124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1317 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1317  major facilitator transporter  100 
 
 		 474 aa  936    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.8065  hitchhiker  0.00000263926 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1316  major facilitator transporter  40.73 
 
 		 492 aa  354  2e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.387007  hitchhiker  0.0000142592 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0160  major facilitator transporter  40.57 
 
 		 462 aa  343  5e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0083  major facilitator transporter  40.99 
 
 		 462 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.339646  normal  0.26187 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0027  major facilitator superfamily MFS_1  40.09 
 
 		 465 aa  333  5e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453112  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0192  major facilitator transporter  39.82 
 
 		 469 aa  331  2e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0022  major facilitator transporter  40.14 
 
 		 463 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0322  major facilitator transporter  40.24 
 
 		 467 aa  320  3e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169916  normal  0.209035 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0721  major facilitator transporter  39.57 
 
 		 465 aa  312  7.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1429  major facilitator transporter  39.3 
 
 		 466 aa  311  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218982  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4238  major facilitator superfamily MFS_1  35.76 
 
 		 462 aa  293  7e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.239966 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3914  major facilitator superfamily MFS_1  35.19 
 
 		 462 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.133818 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3421  major facilitator transporter  36.8 
 
 		 466 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564111  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3188  major facilitator transporter  38.24 
 
 		 463 aa  276  7e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.988714 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4369  hypothetical protein  35.39 
 
 		 440 aa  274  3e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.486519  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1817  hypothetical protein  35.43 
 
 		 455 aa  268  1e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404559  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3337  major facilitator superfamily (MFS) transporter  37.07 
 
 		 443 aa  268  1e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2937  major facilitator superfamily transporter  33.92 
 
 		 435 aa  263  8e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1085  major facilitator transporter  35.75 
 
 		 493 aa  258  1e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.445039  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2130  major facilitator family transporter  35.91 
 
 		 435 aa  258  1e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0193  transporter, MFS superfamily  35.91 
 
 		 460 aa  254  2.0000000000000002e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0343  major facilitator transporter  36.91 
 
 		 454 aa  253  6e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.911823 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4202  hypothetical protein  34.71 
 
 		 479 aa  251  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.246317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1010  major facilitator transporter  34.43 
 
 		 429 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0315  hypothetical protein  33.26 
 
 		 424 aa  238  3e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2658  major facilitator transporter  34.48 
 
 		 469 aa  236  9e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.494745  normal  0.637588 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0334  hypothetical protein  34.01 
 
 		 424 aa  234  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3661  major facilitator transporter  34.99 
 
 		 426 aa  219  7e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2662  major facilitator transporter  33.79 
 
 		 460 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0020  major facilitator transporter  34.38 
 
 		 456 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.482167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1842  major facilitator superfamily MFS_1  33.04 
 
 		 451 aa  212  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3661  major facilitator superfamily MFS_1  32.37 
 
 		 467 aa  186  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0030  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 456 aa  179  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1362  major facilitator transporter  33.56 
 
 		 456 aa  178  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0635  major facilitator superfamily MFS_1  29.83 
 
 		 456 aa  170  5e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.636916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3874  major facilitator transporter  32.67 
 
 		 467 aa  169  8e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1522  major facilitator superfamily MFS_1  28.89 
 
 		 426 aa  168  2e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.101861  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1624  major facilitator superfamily MFS_1  28.67 
 
 		 421 aa  157  3e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767884  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1472  major facilitator superfamily MFS_1  27.44 
 
 		 419 aa  156  6e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.905727  normal  0.384031 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1012  major facilitator superfamily MFS_1  28.64 
 
 		 428 aa  156  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.389524 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1654  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 416 aa  148  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0936  MFS transporter family protein  25.89 
 
 		 458 aa  145  1e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2368  major facilitator superfamily MFS_1  28.23 
 
 		 445 aa  145  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.854492  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1324  MFS transporter family protein  28.38 
 
 		 425 aa  145  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3166  major facilitator superfamily MFS_1  29.87 
 
 		 462 aa  145  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.704444  normal  0.18034 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0574  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 		 440 aa  144  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25210  major facilitator superfamily permease  25.32 
 
 		 449 aa  142  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.302409  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0568  major facilitator superfamily MFS_1  25.94 
 
 		 468 aa  137  4e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685546 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2546  major facilitator transporter  25.39 
 
 		 449 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.146508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18980  major facilitator superfamily permease  28.05 
 
