121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0297 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0297  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 441 aa  858    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.321668  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2069  major facilitator transporter  66.05 
 
 		 460 aa  542  1e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.692197  normal  0.259713 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2014  major facilitator transporter  61.81 
 
 		 426 aa  511  1e-144  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.273868  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0586  major facilitator superfamily MFS_1  65.49 
 
 		 444 aa  505  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2758  major facilitator transporter  38.53 
 
 		 447 aa  265  1e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0146  major facilitator superfamily MFS_1  37.91 
 
 		 414 aa  257  2e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.243784  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1274  putative integral membrane protein  38.48 
 
 		 430 aa  237  3e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2044  major facilitator transporter  38.27 
 
 		 436 aa  235  9e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0220318 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1324  MFS transporter family protein  35.66 
 
 		 425 aa  224  2e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2515  major facilitator superfamily MFS_1  36.4 
 
 		 433 aa  216  4e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1624  major facilitator superfamily MFS_1  34.22 
 
 		 421 aa  213  5.999999999999999e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767884  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1522  major facilitator superfamily MFS_1  33.74 
 
 		 426 aa  213  7.999999999999999e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.101861  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1654  major facilitator transporter  33.01 
 
 		 416 aa  204  3e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1012  major facilitator superfamily MFS_1  33.93 
 
 		 428 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.389524 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1472  major facilitator superfamily MFS_1  32.04 
 
 		 419 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.905727  normal  0.384031 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1842  major facilitator superfamily MFS_1  33.87 
 
 		 451 aa  187  3e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0936  MFS transporter family protein  29.39 
 
 		 458 aa  163  7e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0334  hypothetical protein  29.75 
 
 		 424 aa  161  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0022  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 463 aa  159  9e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0160  major facilitator transporter  30.68 
 
 		 462 aa  154  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0322  major facilitator transporter  31.12 
 
 		 467 aa  153  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169916  normal  0.209035 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0315  hypothetical protein  28.18 
 
 		 424 aa  150  3e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2937  major facilitator superfamily transporter  30.14 
 
 		 435 aa  150  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0083  major facilitator transporter  30.09 
 
 		 462 aa  149  8e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.339646  normal  0.26187 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0192  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 469 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0027  major facilitator superfamily MFS_1  30.11 
 
 		 465 aa  146  6e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453112  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3337  major facilitator superfamily (MFS) transporter  29.38 
 
 		 443 aa  145  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2130  major facilitator family transporter  28.54 
 
 		 435 aa  144  3e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3421  major facilitator transporter  30.31 
 
 		 466 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564111  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0193  transporter, MFS superfamily  28.57 
 
 		 460 aa  139  1e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1010  major facilitator transporter  29.75 
 
 		 429 aa  138  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1429  major facilitator transporter  29 
 
 		 466 aa  138  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0721  major facilitator transporter  30.53 
 
 		 465 aa  137  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22460  major facilitator superfamily MFS_1  26.94 
 
 		 421 aa  135  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0343  major facilitator transporter  28.99 
 
 		 454 aa  127  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.911823 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3661  major facilitator transporter  27.7 
 
 		 426 aa  123  6e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1854  major facilitator superfamily permease/ BtlA-like  29.4 
 
 		 440 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000121925  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3661  major facilitator superfamily MFS_1  30.08 
 
 		 467 aa  120  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3164  major facilitator superfamily permease  26.88 
 
 		 453 aa  120  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2301  major facilitator superfamily permease  26.71 
 
 		 453 aa  120  6e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.334509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4238  major facilitator superfamily MFS_1  25.42 
 
 		 462 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.239966 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2708  major facilitator superfamily MFS_1  29.19 
 
 		 450 aa  117  6e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0342766  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1316  major facilitator transporter  26.86 
 
 		 492 aa  116  6.9999999999999995e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.387007  hitchhiker  0.0000142592 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0390  major facilitator superfamily permease  29.7 
 
 		 446 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.778281  normal  0.55351 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3914  major facilitator superfamily MFS_1  25.42 
 
 		 462 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.133818 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2251  major facilitator superfamily MFS_1  24.49 
 
 		 439 aa  113  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2662  major facilitator transporter  27.23 
 
 		 460 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1758  putative transporter  28.29 
 
 		 460 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0030  permease  22.81 
 
 		 437 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345375  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3874  major facilitator transporter  29.62 
 
 		 467 aa  108  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2342  hypothetical protein  29.72 
 
