132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0657 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0657  major facilitator transporter  100 
 
 		 449 aa  853    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.651323  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0387  major facilitator transporter  62.03 
 
 		 437 aa  416  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0133748  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3264  hypothetical protein  37.65 
 
 		 408 aa  223  7e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1217  major facilitator superfamily MFS_1  36.6 
 
 		 432 aa  216  7e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3202  major facilitator superfamily MFS_1  33.11 
 
 		 444 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1522  major facilitator superfamily MFS_1  32.22 
 
 		 426 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.101861  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1012  major facilitator superfamily MFS_1  30.33 
 
 		 428 aa  194  4e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.389524 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1624  major facilitator superfamily MFS_1  33.51 
 
 		 421 aa  193  5e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767884  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0936  MFS transporter family protein  32.84 
 
 		 458 aa  186  5e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1654  major facilitator transporter  32.17 
 
 		 416 aa  186  6e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1324  MFS transporter family protein  32.55 
 
 		 425 aa  177  2e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1472  major facilitator superfamily MFS_1  31.9 
 
 		 419 aa  177  2e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.905727  normal  0.384031 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1842  major facilitator superfamily MFS_1  34.68 
 
 		 451 aa  163  6e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2937  major facilitator superfamily transporter  31.78 
 
 		 435 aa  155  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2758  major facilitator transporter  29.24 
 
 		 447 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2515  major facilitator superfamily MFS_1  32.03 
 
 		 433 aa  149  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0022  major facilitator transporter  29.42 
 
 		 463 aa  143  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1854  major facilitator superfamily permease/ BtlA-like  30.85 
 
 		 440 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000121925  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2130  major facilitator family transporter  29.53 
 
 		 435 aa  140  3.9999999999999997e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0027  major facilitator superfamily MFS_1  30.19 
 
 		 465 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453112  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22460  major facilitator superfamily MFS_1  26.48 
 
 		 421 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0192  major facilitator transporter  30.53 
 
 		 469 aa  137  4e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0193  transporter, MFS superfamily  28.84 
 
 		 460 aa  136  6.0000000000000005e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0083  major facilitator transporter  29.46 
 
 		 462 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.339646  normal  0.26187 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1274  putative integral membrane protein  32.9 
 
 		 430 aa  134  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0160  major facilitator transporter  29.93 
 
 		 462 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0146  major facilitator superfamily MFS_1  29.11 
 
 		 414 aa  130  6e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.243784  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0315  hypothetical protein  27.2 
 
 		 424 aa  129  8.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2044  major facilitator transporter  30.91 
 
 		 436 aa  129  8.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0220318 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1010  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 429 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1838  major facilitator superfamily MFS_1  28.8 
 
 		 439 aa  127  5e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.047376  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0334  hypothetical protein  26.87 
 
 		 424 aa  123  6e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0343  major facilitator transporter  26.9 
 
 		 454 aa  123  7e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.911823 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2546  major facilitator transporter  30.66 
 
 		 449 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.146508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1697  major facilitator superfamily MFS_1  25.77 
 
 		 375 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0322  major facilitator transporter  28.54 
 
 		 467 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169916  normal  0.209035 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4238  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 		 462 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.239966 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1429  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 466 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3450  major facilitator transporter  27.4 
 
 		 436 aa  118  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0721  major facilitator transporter  29.2 
 
 		 465 aa  117  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3914  major facilitator superfamily MFS_1  25.49 
 
 		 462 aa  117  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.133818 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4369  hypothetical protein  26.93 
 
 		 440 aa  117  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.486519  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2014  major facilitator transporter  29.59 
 
 		 426 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.273868  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3166  major facilitator superfamily MFS_1  31.04 
 
 		 462 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.704444  normal  0.18034 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2662  major facilitator transporter  25.48 
 
 		 460 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1276  hypothetical protein  25.77 
 
 		 431 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.322939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2069  major facilitator transporter  28.92 
 
 		 460 aa  109  9.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.692197  normal  0.259713 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0335  major facilitator superfamily MFS_1  30.35 
 
 		 454 aa  109  9.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.121875 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3337  major facilitator superfamily (MFS) transporter  28.29 
 
 		 443 aa  108  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2368  major facilitator superfamily MFS_1  29.61 
 
 		 445 aa  108  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.854492  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2713  major facilitator superfamily MFS_1  26.79 
 
