128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2301 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2301  major facilitator superfamily permease  100 
 
 		 453 aa  893    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.334509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3164  major facilitator superfamily permease  95.14 
 
 		 453 aa  831    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0390  major facilitator superfamily permease  73.59 
 
 		 446 aa  599  1e-170  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.778281  normal  0.55351 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1801  major facilitator superfamily protein  56.72 
 
 		 448 aa  434  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.640412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2708  major facilitator superfamily MFS_1  53.32 
 
 		 450 aa  415  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0342766  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2972  major facilitator superfamily MFS_1  53.51 
 
 		 442 aa  409  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.737462  normal  0.183542 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5507  major facilitator superfamily permease/BtlA- like protein  52.51 
 
 		 451 aa  405  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.462661  normal  0.0808457 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1758  putative transporter  52.28 
 
 		 460 aa  404  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2328  major facilitator transporter  49.24 
 
 		 465 aa  399  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21750  major facilitator superfamily permease  47.31 
 
 		 474 aa  401  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.109771  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2485  hypothetical protein  55.13 
 
 		 464 aa  397  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2342  hypothetical protein  54.95 
 
 		 464 aa  392  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00968844 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3411  major facilitator superfamily MFS_1  49.67 
 
 		 469 aa  379  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14630  major facilitator superfamily permease  47.8 
 
 		 462 aa  377  1e-103  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5316  major facilitator superfamily MFS_1  45.78 
 
 		 572 aa  366  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1893  major facilitator superfamily MFS_1  46.67 
 
 		 458 aa  350  3e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.117856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2670  major facilitator transporter  50.89 
 
 		 458 aa  348  1e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.88531  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2277  major facilitator superfamily MFS_1  43.56 
 
 		 469 aa  347  2e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.419016  normal  0.219783 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1854  major facilitator superfamily permease/ BtlA-like  42.33 
 
 		 440 aa  285  9e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000121925  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2251  major facilitator superfamily MFS_1  37.35 
 
 		 439 aa  280  6e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0030  permease  36.1 
 
 		 437 aa  263  6e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345375  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22460  major facilitator superfamily MFS_1  37.33 
 
 		 421 aa  260  4e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2003  permease  33.41 
 
 		 435 aa  239  1e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.307053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1904  major facilitator superfamily MFS_1  32.25 
 
 		 430 aa  232  1e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1276  hypothetical protein  33.88 
 
 		 431 aa  227  3e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.322939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0150  major facilitator transporter  34.57 
 
 		 443 aa  219  7e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0335  major facilitator superfamily MFS_1  37.06 
 
 		 454 aa  213  3.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.121875 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12428  hypothetical protein  34.77 
 
 		 441 aa  209  1e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0597064  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2748  major facilitator transporter  32.19 
 
 		 439 aa  207  5e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437943  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3450  major facilitator transporter  34.35 
 
 		 436 aa  202  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1838  major facilitator superfamily MFS_1  38.64 
 
 		 439 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.047376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1522  major facilitator superfamily MFS_1  31.55 
 
 		 426 aa  189  7e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.101861  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1472  major facilitator superfamily MFS_1  31.64 
 
 		 419 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.905727  normal  0.384031 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1720  major facilitator transporter  39.11 
 
 		 454 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.493867 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0507  hypothetical protein  29.15 
 
 		 427 aa  181  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.130258  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3786  major facilitator superfamily MFS_1  30.05 
 
 		 412 aa  181  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0458  hypothetical protein  29.15 
 
 		 427 aa  180  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000401747  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0406  major facilitator superfamily MFS_1  33.1 
 
 		 404 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1842  major facilitator superfamily MFS_1  36.04 
 
 		 451 aa  179  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4866  hypothetical protein  29.62 
 
 		 427 aa  178  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1324  MFS transporter family protein  30.89 
 
 		 425 aa  178  2e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0936  MFS transporter family protein  32.6 
 
 		 458 aa  178  2e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0373  major facilitator transporter  28.77 
 
 		 427 aa  178  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000110963  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0507  hypothetical protein  29 
 
 		 427 aa  177  4e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0379  major facilitator transporter  28.74 
 
 		 427 aa  177  5e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000550837  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0379  hypothetical protein  29 
 
 		 427 aa  176  6e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000021693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0370  major facilitator superfamily permease  29 
 
 		 427 aa  176  6e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.902830000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0367  major facilitator superfamily permease  29 
 
 		 427 aa  176  6e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000714912  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0393  hypothetical protein  29 
 
 		 427 aa  176  6e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0437  hypothetical protein  29 
 