 		 464 aa  108  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00968844 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0020  major facilitator transporter  27.47 
 
 		 456 aa  107  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.482167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1276  hypothetical protein  25.99 
 
 		 431 aa  107  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.322939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21750  major facilitator superfamily permease  28.69 
 
 		 474 aa  107  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.109771  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0379  major facilitator transporter  23.95 
 
 		 427 aa  105  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000550837  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1085  major facilitator transporter  25.66 
 
 		 493 aa  104  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.445039  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1904  major facilitator superfamily MFS_1  23.33 
 
 		 430 aa  103  8e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2003  permease  22.65 
 
 		 435 aa  102  9e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.307053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4866  hypothetical protein  24.6 
 
 		 427 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2658  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 469 aa  101  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.494745  normal  0.637588 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0507  hypothetical protein  24.18 
 
 		 427 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0507  hypothetical protein  24.18 
 
 		 427 aa  101  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.130258  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1817  hypothetical protein  23.81 
 
 		 455 aa  101  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404559  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1317  major facilitator transporter  25.28 
 
 		 474 aa  101  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.8065  hitchhiker  0.00000263926 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2485  hypothetical protein  28.51 
 
 		 464 aa  100  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0635  major facilitator superfamily MFS_1  26.46 
 
 		 456 aa  100  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.636916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0458  hypothetical protein  24.18 
 
 		 427 aa  100  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000401747  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3202  major facilitator superfamily MFS_1  25.19 
 
 		 444 aa  100  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0379  hypothetical protein  24.18 
 
 		 427 aa  100  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000021693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0370  major facilitator superfamily permease  24.18 
 
 		 427 aa  100  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.902830000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0367  major facilitator superfamily permease  24.18 
 
 		 427 aa  100  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000714912  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0393  hypothetical protein  24.18 
 
 		 427 aa  100  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0437  hypothetical protein  24.18 
 
 		 427 aa  100  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5316  major facilitator superfamily MFS_1  25.76 
 
 		 572 aa  100  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0373  major facilitator transporter  24.18 
 
 		 427 aa  99.8  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000110963  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2277  major facilitator superfamily MFS_1  25.57 
 
 		 469 aa  99.4  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.419016  normal  0.219783 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2328  major facilitator transporter  25.27 
 
 		 465 aa  97.8  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2972  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 		 442 aa  97.8  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.737462  normal  0.183542 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3264  hypothetical protein  25.06 
 
 		 408 aa  96.3  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12428  hypothetical protein  24.65 
 
 		 441 aa  95.9  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0597064  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1801  major facilitator superfamily protein  27 
 
 		 448 aa  96.3  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.640412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4369  hypothetical protein  23.31 
 
 		 440 aa  95.9  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.486519  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18980  major facilitator superfamily permease  27.9 
 
 		 440 aa  95.5  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.273601  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1362  major facilitator transporter  28.11 
 
 		 456 aa  94.4  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1217  major facilitator superfamily MFS_1  27.92 
 
 		 432 aa  94  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0030  major facilitator transporter  27.88 
 
 		 456 aa  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3188  major facilitator transporter  22.57 
 
 		 463 aa  92  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.988714 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3450  major facilitator transporter  24.38 
 
 		 436 aa  90.1  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0150  major facilitator transporter  21.76 
 
 		 443 aa  89.7  8e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25210  major facilitator superfamily permease  26.91 
 
 		 449 aa  89.7  9e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.302409  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0406  major facilitator superfamily MFS_1  24.63 
 
 		 404 aa  88.6  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01490  major facilitator superfamily permease  22.73 
 
 		 408 aa  87.4  5e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0591182  normal  0.340851 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2748  major facilitator transporter  22.4 
 
 		 439 aa  84.3  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437943  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1838  major facilitator superfamily MFS_1  26.5 
 
 		 439 aa  84  0.000000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.047376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1700  major facilitator superfamily MFS_1  24.39 
 
 		 472 aa  83.2  0.000000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2368  major facilitator superfamily MFS_1  26.54 
 
 		 445 aa  82.4  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.854492  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1893  major facilitator superfamily MFS_1  26.94 
 
 		 458 aa  82.8  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.117856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14630  major facilitator superfamily permease  25.42 
 
 		 462 aa  82  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415319 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1090  putative permease  22.87 
 
 		 425 aa  79.7  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0778903  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5507  major facilitator superfamily permease/BtlA- like protein  25.11 
 
 		 451 aa  79  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.462661  normal  0.0808457 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>