118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1316 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1316  major facilitator transporter  100 
 
 
492 aa  972    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.387007  hitchhiker  0.0000142592 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4202  hypothetical protein  43.93 
 
 
479 aa  371  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.246317  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1317  major facilitator transporter  40.73 
 
 
474 aa  358  9.999999999999999e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.8065  hitchhiker  0.00000263926 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0322  major facilitator transporter  40.27 
 
 
467 aa  310  5e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169916  normal  0.209035 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0027  major facilitator superfamily MFS_1  38.39 
 
 
465 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453112  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0192  major facilitator transporter  38.62 
 
 
469 aa  296  6e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0083  major facilitator transporter  39.41 
 
 
462 aa  294  3e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.339646  normal  0.26187 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0160  major facilitator transporter  37.72 
 
 
462 aa  291  3e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4238  major facilitator superfamily MFS_1  36.59 
 
 
462 aa  286  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.239966 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3914  major facilitator superfamily MFS_1  37.22 
 
 
462 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.133818 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1429  major facilitator transporter  38.44 
 
 
466 aa  282  9e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218982  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0022  major facilitator transporter  37.94 
 
 
463 aa  282  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0721  major facilitator transporter  37.72 
 
 
465 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3421  major facilitator transporter  35.71 
 
 
466 aa  273  6e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564111  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4369  hypothetical protein  36.68 
 
 
440 aa  271  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.486519  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1817  hypothetical protein  36.14 
 
 
455 aa  266  8e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404559  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3188  major facilitator transporter  37.64 
 
 
463 aa  264  3e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.988714 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2937  major facilitator superfamily transporter  37.2 
 
 
435 aa  263  4.999999999999999e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1010  major facilitator transporter  36.93 
 
 
429 aa  261  2e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3337  major facilitator superfamily (MFS) transporter  36.53 
 
 
443 aa  256  6e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1085  major facilitator transporter  34.62 
 
 
493 aa  249  9e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.445039  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0343  major facilitator transporter  35.02 
 
 
454 aa  244  1.9999999999999999e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.911823 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0193  transporter, MFS superfamily  33.71 
 
 
460 aa  234  3e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2130  major facilitator family transporter  33.71 
 
 
435 aa  234  3e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0020  major facilitator transporter  35.01 
 
 
456 aa  230  4e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.482167  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1842  major facilitator superfamily MFS_1  35.54 
 
 
451 aa  226  7e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0315  hypothetical protein  32.96 
 
 
424 aa  225  1e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0334  hypothetical protein  33.63 
 
 
424 aa  225  2e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2658  major facilitator transporter  32.03 
 
 
469 aa  213  5.999999999999999e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.494745  normal  0.637588 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3661  major facilitator transporter  34 
 
 
426 aa  209  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0030  major facilitator transporter  34.47 
 
 
456 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550857  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1362  major facilitator transporter  35.11 
 
 
456 aa  201  3e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2662  major facilitator transporter  31.45 
 
 
460 aa  186  6e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1522  major facilitator superfamily MFS_1  28.51 
 
 
426 aa  171  3e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.101861  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1624  major facilitator superfamily MFS_1  28.87 
 
 
421 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767884  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1472  major facilitator superfamily MFS_1  30.2 
 
 
419 aa  160  4e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.905727  normal  0.384031 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3661  major facilitator superfamily MFS_1  30.54 
 
 
467 aa  160  5e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1012  major facilitator superfamily MFS_1  28.35 
 
 
428 aa  160  6e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.389524 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1654  major facilitator transporter  28.6 
 
 
416 aa  159  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3874  major facilitator transporter  29.48 
 
 
467 aa  151  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1324  MFS transporter family protein  28.32 
 
 
425 aa  151  3e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0574  major facilitator superfamily MFS_1  29.07 
 
 
440 aa  151  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3166  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 
462 aa  141  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.704444  normal  0.18034 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0936  MFS transporter family protein  26.05 
 
 
458 aa  136  8e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0635  major facilitator superfamily MFS_1  29.4 
 
 
456 aa  136  8e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.636916  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2368  major facilitator superfamily MFS_1  27.35 
 
 
445 aa  135  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.854492  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2546  major facilitator transporter  28.7 
 
 
449 aa  124  5e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.146508  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1700  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 
472 aa  119  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0297  major facilitator superfamily MFS_1  27.55 
 
 
441 aa  119  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.321668  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0568  major facilitator superfamily MFS_1  26.4 
 
 
468 aa  119  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00685546 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25210  major facilitator superfamily permease  26.1 
 