 		 424 aa  108  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5316  major facilitator superfamily MFS_1  30.67 
 
 		 572 aa  106  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0373  major facilitator transporter  23.39 
 
 		 427 aa  106  9e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000110963  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3661  major facilitator transporter  28.42 
 
 		 426 aa  105  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1317  major facilitator transporter  27.35 
 
 		 474 aa  105  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.8065  hitchhiker  0.00000263926 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18980  major facilitator superfamily permease  29.32 
 
 		 440 aa  105  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.273601  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0635  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 		 456 aa  103  6e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.636916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4097  major facilitator superfamily transporter  30.03 
 
 		 443 aa  103  8e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1817  hypothetical protein  25.7 
 
 		 455 aa  102  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404559  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3421  major facilitator transporter  29.06 
 
 		 466 aa  102  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564111  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2708  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 		 450 aa  102  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0342766  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0458  hypothetical protein  22.49 
 
 		 427 aa  102  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000401747  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0507  hypothetical protein  22.25 
 
 		 427 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.130258  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1720  major facilitator transporter  32.3 
 
 		 454 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.493867 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0379  hypothetical protein  23.46 
 
 		 427 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000021693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0370  major facilitator superfamily permease  23.46 
 
 		 427 aa  100  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.902830000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0367  major facilitator superfamily permease  23.46 
 
 		 427 aa  100  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000714912  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0393  hypothetical protein  23.46 
 
 		 427 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0437  hypothetical protein  23.46 
 
 		 427 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21750  major facilitator superfamily permease  23.61 
 
 		 474 aa  100  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.109771  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0507  hypothetical protein  23.22 
 
 		 427 aa  99.8  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0379  major facilitator transporter  24.23 
 
 		 427 aa  99.4  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000550837  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3786  major facilitator superfamily MFS_1  25.52 
 
 		 412 aa  99.4  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0020  major facilitator transporter  29.2 
 
 		 456 aa  99  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.482167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1085  major facilitator transporter  26.44 
 
 		 493 aa  99  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.445039  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4866  hypothetical protein  23.46 
 
 		 427 aa  99  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3637  major facilitator transporter  29.9 
 
 		 454 aa  98.2  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35063  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01490  major facilitator superfamily permease  24.51 
 
 		 408 aa  97.8  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0591182  normal  0.340851 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3710  major facilitator superfamily transporter  29.9 
 
 		 454 aa  98.2  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.417195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3642  major facilitator transporter  29.9 
 
 		 454 aa  98.2  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.266137  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1801  major facilitator superfamily protein  27.44 
 
 		 448 aa  97.4  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.640412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3661  major facilitator superfamily MFS_1  27.83 
 
 		 467 aa  97.1  6e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0568  major facilitator superfamily MFS_1  27.09 
 
 		 468 aa  95.5  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685546 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2658  major facilitator transporter  27.02 
 
 		 469 aa  93.6  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.494745  normal  0.637588 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1758  putative transporter  25.95 
 
 		 460 aa  93.2  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2251  major facilitator superfamily MFS_1  23.5 
 
 		 439 aa  92.8  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25210  major facilitator superfamily permease  27.84 
 
 		 449 aa  92  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.302409  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3874  major facilitator transporter  27.36 
 
 		 467 aa  91.7  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0030  permease  21.81 
 
 		 437 aa  91.3  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345375  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1316  major facilitator transporter  25.7 
 
 		 492 aa  90.1  8e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.387007  hitchhiker  0.0000142592 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0574  major facilitator superfamily MFS_1  26.09 
 
 		 440 aa  89.4  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1090  putative permease  24.15 
 
 		 425 aa  88.6  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0778903  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3411  major facilitator superfamily MFS_1  25.21 
 
 		 469 aa  88.2  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0586  major facilitator superfamily MFS_1  24.17 
 
 		 444 aa  87.4  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2277  major facilitator superfamily MFS_1  27.96 
 
 		 469 aa  87.4  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.419016  normal  0.219783 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1904  major facilitator superfamily MFS_1  21.89 
 
 		 430 aa  87  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2301  major facilitator superfamily permease  26.39 
 
 		 453 aa  86.7  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.334509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3164  major facilitator superfamily permease  26.47 
 
 		 453 aa  86.7  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1893  major facilitator superfamily MFS_1  29.59 
 
 		 458 aa  86.3  9e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.117856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0030  major facilitator transporter  30.1 
 
 		 456 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550857  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>