147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1274 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1274  putative integral membrane protein  100 
 
 		 430 aa  842    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2758  major facilitator transporter  61.05 
 
 		 447 aa  520  1e-146  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2515  major facilitator superfamily MFS_1  56.5 
 
 		 433 aa  430  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2044  major facilitator transporter  55.82 
 
 		 436 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0220318 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0146  major facilitator superfamily MFS_1  41.35 
 
 		 414 aa  273  5.000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.243784  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2069  major facilitator transporter  36.55 
 
 		 460 aa  238  1e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.692197  normal  0.259713 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2014  major facilitator transporter  35.36 
 
 		 426 aa  229  5e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.273868  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0297  major facilitator superfamily MFS_1  37.88 
 
 		 441 aa  229  9e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.321668  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1472  major facilitator superfamily MFS_1  33.65 
 
 		 419 aa  220  3.9999999999999997e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.905727  normal  0.384031 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1012  major facilitator superfamily MFS_1  33.49 
 
 		 428 aa  218  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.389524 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1624  major facilitator superfamily MFS_1  33.51 
 
 		 421 aa  216  8e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767884  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1324  MFS transporter family protein  34.29 
 
 		 425 aa  215  9.999999999999999e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0586  major facilitator superfamily MFS_1  34.02 
 
 		 444 aa  215  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1522  major facilitator superfamily MFS_1  32.69 
 
 		 426 aa  212  1e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.101861  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1842  major facilitator superfamily MFS_1  37.41 
 
 		 451 aa  211  3e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1654  major facilitator transporter  33.01 
 
 		 416 aa  210  5e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0936  MFS transporter family protein  32.18 
 
 		 458 aa  209  1e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3661  major facilitator transporter  35.68 
 
 		 426 aa  183  6e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0334  hypothetical protein  30.3 
 
 		 424 aa  179  7e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0315  hypothetical protein  30.24 
 
 		 424 aa  174  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1854  major facilitator superfamily permease/ BtlA-like  33.03 
 
 		 440 aa  173  5e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000121925  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2937  major facilitator superfamily transporter  29.22 
 
 		 435 aa  171  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2277  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 469 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.419016  normal  0.219783 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2301  major facilitator superfamily permease  31.53 
 
 		 453 aa  159  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.334509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3164  major facilitator superfamily permease  31.79 
 
 		 453 aa  156  6e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22460  major facilitator superfamily MFS_1  28.3 
 
 		 421 aa  154  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1010  major facilitator transporter  31.57 
 
 		 429 aa  154  4e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0083  major facilitator transporter  28.29 
 
 		 462 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.339646  normal  0.26187 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0192  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 469 aa  152  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2130  major facilitator family transporter  29.8 
 
 		 435 aa  152  1e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0022  major facilitator transporter  28.06 
 
 		 463 aa  150  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0193  transporter, MFS superfamily  29.29 
 
 		 460 aa  146  5e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0027  major facilitator superfamily MFS_1  28.22 
 
 		 465 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453112  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0160  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 462 aa  145  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1758  putative transporter  30.73 
 
 		 460 aa  142  8e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1904  major facilitator superfamily MFS_1  24.43 
 
 		 430 aa  143  8e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21750  major facilitator superfamily permease  28.64 
 
 		 474 aa  142  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.109771  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2003  permease  24.82 
 
 		 435 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.307053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0322  major facilitator transporter  28.1 
 
 		 467 aa  138  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169916  normal  0.209035 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0635  major facilitator superfamily MFS_1  29.82 
 
 		 456 aa  138  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.636916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2708  major facilitator superfamily MFS_1  30.12 
 
 		 450 aa  136  9e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0342766  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0574  major facilitator superfamily MFS_1  28.4 
 
 		 440 aa  134  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0721  major facilitator transporter  28.79 
 
 		 465 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1217  major facilitator superfamily MFS_1  30.18 
 
 		 432 aa  133  6e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2328  major facilitator transporter  30.61 
 
 		 465 aa  133  6.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0390  major facilitator superfamily permease  30.72 
 
 		 446 aa  133  7.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.778281  normal  0.55351 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25210  major facilitator superfamily permease  28.19 
 
 		 449 aa  132  7.999999999999999e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.302409  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2368  major facilitator superfamily MFS_1  28.89 
 
 		 445 aa  132  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.854492  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0568  major facilitator superfamily MFS_1  27.42 
 