 
449 aa  117  6e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.302409  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18980  major facilitator superfamily permease  27.72 
 
 
440 aa  115  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.273601  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1854  major facilitator superfamily permease/ BtlA-like  26.72 
 
 
440 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000121925  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4097  major facilitator superfamily transporter  27.4 
 
 
443 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0146  major facilitator superfamily MFS_1  23.83 
 
 
414 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.243784  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2014  major facilitator transporter  25.6 
 
 
426 aa  110  5e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.273868  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3450  major facilitator transporter  25.83 
 
 
436 aa  108  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2069  major facilitator transporter  24.94 
 
 
460 aa  108  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.692197  normal  0.259713 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0379  major facilitator transporter  25.84 
 
 
427 aa  106  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000550837  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22460  major facilitator superfamily MFS_1  25.16 
 
 
421 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0507  hypothetical protein  26.11 
 
 
427 aa  104  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.130258  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2758  major facilitator transporter  24 
 
 
447 aa  103  5e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0458  hypothetical protein  25.88 
 
 
427 aa  103  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000401747  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3202  major facilitator superfamily MFS_1  24.42 
 
 
444 aa  103  9e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0373  major facilitator transporter  26.11 
 
 
427 aa  103  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000110963  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0507  hypothetical protein  25.44 
 
 
427 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0379  hypothetical protein  25.44 
 
 
427 aa  100  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000021693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0370  major facilitator superfamily permease  25.44 
 
 
427 aa  100  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.902830000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0367  major facilitator superfamily permease  25.44 
 
 
427 aa  100  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000714912  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0393  hypothetical protein  25.44 
 
 
427 aa  100  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0437  hypothetical protein  25.44 
 
 
427 aa  100  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2972  major facilitator superfamily MFS_1  24.48 
 
 
442 aa  99.8  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.737462  normal  0.183542 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3164  major facilitator superfamily permease  26.44 
 
 
453 aa  99.8  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263181  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4866  hypothetical protein  25.22 
 
 
427 aa  97.8  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3786  major facilitator superfamily MFS_1  24.62 
 
 
412 aa  96.7  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2301  major facilitator superfamily permease  25.8 
 
 
453 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.334509  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0030  permease  21.06 
 
 
437 aa  95.9  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345375  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1090  putative permease  25.11 
 
 
425 aa  92.8  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0778903  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0387  major facilitator transporter  26.39 
 
 
437 aa  90.9  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0133748  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0586  major facilitator superfamily MFS_1  25.47 
 
 
444 aa  90.9  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0657  major facilitator transporter  25.68 
 
 
449 aa  87.8  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.651323  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5507  major facilitator superfamily permease/BtlA- like protein  25.38 
 
 
451 aa  87.8  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.462661  normal  0.0808457 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01490  major facilitator superfamily permease  23.88 
 
 
408 aa  87.4  5e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0591182  normal  0.340851 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2708  major facilitator superfamily MFS_1  24.31 
 
 
450 aa  87  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0342766  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3637  major facilitator transporter  25.51 
 
 
454 aa  87  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35063  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3710  major facilitator superfamily transporter  25.51 
 
 
454 aa  87  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.417195  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3642  major facilitator transporter  25.51 
 
 
454 aa  87  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.266137  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2277  major facilitator superfamily MFS_1  21.14 
 
 
469 aa  84.7  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.419016  normal  0.219783 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1801  major facilitator superfamily protein  21.98 
 
 
448 aa  83.6  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.640412  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0390  major facilitator superfamily permease  24.11 
 
 
446 aa  83.6  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.778281  normal  0.55351 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1274  putative integral membrane protein  23.81 
 
 
430 aa  83.6  0.000000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2713  major facilitator superfamily MFS_1  26.85 
 
 
424 aa  82.8  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0335  major facilitator superfamily MFS_1  27.64 
 
 
454 aa  80.1  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.121875 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1758  putative transporter  23.82 
 
 
460 aa  79.3  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1838  major facilitator superfamily MFS_1  24.27 
 
 
439 aa  76.6  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.047376  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5316  major facilitator superfamily MFS_1  23.21 
 
 
572 aa  75.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0406  major facilitator superfamily MFS_1  25.44 
 
 
404 aa  70.9  0.00000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2251  major facilitator superfamily MFS_1  22.25 
 
 
439 aa  70.5  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3264  hypothetical protein  23.55 
 
 
408 aa  70.1  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2748  major facilitator transporter  22.93 
 
 
439 aa  69.7  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>