143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3202 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_3202  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 444 aa  882    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3264  hypothetical protein  34.03 
 
 		 408 aa  224  3e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1522  major facilitator superfamily MFS_1  32.32 
 
 		 426 aa  202  9e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.101861  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1472  major facilitator superfamily MFS_1  30.97 
 
 		 419 aa  199  1.0000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.905727  normal  0.384031 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1624  major facilitator superfamily MFS_1  32.73 
 
 		 421 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767884  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0657  major facilitator transporter  32.66 
 
 		 449 aa  187  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.651323  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1654  major facilitator transporter  30.02 
 
 		 416 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1012  major facilitator superfamily MFS_1  30.43 
 
 		 428 aa  181  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.389524 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0936  MFS transporter family protein  29.32 
 
 		 458 aa  180  4e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1217  major facilitator superfamily MFS_1  32.54 
 
 		 432 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1324  MFS transporter family protein  29.95 
 
 		 425 aa  172  1e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2130  major facilitator family transporter  29.21 
 
 		 435 aa  171  3e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0193  transporter, MFS superfamily  29.21 
 
 		 460 aa  168  2e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0387  major facilitator transporter  31.88 
 
 		 437 aa  163  7e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0133748  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1010  major facilitator transporter  27.69 
 
 		 429 aa  158  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2937  major facilitator superfamily transporter  28.11 
 
 		 435 aa  156  8e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1842  major facilitator superfamily MFS_1  29.93 
 
 		 451 aa  150  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0315  hypothetical protein  26.44 
 
 		 424 aa  144  5e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2758  major facilitator transporter  27.83 
 
 		 447 aa  139  7e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1854  major facilitator superfamily permease/ BtlA-like  27.17 
 
 		 440 aa  139  8.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000121925  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3661  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 426 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0027  major facilitator superfamily MFS_1  23.8 
 
 		 465 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453112  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0334  hypothetical protein  26.32 
 
 		 424 aa  137  4e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0507  hypothetical protein  26.26 
 
 		 427 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.130258  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0192  major facilitator transporter  26.34 
 
 		 469 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1274  putative integral membrane protein  27.49 
 
 		 430 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0083  major facilitator transporter  23.89 
 
 		 462 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.339646  normal  0.26187 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0022  major facilitator transporter  24.57 
 
 		 463 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0379  major facilitator transporter  25.86 
 
 		 427 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000550837  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0458  hypothetical protein  26.03 
 
 		 427 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000401747  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22460  major facilitator superfamily MFS_1  23.47 
 
 		 421 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0507  hypothetical protein  26.48 
 
 		 427 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4866  hypothetical protein  26.26 
 
 		 427 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0379  hypothetical protein  26.26 
 
 		 427 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000021693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0370  major facilitator superfamily permease  26.26 
 
 		 427 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.902830000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0367  major facilitator superfamily permease  26.26 
 
 		 427 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000714912  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0393  hypothetical protein  26.26 
 
 		 427 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0373  major facilitator transporter  25.8 
 
 		 427 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000110963  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0437  hypothetical protein  26.26 
 
 		 427 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0160  major facilitator transporter  24.48 
 
 		 462 aa  123  6e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3450  major facilitator transporter  26.38 
 
 		 436 aa  123  6e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_004310  BR1817  hypothetical protein  26.4 
 
 		 455 aa  122  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404559  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0574  major facilitator superfamily MFS_1  25.69 
 
 		 440 aa  122  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3914  major facilitator superfamily MFS_1  25.86 
 
 		 462 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.133818 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2515  major facilitator superfamily MFS_1  25.83 
 
 		 433 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0146  major facilitator superfamily MFS_1  24.7 
 
 		 414 aa  121  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.243784  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4238  major facilitator superfamily MFS_1  25.43 
 
 		 462 aa  121  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.239966 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0322  major facilitator transporter  23.54 
 
 		 467 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169916  normal  0.209035 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1317  major facilitator transporter  23.75 
 
 		 474 aa  115  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.8065  hitchhiker  0.00000263926 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3661  major facilitator superfamily MFS_1  24.38 
 
 		 467 aa  113  7.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3786  major facilitator superfamily MFS_1  25.12 
 
 		 412 aa  113  8.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4369  hypothetical protein  27.17 
 
 		 440 aa  111  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.486519  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0568  major facilitator superfamily MFS_1  23.47 
 
