128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0022 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0160  major facilitator transporter  77.49 
 
 		 462 aa  711    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0083  major facilitator transporter  79 
 
 		 462 aa  723    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.339646  normal  0.26187 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0022  major facilitator transporter  100 
 
 		 463 aa  899    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0721  major facilitator transporter  77.32 
 
 		 465 aa  672    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0192  major facilitator transporter  78.4 
 
 		 469 aa  718    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0322  major facilitator transporter  75.85 
 
 		 467 aa  649    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169916  normal  0.209035 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0027  major facilitator superfamily MFS_1  77.75 
 
 		 465 aa  719    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453112  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1429  major facilitator transporter  59.23 
 
 		 466 aa  501  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218982  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4238  major facilitator superfamily MFS_1  46.86 
 
 		 462 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.239966 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3421  major facilitator transporter  47.6 
 
 		 466 aa  393  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564111  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3914  major facilitator superfamily MFS_1  45.17 
 
 		 462 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.133818 
 
 
-
 
NC_004310  BR1817  hypothetical protein  47.06 
 
 		 455 aa  387  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404559  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1085  major facilitator transporter  45.58 
 
 		 493 aa  383  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.445039  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4369  hypothetical protein  45.39 
 
 		 440 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.486519  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3337  major facilitator superfamily (MFS) transporter  44.82 
 
 		 443 aa  363  2e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0343  major facilitator transporter  44.42 
 
 		 454 aa  356  5.999999999999999e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.911823 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3188  major facilitator transporter  45.94 
 
 		 463 aa  353  2.9999999999999997e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.988714 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0020  major facilitator transporter  45.15 
 
 		 456 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.482167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1317  major facilitator transporter  40.14 
 
 		 474 aa  310  2e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.8065  hitchhiker  0.00000263926 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2937  major facilitator superfamily transporter  41.07 
 
 		 435 aa  306  7e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2130  major facilitator family transporter  40 
 
 		 435 aa  297  2e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0193  transporter, MFS superfamily  40 
 
 		 460 aa  295  1e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2658  major facilitator transporter  40.39 
 
 		 469 aa  295  2e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.494745  normal  0.637588 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1010  major facilitator transporter  40.95 
 
 		 429 aa  293  6e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0030  major facilitator transporter  43.84 
 
 		 456 aa  289  6e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1362  major facilitator transporter  43.74 
 
 		 456 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1316  major facilitator transporter  37.94 
 
 		 492 aa  270  2.9999999999999997e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.387007  hitchhiker  0.0000142592 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3661  major facilitator transporter  41.27 
 
 		 426 aa  270  5e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0334  hypothetical protein  36.73 
 
 		 424 aa  268  1e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1842  major facilitator superfamily MFS_1  38.72 
 
 		 451 aa  268  2e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2662  major facilitator transporter  37.16 
 
 		 460 aa  265  1e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0315  hypothetical protein  36.73 
 
 		 424 aa  263  4e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1654  major facilitator transporter  32 
 
 		 416 aa  219  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1522  major facilitator superfamily MFS_1  31.78 
 
 		 426 aa  216  8e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.101861  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1324  MFS transporter family protein  30.16 
 
 		 425 aa  196  9e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1624  major facilitator superfamily MFS_1  30.22 
 
 		 421 aa  195  2e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767884  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3661  major facilitator superfamily MFS_1  32.79 
 
 		 467 aa  195  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1012  major facilitator superfamily MFS_1  31.17 
 
 		 428 aa  194  4e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.389524 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2368  major facilitator superfamily MFS_1  31.49 
 
 		 445 aa  192  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.854492  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0936  MFS transporter family protein  29.7 
 
 		 458 aa  188  2e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1472  major facilitator superfamily MFS_1  29.5 
 
 		 419 aa  188  2e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.905727  normal  0.384031 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4202  hypothetical protein  33.33 
 
 		 479 aa  187  4e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.246317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3874  major facilitator transporter  34.12 
 
 		 467 aa  185  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0635  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 		 456 aa  184  3e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.636916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1700  major facilitator superfamily MFS_1  32.97 
 
 		 472 aa  184  4.0000000000000006e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0574  major facilitator superfamily MFS_1  32.55 
 
 		 440 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3166  major facilitator superfamily MFS_1  31.95 
 
 		 462 aa  176  6e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.704444  normal  0.18034 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18980  major facilitator superfamily permease  32.24 
 
