily MFS_1  45.74 
 
 		 465 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453112  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0022  major facilitator transporter  45.17 
 
 		 463 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0160  major facilitator transporter  44.89 
 
 		 462 aa  385  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0192  major facilitator transporter  44.8 
 
 		 469 aa  383  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0721  major facilitator transporter  45.34 
 
 		 465 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1429  major facilitator transporter  42.92 
 
 		 466 aa  368  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0322  major facilitator transporter  45.86 
 
 		 467 aa  361  1e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169916  normal  0.209035 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3421  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 466 aa  330  4e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564111  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2937  major facilitator superfamily transporter  37.72 
 
 		 435 aa  292  7e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3337  major facilitator superfamily (MFS) transporter  38.26 
 
 		 443 aa  292  9e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0343  major facilitator transporter  35.68 
 
 		 454 aa  290  3e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.911823 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1317  major facilitator transporter  35.19 
 
 		 474 aa  274  3e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.8065  hitchhiker  0.00000263926 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1316  major facilitator transporter  37.22 
 
 		 492 aa  272  9e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.387007  hitchhiker  0.0000142592 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2130  major facilitator family transporter  35.62 
 
 		 435 aa  268  2e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0193  transporter, MFS superfamily  35.4 
 
 		 460 aa  265  1e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1010  major facilitator transporter  36.95 
 
 		 429 aa  256  8e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0315  hypothetical protein  37.19 
 
 		 424 aa  250  4e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2662  major facilitator transporter  36.65 
 
 		 460 aa  249  9e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0334  hypothetical protein  36.73 
 
 		 424 aa  248  1e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0020  major facilitator transporter  36.97 
 
 		 456 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.482167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2658  major facilitator transporter  35.65 
 
 		 469 aa  244  1.9999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.494745  normal  0.637588 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3661  major facilitator transporter  35.87 
 
 		 426 aa  227  4e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0030  major facilitator transporter  36.45 
 
 		 456 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1362  major facilitator transporter  35.62 
 
 		 456 aa  221  3e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1842  major facilitator superfamily MFS_1  33.19 
 
 		 451 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4202  hypothetical protein  33.33 
 
 		 479 aa  204  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.246317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3661  major facilitator superfamily MFS_1  31.59 
 
 		 467 aa  186  6e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0635  major facilitator superfamily MFS_1  31.49 
 
 		 456 aa  183  7e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.636916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3874  major facilitator transporter  31.79 
 
 		 467 aa  180  4.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0568  major facilitator superfamily MFS_1  29.27 
 
 		 468 aa  179  7e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685546 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1522  major facilitator superfamily MFS_1  28.09 
 
 		 426 aa  177  3e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.101861  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2368  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 		 445 aa  174  3.9999999999999995e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.854492  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1624  major facilitator superfamily MFS_1  28.4 
 
 		 421 aa  169  9e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767884  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1700  major facilitator superfamily MFS_1  28.63 
 
 		 472 aa  168  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3166  major facilitator superfamily MFS_1  29.12 
 
 		 462 aa  167  4e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.704444  normal  0.18034 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18980  major facilitator superfamily permease  28.35 
 
 		 440 aa  160  5e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.273601  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1012  major facilitator superfamily MFS_1  26.71 
 
 		 428 aa  158  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.389524 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1324  MFS transporter family protein  27.09 
 
 		 425 aa  154  2e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1472  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 		 419 aa  155  2e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.905727  normal  0.384031 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1654  major facilitator transporter  26.35 
 
 		 416 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25210  major facilitator superfamily permease  29.08 
 
 		 449 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.302409  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0574  major facilitator superfamily MFS_1  27.93 
 
 		 440 aa  150  5e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1854  major facilitator superfamily permease/ BtlA-like  26.96 
 
 		 440 aa  139  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000121925  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22460  major facilitator superfamily MFS_1  27.15 
 
 		 421 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0936  MFS transporter family protein  25.38 
 
 		 458 aa  133  6e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2069  major facilitator transporter  25.78 
 
