128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0387 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0387  major facilitator transporter  100 
 
 		 437 aa  836    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0133748  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0657  major facilitator transporter  62.99 
 
 		 449 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.651323  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3264  hypothetical protein  35.21 
 
 		 408 aa  199  7e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1522  major facilitator superfamily MFS_1  32.12 
 
 		 426 aa  196  9e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.101861  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1217  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 		 432 aa  191  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1624  major facilitator superfamily MFS_1  32.57 
 
 		 421 aa  187  4e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767884  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3202  major facilitator superfamily MFS_1  31.88 
 
 		 444 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0936  MFS transporter family protein  30.74 
 
 		 458 aa  182  1e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1324  MFS transporter family protein  32.82 
 
 		 425 aa  180  4e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1012  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 428 aa  179  5.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.389524 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1654  major facilitator transporter  29.85 
 
 		 416 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1842  major facilitator superfamily MFS_1  34.82 
 
 		 451 aa  168  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1472  major facilitator superfamily MFS_1  31.68 
 
 		 419 aa  168  2e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.905727  normal  0.384031 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2758  major facilitator transporter  28.83 
 
 		 447 aa  150  5e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2937  major facilitator superfamily transporter  32.82 
 
 		 435 aa  147  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22460  major facilitator superfamily MFS_1  27.04 
 
 		 421 aa  147  5e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0022  major facilitator transporter  30.07 
 
 		 463 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1010  major facilitator transporter  29.3 
 
 		 429 aa  144  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1854  major facilitator superfamily permease/ BtlA-like  29.93 
 
 		 440 aa  144  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000121925  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0192  major facilitator transporter  30.84 
 
 		 469 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0083  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 462 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.339646  normal  0.26187 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1274  putative integral membrane protein  30.71 
 
 		 430 aa  137  4e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2130  major facilitator family transporter  28.82 
 
 		 435 aa  136  6.0000000000000005e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0334  hypothetical protein  26.75 
 
 		 424 aa  135  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2069  major facilitator transporter  30.19 
 
 		 460 aa  135  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.692197  normal  0.259713 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0027  major facilitator superfamily MFS_1  28.95 
 
 		 465 aa  134  5e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453112  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0315  hypothetical protein  25.25 
 
 		 424 aa  133  6e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0322  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 467 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169916  normal  0.209035 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0193  transporter, MFS superfamily  28.32 
 
 		 460 aa  129  8.000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1429  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 466 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218982  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2515  major facilitator superfamily MFS_1  30.02 
 
 		 433 aa  127  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3661  major facilitator transporter  32.22 
 
 		 426 aa  127  6e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3337  major facilitator superfamily (MFS) transporter  29.07 
 
 		 443 aa  126  7e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3450  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 436 aa  125  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0160  major facilitator transporter  29.78 
 
 		 462 aa  124  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0721  major facilitator transporter  29.34 
 
 		 465 aa  124  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1838  major facilitator superfamily MFS_1  30.26 
 
 		 439 aa  123  8e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.047376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21750  major facilitator superfamily permease  26.68 
 
 		 474 aa  121  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.109771  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0146  major facilitator superfamily MFS_1  28.83 
 
 		 414 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.243784  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2014  major facilitator transporter  27.96 
 
 		 426 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.273868  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2708  major facilitator superfamily MFS_1  30.84 
 
 		 450 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0342766  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2301  major facilitator superfamily permease  27.74 
 
 		 453 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.334509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3661  major facilitator superfamily MFS_1  27.9 
 
 		 467 aa  115  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0390  major facilitator superfamily permease  28.98 
 
 		 446 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.778281  normal  0.55351 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1317  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 474 aa  110  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.8065  hitchhiker  0.00000263926 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1697  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 		 375 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3421  major facilitator transporter  28.94 
 
 		 466 aa  110  6e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564111  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3164  major facilitator superfamily permease  27.29 
 
 		 453 aa  110  6e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2972  major facilitator superfamily MFS_1  27.19 
 
 		 442 aa  110  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.737462  normal  0.183542 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0379  major facilitator transporter  24.42 
 
 		 427 aa  109  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000550837  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0574  major facilitator superfamily MFS_1  28.82 
 