 		 440 aa  176  6e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.273601  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0146  major facilitator superfamily MFS_1  28.35 
 
 		 414 aa  171  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.243784  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0568  major facilitator superfamily MFS_1  29.48 
 
 		 468 aa  165  2.0000000000000002e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685546 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2069  major facilitator transporter  31.24 
 
 		 460 aa  159  9e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.692197  normal  0.259713 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25210  major facilitator superfamily permease  30.83 
 
 		 449 aa  151  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.302409  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2546  major facilitator transporter  28.87 
 
 		 449 aa  151  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.146508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4097  major facilitator superfamily transporter  30.28 
 
 		 443 aa  144  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1274  putative integral membrane protein  27.46 
 
 		 430 aa  143  8e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22460  major facilitator superfamily MFS_1  28.51 
 
 		 421 aa  142  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2758  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 447 aa  139  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0297  major facilitator superfamily MFS_1  30.33 
 
 		 441 aa  139  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.321668  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3786  major facilitator superfamily MFS_1  27.19 
 
 		 412 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01490  major facilitator superfamily permease  25.74 
 
 		 408 aa  132  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0591182  normal  0.340851 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2708  major facilitator superfamily MFS_1  28.63 
 
 		 450 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0342766  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1090  putative permease  27.87 
 
 		 425 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0778903  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1854  major facilitator superfamily permease/ BtlA-like  28.63 
 
 		 440 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000121925  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5507  major facilitator superfamily permease/BtlA- like protein  28.91 
 
 		 451 aa  131  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.462661  normal  0.0808457 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0586  major facilitator superfamily MFS_1  28.67 
 
 		 444 aa  131  3e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12530  leucine and alanine rich integral membrane protein  29.35 
 
 		 445 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0104482 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3637  major facilitator transporter  29.54 
 
 		 454 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35063  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3710  major facilitator superfamily transporter  29.54 
 
 		 454 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.417195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2014  major facilitator transporter  26.54 
 
 		 426 aa  125  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.273868  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3642  major facilitator transporter  29.54 
 
 		 454 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.266137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1893  major facilitator superfamily MFS_1  27.91 
 
 		 458 aa  124  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.117856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2713  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 424 aa  123  6e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5316  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 572 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0458  hypothetical protein  25.11 
 
 		 427 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000401747  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0507  hypothetical protein  24.89 
 
 		 427 aa  119  9e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.130258  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2301  major facilitator superfamily permease  26.92 
 
 		 453 aa  119  9e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.334509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0657  major facilitator transporter  29.08 
 
 		 449 aa  119  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.651323  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2277  major facilitator superfamily MFS_1  25.26 
 
 		 469 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.419016  normal  0.219783 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0507  hypothetical protein  24.67 
 
 		 427 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0335  major facilitator superfamily MFS_1  28.6 
 
 		 454 aa  118  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.121875 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0387  major facilitator transporter  28.88 
 
 		 437 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0133748  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0373  major facilitator transporter  24.45 
 
 		 427 aa  117  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000110963  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0379  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 427 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000550837  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0379  hypothetical protein  24.45 
 
 		 427 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000021693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0370  major facilitator superfamily permease  24.45 
 
 		 427 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.902830000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0367  major facilitator superfamily permease  24.45 
 
 		 427 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000714912  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0393  hypothetical protein  24.45 
 
 		 427 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0437  hypothetical protein  24.45 
 
 		 427 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2515  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 		 433 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3202  major facilitator superfamily MFS_1  24.68 
 
 		 444 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4866  hypothetical protein  24.45 
 
 		 427 aa  114  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1904  major facilitator superfamily MFS_1  24.57 
 
 		 430 aa  114  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0030  permease  24.78 
 
 		 437 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345375  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21750  major facilitator superfamily permease  25.81 
 
 		 474 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.109771  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2044  major facilitator transporter  27.48 
 
 		 436 aa  112  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0220318 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3164  major facilitator superfamily permease  26.25 
 
 		 453 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0390  major facilitator superfamily permease  27.85 
 
 		 446 aa  111  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.778281  normal  0.55351 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1758  putative transporter  26.86 
 
 		 460 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1720  major facilitator transporter  29.69 
 
 		 454 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.493867 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2251  major facilitator superfamily MFS_1  24.14 
 
 		 439 aa  107  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>