171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1472 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1472  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
419 aa  831    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.905727  normal  0.384031 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1012  major facilitator superfamily MFS_1  76.2 
 
 
428 aa  620  1e-176  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.389524 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1522  major facilitator superfamily MFS_1  70 
 
 
426 aa  589  1e-167  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.101861  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1624  major facilitator superfamily MFS_1  72.05 
 
 
421 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767884  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1654  major facilitator transporter  69.73 
 
 
416 aa  556  1e-157  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1324  MFS transporter family protein  67.32 
 
 
425 aa  545  1e-154  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0936  MFS transporter family protein  61.16 
 
 
458 aa  508  1e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1842  major facilitator superfamily MFS_1  40.24 
 
 
451 aa  271  2e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1010  major facilitator transporter  36.06 
 
 
429 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2758  major facilitator transporter  35.45 
 
 
447 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0146  major facilitator superfamily MFS_1  33.9 
 
 
414 aa  237  3e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.243784  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2937  major facilitator superfamily transporter  32.37 
 
 
435 aa  233  7.000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0334  hypothetical protein  34.38 
 
 
424 aa  229  5e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1274  putative integral membrane protein  33.92 
 
 
430 aa  225  1e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1854  major facilitator superfamily permease/ BtlA-like  36.12 
 
 
440 aa  223  4e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000121925  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0315  hypothetical protein  33.41 
 
 
424 aa  221  9.999999999999999e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2130  major facilitator family transporter  31.59 
 
 
435 aa  214  2.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22460  major facilitator superfamily MFS_1  31.62 
 
 
421 aa  213  7e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2515  major facilitator superfamily MFS_1  33.41 
 
 
433 aa  209  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0193  transporter, MFS superfamily  31.35 
 
 
460 aa  209  1e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2044  major facilitator transporter  33.02 
 
 
436 aa  207  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0220318 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0160  major facilitator transporter  30.07 
 
 
462 aa  202  9e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0192  major facilitator transporter  30.11 
 
 
469 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1429  major facilitator transporter  30.99 
 
 
466 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218982  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0022  major facilitator transporter  29.5 
 
 
463 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0030  permease  30.32 
 
 
437 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345375  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3661  major facilitator transporter  32.52 
 
 
426 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0027  major facilitator superfamily MFS_1  29.53 
 
 
465 aa  196  7e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453112  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3202  major facilitator superfamily MFS_1  31.21 
 
 
444 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2069  major facilitator transporter  31.75 
 
 
460 aa  191  2.9999999999999997e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.692197  normal  0.259713 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3786  major facilitator superfamily MFS_1  31.06 
 
 
412 aa  189  7e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0083  major facilitator transporter  29.95 
 
 
462 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.339646  normal  0.26187 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1217  major facilitator superfamily MFS_1  34.21 
 
 
432 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01490  major facilitator superfamily permease  27.9 
 
 
408 aa  182  7e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0591182  normal  0.340851 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0297  major facilitator superfamily MFS_1  31.85 
 
 
441 aa  182  8.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.321668  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0507  hypothetical protein  30.62 
 
 
427 aa  182  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.130258  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1276  hypothetical protein  29.7 
 
 
431 aa  181  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.322939  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2301  major facilitator superfamily permease  31.64 
 
 
453 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.334509  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0458  hypothetical protein  30.38 
 
 
427 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000401747  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0586  major facilitator superfamily MFS_1  31.06 
 
 
444 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0379  major facilitator transporter  30.68 
 
 
427 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000550837  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4866  hypothetical protein  30.62 
 
 
427 aa  180  4e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0406  major facilitator superfamily MFS_1  31.13 
 
 
404 aa  180  4e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0507  hypothetical protein  30.68 
 
 
427 aa  180  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3264  hypothetical protein  31.72 
 
 
408 aa  178  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0322  major facilitator transporter  28.27 
 
 
467 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169916  normal  0.209035 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0379  hypothetical protein  30.75 
 
 
427 aa  177  4e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000021693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0370  major facilitator superfamily permease  30.75 
 
 
427 aa  177  4e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.902830000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0367  major facilitator superfamily permease  30.75 
 
 
427 aa  177  4e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000714912  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0393  hypothetical protein  30.75 
 
 
427 aa  177  4e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3421  major facilitator transporter  29.98 
 
 
466 aa  177  4e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564111  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0437  hypothetical protein  30.75 
 
