126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0160 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0160  major facilitator transporter  100 
 
 
462 aa  895    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0083  major facilitator transporter  77.49 
 
 
462 aa  704    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.339646  normal  0.26187 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0022  major facilitator transporter  79.15 
 
 
463 aa  708    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0721  major facilitator transporter  78.92 
 
 
465 aa  664    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0192  major facilitator transporter  89.15 
 
 
469 aa  813    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0322  major facilitator transporter  74.72 
 
 
467 aa  648    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169916  normal  0.209035 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0027  major facilitator superfamily MFS_1  75.96 
 
 
465 aa  673    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453112  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1429  major facilitator transporter  59.64 
 
 
466 aa  499  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218982  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1817  hypothetical protein  47.74 
 
 
455 aa  399  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404559  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3337  major facilitator superfamily (MFS) transporter  48.08 
 
 
443 aa  394  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4238  major facilitator superfamily MFS_1  46 
 
 
462 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.239966 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1085  major facilitator transporter  47.3 
 
 
493 aa  389  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.445039  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3914  major facilitator superfamily MFS_1  44.89 
 
 
462 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.133818 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3421  major facilitator transporter  47.73 
 
 
466 aa  384  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564111  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4369  hypothetical protein  45.75 
 
 
440 aa  369  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.486519  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0343  major facilitator transporter  43.78 
 
 
454 aa  362  6e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.911823 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3188  major facilitator transporter  45.37 
 
 
463 aa  356  5.999999999999999e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.988714 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0020  major facilitator transporter  47.22 
 
 
456 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.482167  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1317  major facilitator transporter  40.57 
 
 
474 aa  326  6e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.8065  hitchhiker  0.00000263926 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2937  major facilitator superfamily transporter  40.44 
 
 
435 aa  305  2.0000000000000002e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2658  major facilitator transporter  41.67 
 
 
469 aa  301  2e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.494745  normal  0.637588 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0030  major facilitator transporter  45.8 
 
 
456 aa  298  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550857  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1362  major facilitator transporter  45.35 
 
 
456 aa  293  5e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2130  major facilitator family transporter  39.33 
 
 
435 aa  288  1e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0193  transporter, MFS superfamily  39.33 
 
 
460 aa  287  2.9999999999999996e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1010  major facilitator transporter  41.22 
 
 
429 aa  286  5.999999999999999e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2662  major facilitator transporter  38.94 
 
 
460 aa  280  4e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3661  major facilitator transporter  41.18 
 
 
426 aa  280  5e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1316  major facilitator transporter  37.72 
 
 
492 aa  278  1e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.387007  hitchhiker  0.0000142592 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1842  major facilitator superfamily MFS_1  38.93 
 
 
451 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0334  hypothetical protein  36.76 
 
 
424 aa  265  1e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0315  hypothetical protein  35.84 
 
 
424 aa  255  1.0000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1654  major facilitator transporter  31.04 
 
 
416 aa  209  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1522  major facilitator superfamily MFS_1  31.4 
 
 
426 aa  208  2e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.101861  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3661  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
467 aa  199  6e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1624  major facilitator superfamily MFS_1  30.97 
 
 
421 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767884  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1324  MFS transporter family protein  30.36 
 
 
425 aa  192  7e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1472  major facilitator superfamily MFS_1  30.07 
 
 
419 aa  190  5e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.905727  normal  0.384031 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4202  hypothetical protein  31.58 
 
 
479 aa  187  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.246317  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3874  major facilitator transporter  34.4 
 
 
467 aa  187  5e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1012  major facilitator superfamily MFS_1  28.77 
 
 
428 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.389524 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0936  MFS transporter family protein  31.15 
 
 
458 aa  184  3e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0635  major facilitator superfamily MFS_1  33.01 
 
 
456 aa  183  7e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.636916  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0574  major facilitator superfamily MFS_1  33.63 
 
 
440 aa  180  4e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2368  major facilitator superfamily MFS_1  30.36 
 
 
445 aa  177  3e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.854492  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0568  major facilitator superfamily MFS_1  30.99 
 
 
468 aa  172  1e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00685546 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3166  major facilitator superfamily MFS_1  32.31 
 
 
462 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.704444  normal  0.18034 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1700  major facilitator superfamily MFS_1  29.87 
 