 		 460 aa  124  4e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.692197  normal  0.259713 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2546  major facilitator transporter  25 
 
 		 449 aa  123  5e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.146508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0146  major facilitator superfamily MFS_1  24.44 
 
 		 414 aa  122  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.243784  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2708  major facilitator superfamily MFS_1  27.16 
 
 		 450 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0342766  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4097  major facilitator superfamily transporter  25.87 
 
 		 443 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2301  major facilitator superfamily permease  27.05 
 
 		 453 aa  120  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.334509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1090  putative permease  26.48 
 
 		 425 aa  120  6e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0778903  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3164  major facilitator superfamily permease  27.72 
 
 		 453 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263181  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1801  major facilitator superfamily protein  26.43 
 
 		 448 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.640412  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2277  major facilitator superfamily MFS_1  25.31 
 
 		 469 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.419016  normal  0.219783 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01490  major facilitator superfamily permease  23.99 
 
 		 408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0591182  normal  0.340851 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5507  major facilitator superfamily permease/BtlA- like protein  26.29 
 
 		 451 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.462661  normal  0.0808457 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0030  permease  24.5 
 
 		 437 aa  111  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345375  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3450  major facilitator transporter  25.96 
 
 		 436 aa  110  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0458  hypothetical protein  25.28 
 
 		 427 aa  110  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000401747  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5316  major facilitator superfamily MFS_1  23.85 
 
 		 572 aa  110  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21750  major facilitator superfamily permease  24.1 
 
 		 474 aa  109  9.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.109771  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2758  major facilitator transporter  23.85 
 
 		 447 aa  109  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3637  major facilitator transporter  25 
 
 		 454 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35063  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3710  major facilitator superfamily transporter  25 
 
 		 454 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.417195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3642  major facilitator transporter  25 
 
 		 454 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.266137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1758  putative transporter  25.6 
 
 		 460 aa  108  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2972  major facilitator superfamily MFS_1  26.49 
 
 		 442 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.737462  normal  0.183542 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3786  major facilitator superfamily MFS_1  24.89 
 
 		 412 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0390  major facilitator superfamily permease  28.64 
 
 		 446 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.778281  normal  0.55351 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1893  major facilitator superfamily MFS_1  23.98 
 
 		 458 aa  108  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.117856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2328  major facilitator transporter  24.43 
 
 		 465 aa  107  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0379  major facilitator transporter  25.45 
 
 		 427 aa  107  6e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000550837  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0507  hypothetical protein  24.61 
 
 		 427 aa  105  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.130258  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0379  hypothetical protein  24.61 
 
 		 427 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000021693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0370  major facilitator superfamily permease  24.61 
 
 		 427 aa  105  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.902830000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0367  major facilitator superfamily permease  24.61 
 
 		 427 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000714912  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0393  hypothetical protein  24.61 
 
 		 427 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0373  major facilitator transporter  24.83 
 
 		 427 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000110963  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0437  hypothetical protein  24.61 
 
 		 427 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0586  major facilitator superfamily MFS_1  25.4 
 
 		 444 aa  104  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4866  hypothetical protein  24.83 
 
 		 427 aa  103  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0507  hypothetical protein  24.38 
 
 		 427 aa  103  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0297  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 		 441 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.321668  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3202  major facilitator superfamily MFS_1  25.86 
 
 		 444 aa  100  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14630  major facilitator superfamily permease  23.9 
 
 		 462 aa  100  7e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415319 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2251  major facilitator superfamily MFS_1  21.79 
 
 		 439 aa  98.2  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2003  permease  23.38 
 
 		 435 aa  98.2  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.307053  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2515  major facilitator superfamily MFS_1  23.8 
 
 		 433 aa  98.2  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2713  major facilitator superfamily MFS_1  24.2 
 
 		 424 aa  97.1  6e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2014  major facilitator transporter  24.06 
 
 		 426 aa  96.3  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.273868  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2044  major facilitator transporter  23.6 
 
 		 436 aa  94.7  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0220318 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1274  putative integral membrane protein  21.1 
 
 		 430 aa  92  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>