 		 440 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0373  major facilitator transporter  24.48 
 
 		 427 aa  107  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000110963  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3411  major facilitator superfamily MFS_1  25.53 
 
 		 469 aa  107  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0406  major facilitator superfamily MFS_1  28.01 
 
 		 404 aa  107  5e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0343  major facilitator transporter  27.29 
 
 		 454 aa  107  5e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.911823 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5316  major facilitator superfamily MFS_1  27.16 
 
 		 572 aa  106  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1758  putative transporter  27.08 
 
 		 460 aa  105  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1316  major facilitator transporter  25.83 
 
 		 492 aa  106  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.387007  hitchhiker  0.0000142592 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0586  major facilitator superfamily MFS_1  28.63 
 
 		 444 aa  105  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0507  hypothetical protein  23.95 
 
 		 427 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0507  hypothetical protein  24.25 
 
 		 427 aa  104  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.130258  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0458  hypothetical protein  24.25 
 
 		 427 aa  103  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000401747  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4238  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 		 462 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.239966 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0379  hypothetical protein  23.95 
 
 		 427 aa  103  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000021693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0370  major facilitator superfamily permease  23.95 
 
 		 427 aa  103  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.902830000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0367  major facilitator superfamily permease  23.95 
 
 		 427 aa  103  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000714912  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0393  hypothetical protein  23.95 
 
 		 427 aa  103  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0335  major facilitator superfamily MFS_1  26.84 
 
 		 454 aa  103  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.121875 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0437  hypothetical protein  23.95 
 
 		 427 aa  103  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2368  major facilitator superfamily MFS_1  27.95 
 
 		 445 aa  102  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.854492  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2546  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 449 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.146508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2251  major facilitator superfamily MFS_1  25.23 
 
 		 439 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4369  hypothetical protein  25.94 
 
 		 440 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.486519  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3874  major facilitator transporter  26.76 
 
 		 467 aa  102  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2044  major facilitator transporter  26.62 
 
 		 436 aa  100  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0220318 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3166  major facilitator superfamily MFS_1  28.99 
 
 		 462 aa  100  5e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.704444  normal  0.18034 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4866  hypothetical protein  23.33 
 
 		 427 aa  100  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18980  major facilitator superfamily permease  29.78 
 
 		 440 aa  100  5e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.273601  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1817  hypothetical protein  25.16 
 
 		 455 aa  98.6  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404559  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2277  major facilitator superfamily MFS_1  29.02 
 
 		 469 aa  98.2  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.419016  normal  0.219783 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3914  major facilitator superfamily MFS_1  24.57 
 
 		 462 aa  97.8  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.133818 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2662  major facilitator transporter  27.55 
 
 		 460 aa  97.4  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3786  major facilitator superfamily MFS_1  25.65 
 
 		 412 aa  97.1  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0297  major facilitator superfamily MFS_1  25.56 
 
 		 441 aa  95.9  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.321668  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1893  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 458 aa  95.1  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.117856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0568  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 468 aa  95.5  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685546 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1720  major facilitator transporter  32.54 
 
 		 454 aa  94.7  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.493867 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0635  major facilitator superfamily MFS_1  26.46 
 
 		 456 aa  94.4  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.636916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2003  permease  23.25 
 
 		 435 aa  92.8  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.307053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2658  major facilitator transporter  28.45 
 
 		 469 aa  92.4  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.494745  normal  0.637588 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1085  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 493 aa  92.8  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.445039  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2342  hypothetical protein  26.37 
 
 		 464 aa  91.3  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00968844 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2485  hypothetical protein  26.27 
 
 		 464 aa  90.9  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14630  major facilitator superfamily permease  30.24 
 
 		 462 aa  90.9  4e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415319 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1276  hypothetical protein  24.1 
 
 		 431 aa  90.9  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.322939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2713  major facilitator superfamily MFS_1  23.87 
 
 		 424 aa  90.5  6e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2328  major facilitator transporter  26.37 
 
 		 465 aa  89.7  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4097  major facilitator superfamily transporter  27.76 
 
 		 443 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0030  permease  21.79 
 
 		 437 aa  89  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345375  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1801  major facilitator superfamily protein  27.27 
 
 		 448 aa  88.2  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.640412  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>