 		 468 aa  128  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685546 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3202  major facilitator superfamily MFS_1  27.42 
 
 		 444 aa  127  5e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5507  major facilitator superfamily permease/BtlA- like protein  29.95 
 
 		 451 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.462661  normal  0.0808457 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2251  major facilitator superfamily MFS_1  25.59 
 
 		 439 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3337  major facilitator superfamily (MFS) transporter  30.54 
 
 		 443 aa  124  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1801  major facilitator superfamily protein  28.15 
 
 		 448 aa  124  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.640412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1720  major facilitator transporter  33.81 
 
 		 454 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.493867 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3874  major facilitator transporter  27.97 
 
 		 467 aa  124  4e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0030  permease  25 
 
 		 437 aa  123  8e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345375  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18980  major facilitator superfamily permease  28.4 
 
 		 440 aa  122  9.999999999999999e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.273601  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3661  major facilitator superfamily MFS_1  28.33 
 
 		 467 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1429  major facilitator transporter  27.65 
 
 		 466 aa  121  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14630  major facilitator superfamily permease  30.61 
 
 		 462 aa  120  6e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415319 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3786  major facilitator superfamily MFS_1  26.93 
 
 		 412 aa  119  7e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1838  major facilitator superfamily MFS_1  29.31 
 
 		 439 aa  120  7e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.047376  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3166  major facilitator superfamily MFS_1  29.35 
 
 		 462 aa  119  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.704444  normal  0.18034 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3421  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 466 aa  119  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564111  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0335  major facilitator superfamily MFS_1  30.57 
 
 		 454 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.121875 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1276  hypothetical protein  27.29 
 
 		 431 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.322939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0343  major facilitator transporter  26.07 
 
 		 454 aa  115  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.911823 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2972  major facilitator superfamily MFS_1  27.88 
 
 		 442 aa  114  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.737462  normal  0.183542 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2546  major facilitator transporter  29.43 
 
 		 449 aa  112  9e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.146508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4097  major facilitator superfamily transporter  29.28 
 
 		 443 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3264  hypothetical protein  26.39 
 
 		 408 aa  109  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5316  major facilitator superfamily MFS_1  28.85 
 
 		 572 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3450  major facilitator transporter  26.48 
 
 		 436 aa  108  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0387  major facilitator transporter  30.54 
 
 		 437 aa  107  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0133748  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1317  major facilitator transporter  26.41 
 
 		 474 aa  108  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.8065  hitchhiker  0.00000263926 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1893  major facilitator superfamily MFS_1  29.66 
 
 		 458 aa  106  6e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.117856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2748  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 439 aa  104  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437943  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0150  major facilitator transporter  24.49 
 
 		 443 aa  102  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1085  major facilitator transporter  24.72 
 
 		 493 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.445039  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0458  hypothetical protein  23.75 
 
 		 427 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000401747  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0373  major facilitator transporter  23.99 
 
 		 427 aa  102  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000110963  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4238  major facilitator superfamily MFS_1  21.74 
 
 		 462 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.239966 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1700  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 		 472 aa  101  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12428  hypothetical protein  23.97 
 
 		 441 aa  100  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0597064  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3411  major facilitator superfamily MFS_1  29.11 
 
 		 469 aa  101  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0507  hypothetical protein  24.35 
 
 		 427 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.130258  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1817  hypothetical protein  25.5 
 
 		 455 aa  100  7e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404559  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0657  major facilitator transporter  31.61 
 
 		 449 aa  99.4  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.651323  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2342  hypothetical protein  30.48 
 
 		 464 aa  98.6  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00968844 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0507  hypothetical protein  24.59 
 
 		 427 aa  99  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0379  hypothetical protein  23.99 
 
 		 427 aa  97.8  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000021693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0370  major facilitator superfamily permease  23.99 
 
 		 427 aa  97.8  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.902830000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0367  major facilitator superfamily permease  23.99 
 
 		 427 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000714912  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0393  hypothetical protein  23.99 
 
 		 427 aa  97.8  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0437  hypothetical protein  23.99 
 
 		 427 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4866  hypothetical protein  23.75 
 
 		 427 aa  97.1  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0379  major facilitator transporter  23.91 
 
 		 427 aa  96.7  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000550837  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3188  major facilitator transporter  24.07 
 
 		 463 aa  96.3  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.988714 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3914  major facilitator superfamily MFS_1  21.01 
 
 		 462 aa  96.7  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.133818 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>