 		 427 aa  176  6e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1624  major facilitator superfamily MFS_1  31.94 
 
 		 421 aa  176  7e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767884  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1654  major facilitator transporter  31.46 
 
 		 416 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1012  major facilitator superfamily MFS_1  32.62 
 
 		 428 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.389524 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2758  major facilitator transporter  28.67 
 
 		 447 aa  172  7.999999999999999e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1274  putative integral membrane protein  31.35 
 
 		 430 aa  170  6e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01490  major facilitator superfamily permease  27.93 
 
 		 408 aa  169  8e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0591182  normal  0.340851 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0315  hypothetical protein  27.61 
 
 		 424 aa  161  2e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2713  major facilitator superfamily MFS_1  26.48 
 
 		 424 aa  157  3e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3661  major facilitator transporter  30.42 
 
 		 426 aa  156  9e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2069  major facilitator transporter  28.83 
 
 		 460 aa  155  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.692197  normal  0.259713 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2130  major facilitator family transporter  29.04 
 
 		 435 aa  154  2.9999999999999998e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0334  hypothetical protein  27.15 
 
 		 424 aa  153  5.9999999999999996e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0193  transporter, MFS superfamily  29.27 
 
 		 460 aa  152  1e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2014  major facilitator transporter  29.7 
 
 		 426 aa  147  3e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.273868  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1090  putative permease  28.43 
 
 		 425 aa  147  3e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0778903  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4238  major facilitator superfamily MFS_1  27.88 
 
 		 462 aa  143  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.239966 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2937  major facilitator superfamily transporter  26.44 
 
 		 435 aa  142  9e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3914  major facilitator superfamily MFS_1  26.99 
 
 		 462 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.133818 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0146  major facilitator superfamily MFS_1  29.45 
 
 		 414 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.243784  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1010  major facilitator transporter  28.38 
 
 		 429 aa  139  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2515  major facilitator superfamily MFS_1  29.56 
 
 		 433 aa  137  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0083  major facilitator transporter  29.11 
 
 		 462 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.339646  normal  0.26187 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0022  major facilitator transporter  27.95 
 
 		 463 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0027  major facilitator superfamily MFS_1  28.42 
 
 		 465 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453112  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1085  major facilitator transporter  27.17 
 
 		 493 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.445039  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4369  hypothetical protein  28.11 
 
 		 440 aa  128  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.486519  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0635  major facilitator superfamily MFS_1  29.55 
 
 		 456 aa  126  7e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.636916  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1817  hypothetical protein  26.37 
 
 		 455 aa  126  9e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404559  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2044  major facilitator transporter  27.7 
 
 		 436 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0220318 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07437  Autophagy-related protein 22-1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AW93]  25.46 
 
 		 588 aa  125  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0083743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3337  major facilitator superfamily (MFS) transporter  26.95 
 
 		 443 aa  123  7e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0721  major facilitator transporter  28.42 
 
 		 465 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2368  major facilitator superfamily MFS_1  26.27 
 
 		 445 aa  121  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.854492  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0574  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 		 440 aa  121  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0192  major facilitator transporter  26.74 
 
 		 469 aa  120  7e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1700  major facilitator superfamily MFS_1  27.56 
 
 		 472 aa  117  6e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0568  major facilitator superfamily MFS_1  27.57 
 
 		 468 aa  116  6.9999999999999995e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685546 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0322  major facilitator transporter  27 
 
 		 467 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169916  normal  0.209035 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3166  major facilitator superfamily MFS_1  27.15 
 
 		 462 aa  114  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.704444  normal  0.18034 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0160  major facilitator transporter  26.83 
 
 		 462 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0586  major facilitator superfamily MFS_1  26.17 
 
 		 444 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0179532 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07591  Autophagy-related protein 22-2 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AVT9]  28.4 
 
 		 593 aa  109  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0297  major facilitator superfamily MFS_1  27.18 
 
 		 441 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.321668  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0343  major facilitator transporter  25 
 
 		 454 aa  108  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.911823 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3188  major facilitator transporter  26.86 
 
 		 463 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.988714 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3874  major facilitator transporter  26.44 
 
 		 467 aa  106  7e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3202  major facilitator superfamily MFS_1  23.17 
 
 		 444 aa  106  9e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25210  major facilitator superfamily permease  25.68 
 
 		 449 aa  105  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.302409  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18980  major facilitator superfamily permease  28.77 
 
 		 440 aa  105  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.273601  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3661  major facilitator superfamily MFS_1  25.97 
 
 		 467 aa  105  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>