 		 440 aa  134  3.9999999999999996e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.273601  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1700  major facilitator superfamily MFS_1  25.92 
 
 		 472 aa  133  5e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22460  major facilitator superfamily MFS_1  27.35 
 
 		 421 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3786  major facilitator superfamily MFS_1  26.77 
 
 		 412 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4097  major facilitator superfamily transporter  25 
 
 		 443 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2069  major facilitator transporter  28.43 
 
 		 460 aa  113  7.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.692197  normal  0.259713 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0458  hypothetical protein  25.32 
 
 		 427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000401747  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0379  hypothetical protein  25.11 
 
 		 427 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000021693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0370  major facilitator superfamily permease  25.11 
 
 		 427 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.902830000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0367  major facilitator superfamily permease  25.11 
 
 		 427 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000714912  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0393  hypothetical protein  25.11 
 
 		 427 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2758  major facilitator transporter  23.94 
 
 		 447 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0437  hypothetical protein  25.11 
 
 		 427 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0507  hypothetical protein  25.11 
 
 		 427 aa  111  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4866  hypothetical protein  25.7 
 
 		 427 aa  111  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0507  hypothetical protein  25.11 
 
 		 427 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.130258  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0379  major facilitator transporter  24.78 
 
 		 427 aa  110  6e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000550837  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1274  putative integral membrane protein  26.5 
 
 		 430 aa  108  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0373  major facilitator transporter  24.84 
 
 		 427 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000110963  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0146  major facilitator superfamily MFS_1  24.27 
 
 		 414 aa  108  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.243784  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01490  major facilitator superfamily permease  23.7 
 
 		 408 aa  102  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0591182  normal  0.340851 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3450  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 436 aa  102  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2014  major facilitator transporter  24.3 
 
 		 426 aa  102  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.273868  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3202  major facilitator superfamily MFS_1  23.22 
 
 		 444 aa  102  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1854  major facilitator superfamily permease/ BtlA-like  22.35 
 
 		 440 aa  100  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000121925  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0297  major facilitator superfamily MFS_1  26.28 
 
 		 441 aa  99.8  9e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.321668  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0335  major facilitator superfamily MFS_1  29.43 
 
 		 454 aa  99  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.121875 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3637  major facilitator transporter  26.11 
 
 		 454 aa  98.2  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35063  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3710  major facilitator superfamily transporter  26.11 
 
 		 454 aa  98.2  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.417195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3642  major facilitator transporter  26.11 
 
 		 454 aa  98.2  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.266137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2301  major facilitator superfamily permease  25.76 
 
 		 453 aa  98.2  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.334509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0390  major facilitator superfamily permease  23.71 
 
 		 446 aa  97.8  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.778281  normal  0.55351 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2713  major facilitator superfamily MFS_1  25.34 
 
 		 424 aa  94.7  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3164  major facilitator superfamily permease  25 
 
 		 453 aa  94.7  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263181  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3264  hypothetical protein  22.22 
 
 		 408 aa  92.8  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5316  major facilitator superfamily MFS_1  24.34 
 
 		 572 aa  92.8  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1217  major facilitator superfamily MFS_1  25.97 
 
 		 432 aa  91.3  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1758  putative transporter  24.53 
 
 		 460 aa  90.1  8e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0387  major facilitator transporter  26.19 
 
 		 437 aa  89.7  9e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0133748  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1090  putative permease  24.61 
 
 		 425 aa  86.3  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0778903  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21750  major facilitator superfamily permease  25 
 
 		 474 aa  86.3  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.109771  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0657  major facilitator transporter  26.57 
 
 		 449 aa  84.3  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.651323  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1838  major facilitator superfamily MFS_1  25.87 
 
 		 439 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.047376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0030  permease  19.25 
 
 		 437 aa  82  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345375  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2972  major facilitator superfamily MFS_1  23.08 
 
 		 442 aa  81.3  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.737462  normal  0.183542 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1904  major facilitator superfamily MFS_1  21.51 
 
 		 430 aa  81.3  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2251  major facilitator superfamily MFS_1  21.74 
 
 		 439 aa  80.5  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2277  major facilitator superfamily MFS_1  23.85 
 
 		 469 aa  79.7  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.419016  normal  0.219783 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1276  hypothetical protein  23.92 
 
 		 431 aa  79.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.322939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0150  major facilitator transporter  22.13 
 
 		 443 aa  78.6  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2515  major facilitator superfamily MFS_1  24.26 
 
 		 433 aa  78.2  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>