 		 468 aa  111  3e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685546 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1838  major facilitator superfamily MFS_1  27.14 
 
 		 439 aa  111  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.047376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1085  major facilitator transporter  24.65 
 
 		 493 aa  110  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.445039  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2546  major facilitator transporter  22.08 
 
 		 449 aa  110  7.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.146508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0406  major facilitator superfamily MFS_1  24.1 
 
 		 404 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0335  major facilitator superfamily MFS_1  25.82 
 
 		 454 aa  109  8.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.121875 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3188  major facilitator transporter  25.17 
 
 		 463 aa  109  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.988714 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3337  major facilitator superfamily (MFS) transporter  21.83 
 
 		 443 aa  109  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0721  major facilitator transporter  22.42 
 
 		 465 aa  106  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2069  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 460 aa  105  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.692197  normal  0.259713 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1316  major facilitator transporter  23.99 
 
 		 492 aa  106  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.387007  hitchhiker  0.0000142592 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3874  major facilitator transporter  25.25 
 
 		 467 aa  105  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4097  major facilitator superfamily transporter  23.71 
 
 		 443 aa  105  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0635  major facilitator superfamily MFS_1  26.49 
 
 		 456 aa  104  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.636916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3637  major facilitator transporter  25.85 
 
 		 454 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35063  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3710  major facilitator superfamily transporter  25.85 
 
 		 454 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.417195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3642  major facilitator transporter  25.85 
 
 		 454 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.266137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0297  major facilitator superfamily MFS_1  25.44 
 
 		 441 aa  104  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.321668  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1700  major facilitator superfamily MFS_1  23.38 
 
 		 472 aa  104  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01490  major facilitator superfamily permease  24.29 
 
 		 408 aa  103  4e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0591182  normal  0.340851 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0343  major facilitator transporter  22.57 
 
 		 454 aa  104  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.911823 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2713  major facilitator superfamily MFS_1  26.2 
 
 		 424 aa  102  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2044  major facilitator transporter  27.35 
 
 		 436 aa  100  7e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0220318 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3164  major facilitator superfamily permease  24.2 
 
 		 453 aa  99.8  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1697  major facilitator superfamily MFS_1  26.91 
 
 		 375 aa  99.8  9e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2658  major facilitator transporter  25.38 
 
 		 469 aa  99.4  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.494745  normal  0.637588 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2301  major facilitator superfamily permease  23.74 
 
 		 453 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.334509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14630  major facilitator superfamily permease  23.76 
 
 		 462 aa  97.8  4e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415319 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1090  putative permease  23.41 
 
 		 425 aa  97.1  7e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0778903  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2368  major facilitator superfamily MFS_1  22.51 
 
 		 445 aa  96.7  7e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.854492  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12530  leucine and alanine rich integral membrane protein  22.56 
 
 		 445 aa  96.3  9e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0104482 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18980  major facilitator superfamily permease  24.65 
 
 		 440 aa  96.3  9e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.273601  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1429  major facilitator transporter  22.17 
 
 		 466 aa  96.7  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1758  putative transporter  24.31 
 
 		 460 aa  95.9  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3421  major facilitator transporter  25.05 
 
 		 466 aa  95.9  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564111  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0586  major facilitator superfamily MFS_1  23.13 
 
 		 444 aa  96.3  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21750  major facilitator superfamily permease  23.85 
 
 		 474 aa  94.4  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.109771  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2708  major facilitator superfamily MFS_1  25.35 
 
 		 450 aa  94  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0342766  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25210  major facilitator superfamily permease  25.44 
 
 		 449 aa  92.4  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.302409  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2277  major facilitator superfamily MFS_1  24.15 
 
 		 469 aa  92.8  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.419016  normal  0.219783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2972  major facilitator superfamily MFS_1  24.76 
 
 		 442 aa  91.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.737462  normal  0.183542 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2670  major facilitator transporter  23.94 
 
 		 458 aa  88.6  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.88531  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1720  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 454 aa  88.2  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.493867 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2485  hypothetical protein  23.87 
 
 		 464 aa  87  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0030  permease  19.68 
 
 		 437 aa  87  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345375  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1893  major facilitator superfamily MFS_1  22.92 
 
 		 458 aa  86.7  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.117856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2328  major facilitator transporter  23.16 
 
 		 465 aa  85.9  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2003  permease  23.97 
 
 		 435 aa  85.5  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.307053  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>