123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2546 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2546  major facilitator transporter  100 
 
 
449 aa  871    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.146508  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4097  major facilitator superfamily transporter  81.36 
 
 
443 aa  632  1e-180  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3637  major facilitator transporter  69.4 
 
 
454 aa  536  1e-151  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35063  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3710  major facilitator superfamily transporter  69.4 
 
 
454 aa  536  1e-151  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.417195  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3642  major facilitator transporter  69.4 
 
 
454 aa  536  1e-151  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.266137  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12530  leucine and alanine rich integral membrane protein  65.12 
 
 
445 aa  473  1e-132  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0104482 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2368  major facilitator superfamily MFS_1  52.87 
 
 
445 aa  407  1.0000000000000001e-112  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.854492  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0574  major facilitator superfamily MFS_1  50.37 
 
 
440 aa  374  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18980  major facilitator superfamily permease  42.73 
 
 
440 aa  279  8e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.273601  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3661  major facilitator superfamily MFS_1  39.81 
 
 
467 aa  276  6e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3166  major facilitator superfamily MFS_1  44.04 
 
 
462 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.704444  normal  0.18034 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3874  major facilitator transporter  40.19 
 
 
467 aa  268  1e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25210  major facilitator superfamily permease  38.5 
 
 
449 aa  263  6.999999999999999e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.302409  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0635  major facilitator superfamily MFS_1  40.37 
 
 
456 aa  258  1e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.636916  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1700  major facilitator superfamily MFS_1  37.22 
 
 
472 aa  254  3e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0568  major facilitator superfamily MFS_1  37.96 
 
 
468 aa  252  1e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00685546 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2937  major facilitator superfamily transporter  32.49 
 
 
435 aa  210  4e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2130  major facilitator family transporter  31.13 
 
 
435 aa  209  1e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0193  transporter, MFS superfamily  30.02 
 
 
460 aa  204  2e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1010  major facilitator transporter  33.02 
 
 
429 aa  196  6e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1842  major facilitator superfamily MFS_1  35.25 
 
 
451 aa  196  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0315  hypothetical protein  28.03 
 
 
424 aa  173  5.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0027  major facilitator superfamily MFS_1  29.48 
 
 
465 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453112  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0334  hypothetical protein  27.95 
 
 
424 aa  170  6e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3661  major facilitator transporter  32.05 
 
 
426 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0083  major facilitator transporter  30.02 
 
 
462 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.339646  normal  0.26187 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3337  major facilitator superfamily (MFS) transporter  31.28 
 
 
443 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0343  major facilitator transporter  29.67 
 
 
454 aa  160  3e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.911823 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0192  major facilitator transporter  29.83 
 
 
469 aa  159  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0022  major facilitator transporter  29.27 
 
 
463 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0160  major facilitator transporter  30.59 
 
 
462 aa  152  8.999999999999999e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0721  major facilitator transporter  30.24 
 
 
465 aa  151  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2658  major facilitator transporter  30.96 
 
 
469 aa  149  7e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.494745  normal  0.637588 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0322  major facilitator transporter  29.06 
 
 
467 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169916  normal  0.209035 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1654  major facilitator transporter  28.2 
 
 
416 aa  147  5e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1472  major facilitator superfamily MFS_1  29.08 
 
 
419 aa  143  5e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.905727  normal  0.384031 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3421  major facilitator transporter  30.57 
 
 
466 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564111  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1522  major facilitator superfamily MFS_1  27.02 
 
 
426 aa  140  3e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.101861  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1012  major facilitator superfamily MFS_1  29.21 
 
 
428 aa  136  7.000000000000001e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.389524 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0020  major facilitator transporter  30.2 
 
 
456 aa  136  8e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.482167  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4238  major facilitator superfamily MFS_1  26.26 
 
 
462 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.239966 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1324  MFS transporter family protein  30.02 
 
 
425 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2662  major facilitator transporter  31.16 
 
 
460 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3914  major facilitator superfamily MFS_1  25.87 
 
 
462 aa  132  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.133818 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1624  major facilitator superfamily MFS_1  26.85 
 
 
421 aa  127  3e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767884  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1429  major facilitator transporter  28.38 
 
 
466 aa  125  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218982  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4369  hypothetical protein  27.57 
 
 
440 aa  124  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.486519  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1317  major facilitator transporter  25.27 
 
 
474 aa  123  6e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.8065  hitchhiker  0.00000263926 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0936  MFS transporter family protein  27.27 
 
 
458 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2758  major facilitator transporter  28.29 
 
 
447 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0030  major facilitator transporter  30.73 
 