 
472 aa  167  5e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0146  major facilitator superfamily MFS_1  28.22 
 
 
414 aa  154  4e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.243784  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18980  major facilitator superfamily permease  30.2 
 
 
440 aa  154  4e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.273601  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2546  major facilitator transporter  30.25 
 
 
449 aa  148  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.146508  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25210  major facilitator superfamily permease  29.7 
 
 
449 aa  145  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.302409  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2069  major facilitator transporter  28.34 
 
 
460 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.692197  normal  0.259713 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22460  major facilitator superfamily MFS_1  28.79 
 
 
421 aa  139  7e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4097  major facilitator superfamily transporter  31.24 
 
 
443 aa  139  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1274  putative integral membrane protein  28.25 
 
 
430 aa  138  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0297  major facilitator superfamily MFS_1  30.47 
 
 
441 aa  134  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.321668  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2758  major facilitator transporter  27.67 
 
 
447 aa  133  7.999999999999999e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3786  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 
412 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0586  major facilitator superfamily MFS_1  28.32 
 
 
444 aa  127  5e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1854  major facilitator superfamily permease/ BtlA-like  28.82 
 
 
440 aa  126  9e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000121925  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3637  major facilitator transporter  29.89 
 
 
454 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35063  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3710  major facilitator superfamily transporter  29.89 
 
 
454 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.417195  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3642  major facilitator transporter  29.89 
 
 
454 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.266137  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01490  major facilitator superfamily permease  24.66 
 
 
408 aa  119  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0591182  normal  0.340851 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0458  hypothetical protein  25.39 
 
 
427 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000401747  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1090  putative permease  26.37 
 
 
425 aa  118  3e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0778903  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2713  major facilitator superfamily MFS_1  25.9 
 
 
424 aa  117  3.9999999999999997e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4866  hypothetical protein  24.55 
 
 
427 aa  114  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0373  major facilitator transporter  24.94 
 
 
427 aa  114  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000110963  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0030  permease  25.44 
 
 
437 aa  114  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345375  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0507  hypothetical protein  24.72 
 
 
427 aa  113  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.130258  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0507  hypothetical protein  25.06 
 
 
427 aa  113  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0379  hypothetical protein  25.06 
 
 
427 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000021693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0370  major facilitator superfamily permease  25.06 
 
 
427 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.902830000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0367  major facilitator superfamily permease  25.06 
 
 
427 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000714912  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0393  hypothetical protein  25.06 
 
 
427 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0437  hypothetical protein  25.06 
 
 
427 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0657  major facilitator transporter  29.67 
 
 
449 aa  111  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.651323  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1893  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 
458 aa  111  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.117856  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0379  major facilitator transporter  23.54 
 
 
427 aa  111  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000550837  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12530  leucine and alanine rich integral membrane protein  27.67 
 
 
445 aa  109  9.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0104482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1276  hypothetical protein  27.41 
 
 
431 aa  109  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.322939  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1904  major facilitator superfamily MFS_1  25.64 
 
 
430 aa  109  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2014  major facilitator transporter  25.06 
 
 
426 aa  107  5e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.273868  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5316  major facilitator superfamily MFS_1  26.43 
 
 
572 aa  106  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2708  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 
450 aa  106  9e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0342766  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3202  major facilitator superfamily MFS_1  23.69 
 
 
444 aa  103  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0335  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 
454 aa  103  8e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.121875 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2515  major facilitator superfamily MFS_1  24.67 
 
 
433 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0406  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 
404 aa  102  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3264  hypothetical protein  26.64 
 
 
408 aa  100  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0387  major facilitator transporter  26.95 
 
 
437 aa  98.6  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0133748  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1758  putative transporter  25.1 
 
 
460 aa  97.1  7e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2301  major facilitator superfamily permease  25.06 
 
 
453 aa  96.7  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.334509  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2748  major facilitator transporter  23.87 
 
 
439 aa  95.9  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437943  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1838  major facilitator superfamily MFS_1  27.9 
 
 
439 aa  95.9  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.047376  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3164  major facilitator superfamily permease  24.39 
 
 
453 aa  95.5  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263181  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2044  major facilitator transporter  26.67 
 
 
436 aa  94.7  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0220318 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14630  major facilitator superfamily permease  25.86 
 
 
462 aa  94.4  4e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.415319 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>