 
427 aa  177  4e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3164  major facilitator superfamily permease  31.64 
 
 
453 aa  177  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263181  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0373  major facilitator transporter  30.75 
 
 
427 aa  177  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000110963  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3337  major facilitator superfamily (MFS) transporter  29.37 
 
 
443 aa  176  5e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0721  major facilitator transporter  28.64 
 
 
465 aa  176  8e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3450  major facilitator transporter  30.63 
 
 
436 aa  176  9e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2003  permease  28.77 
 
 
435 aa  175  9.999999999999999e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.307053  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2251  major facilitator superfamily MFS_1  27.23 
 
 
439 aa  175  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0343  major facilitator transporter  30.07 
 
 
454 aa  174  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.911823 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2014  major facilitator transporter  30.58 
 
 
426 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.273868  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1758  putative transporter  32.11 
 
 
460 aa  171  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2972  major facilitator superfamily MFS_1  31.47 
 
 
442 aa  170  5e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.737462  normal  0.183542 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2713  major facilitator superfamily MFS_1  28.79 
 
 
424 aa  169  6e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3914  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 
462 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.133818 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4238  major facilitator superfamily MFS_1  26.11 
 
 
462 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.239966 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1090  putative permease  28 
 
 
425 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0778903  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1801  major facilitator superfamily protein  30.38 
 
 
448 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.640412  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2328  major facilitator transporter  29.7 
 
 
465 aa  165  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1904  major facilitator superfamily MFS_1  27.93 
 
 
430 aa  162  7e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0335  major facilitator superfamily MFS_1  29.2 
 
 
454 aa  162  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.121875 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1316  major facilitator transporter  29.98 
 
 
492 aa  160  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.387007  hitchhiker  0.0000142592 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1085  major facilitator transporter  28.01 
 
 
493 aa  159  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.445039  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3661  major facilitator superfamily MFS_1  29.62 
 
 
467 aa  157  4e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1838  major facilitator superfamily MFS_1  30.75 
 
 
439 aa  156  6e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.047376  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0390  major facilitator superfamily permease  29.75 
 
 
446 aa  155  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.778281  normal  0.55351 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2708  major facilitator superfamily MFS_1  29.98 
 
 
450 aa  155  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0342766  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1817  hypothetical protein  27.03 
 
 
455 aa  154  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404559  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1893  major facilitator superfamily MFS_1  29.65 
 
 
458 aa  154  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.117856  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1317  major facilitator transporter  28.12 
 
 
474 aa  155  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.8065  hitchhiker  0.00000263926 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0150  major facilitator transporter  27.65 
 
 
443 aa  154  2.9999999999999998e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4369  hypothetical protein  26.35 
 
 
440 aa  152  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.486519  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2658  major facilitator transporter  27.91 
 
 
469 aa  152  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.494745  normal  0.637588 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3166  major facilitator superfamily MFS_1  27.97 
 
 
462 aa  150  4e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.704444  normal  0.18034 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3874  major facilitator transporter  29.7 
 
 
467 aa  150  6e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2662  major facilitator transporter  28.24 
 
 
460 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0657  major facilitator transporter  32.27 
 
 
449 aa  147  5e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.651323  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3188  major facilitator transporter  26.83 
 
 
463 aa  146  6e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.988714 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1720  major facilitator transporter  31.98 
 
 
454 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.493867 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0635  major facilitator superfamily MFS_1  28.76 
 
 
456 aa  145  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.636916  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0387  major facilitator transporter  31.94 
 
 
437 aa  144  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0133748  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2546  major facilitator transporter  28.75 
 
 
449 aa  144  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.146508  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2368  major facilitator superfamily MFS_1  26.97 
 
 
445 aa  143  5e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.854492  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25210  major facilitator superfamily permease  28.9 
 
 
449 aa  142  8e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.302409  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21750  major facilitator superfamily permease  26.46 
 
 
474 aa  142  8e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.109771  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0568  major facilitator superfamily MFS_1  26.95 
 
 
468 aa  142  9e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00685546 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2277  major facilitator superfamily MFS_1  27 
 
 
469 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.419016  normal  0.219783 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14630  major facilitator superfamily permease  29.22 
 
 
462 aa  139  6e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.415319 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2342  hypothetical protein  30.16 
 
 
464 aa  139  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00968844 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0574  major facilitator superfamily MFS_1  27.23 
 
 
440 aa  137  5e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>