 
456 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550857  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1362  major facilitator transporter  30.68 
 
 
456 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1085  major facilitator transporter  25.79 
 
 
493 aa  119  9e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.445039  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0146  major facilitator superfamily MFS_1  29.14 
 
 
414 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.243784  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1316  major facilitator transporter  28.45 
 
 
492 aa  112  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.387007  hitchhiker  0.0000142592 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3188  major facilitator transporter  26.97 
 
 
463 aa  111  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.988714 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1758  putative transporter  27.09 
 
 
460 aa  108  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1274  putative integral membrane protein  29.08 
 
 
430 aa  108  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1817  hypothetical protein  24.73 
 
 
455 aa  107  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404559  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2708  major facilitator superfamily MFS_1  28.05 
 
 
450 aa  106  9e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0342766  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2515  major facilitator superfamily MFS_1  28.22 
 
 
433 aa  103  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3202  major facilitator superfamily MFS_1  21.71 
 
 
444 aa  102  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1838  major facilitator superfamily MFS_1  27.42 
 
 
439 aa  99.4  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.047376  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1854  major facilitator superfamily permease/ BtlA-like  27.69 
 
 
440 aa  98.2  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000121925  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5507  major facilitator superfamily permease/BtlA- like protein  27.03 
 
 
451 aa  97.4  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.462661  normal  0.0808457 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1801  major facilitator superfamily protein  26.44 
 
 
448 aa  95.9  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.640412  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21750  major facilitator superfamily permease  26.34 
 
 
474 aa  95.1  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.109771  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0657  major facilitator transporter  28.77 
 
 
449 aa  94.4  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.651323  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3264  hypothetical protein  27.27 
 
 
408 aa  90.9  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2044  major facilitator transporter  26.3 
 
 
436 aa  89.4  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0220318 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4866  hypothetical protein  21.73 
 
 
427 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0507  hypothetical protein  21.65 
 
 
427 aa  86.7  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0458  hypothetical protein  21.5 
 
 
427 aa  86.7  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000401747  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0379  hypothetical protein  21.72 
 
 
427 aa  86.7  9e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000021693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0370  major facilitator superfamily permease  21.72 
 
 
427 aa  86.7  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.902830000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0367  major facilitator superfamily permease  21.72 
 
 
427 aa  86.7  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000714912  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0393  hypothetical protein  21.72 
 
 
427 aa  86.7  9e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0437  hypothetical protein  21.72 
 
 
427 aa  86.7  9e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0507  hypothetical protein  21.43 
 
 
427 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.130258  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2972  major facilitator superfamily MFS_1  25.23 
 
 
442 aa  85.1  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.737462  normal  0.183542 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0379  major facilitator transporter  20.89 
 
 
427 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000550837  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22460  major facilitator superfamily MFS_1  21.7 
 
 
421 aa  84.3  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0373  major facilitator transporter  21.72 
 
 
427 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000110963  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0390  major facilitator superfamily permease  25.29 
 
 
446 aa  82.4  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.778281  normal  0.55351 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0387  major facilitator transporter  27.73 
 
 
437 aa  80.1  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0133748  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2485  hypothetical protein  24.19 
 
 
464 aa  80.1  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2301  major facilitator superfamily permease  24.65 
 
 
453 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.334509  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3411  major facilitator superfamily MFS_1  24.6 
 
 
469 aa  78.2  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2342  hypothetical protein  24.03 
 
 
464 aa  77.8  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00968844 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1217  major facilitator superfamily MFS_1  27.53 
 
 
432 aa  77.4  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3164  major facilitator superfamily permease  24.36 
 
 
453 aa  76.3  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263181  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3786  major facilitator superfamily MFS_1  23.15 
 
 
412 aa  75.9  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2713  major facilitator superfamily MFS_1  22.67 
 
 
424 aa  75.1  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2277  major facilitator superfamily MFS_1  25.49 
 
 
469 aa  74.7  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.419016  normal  0.219783 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0335  major facilitator superfamily MFS_1  27.17 
 
 
454 aa  73.6  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.121875 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2069  major facilitator transporter  26.6 
 
 
460 aa  73.2  0.000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.692197  normal  0.259713 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2328  major facilitator transporter  23.66 
 
 
465 aa  71.2  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0297  major facilitator superfamily MFS_1  25.55 
 
 
441 aa  71.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.321668  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0406  major facilitator superfamily MFS_1  22.67 
 
 
404 aa  69.3  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5316  major facilitator superfamily MFS_1  24.57 
 
 
572 aa  68.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>