233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1842 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1842  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 451 aa  882    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2937  major facilitator superfamily transporter  46.93 
 
 		 435 aa  383  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1010  major facilitator transporter  47.14 
 
 		 429 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0334  hypothetical protein  43.58 
 
 		 424 aa  345  8.999999999999999e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3661  major facilitator transporter  48.18 
 
 		 426 aa  345  1e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0315  hypothetical protein  42.37 
 
 		 424 aa  340  2.9999999999999998e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2130  major facilitator family transporter  44.39 
 
 		 435 aa  329  6e-89  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0193  transporter, MFS superfamily  42.04 
 
 		 460 aa  325  9e-88  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0192  major facilitator transporter  39.02 
 
 		 469 aa  299  6e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0160  major facilitator transporter  40.27 
 
 		 462 aa  296  4e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0022  major facilitator transporter  38.93 
 
 		 463 aa  295  9e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0083  major facilitator transporter  38.84 
 
 		 462 aa  293  6e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.339646  normal  0.26187 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0027  major facilitator superfamily MFS_1  38.88 
 
 		 465 aa  289  9e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453112  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1472  major facilitator superfamily MFS_1  39.95 
 
 		 419 aa  288  1e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.905727  normal  0.384031 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1522  major facilitator superfamily MFS_1  38.12 
 
 		 426 aa  287  2.9999999999999996e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.101861  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1012  major facilitator superfamily MFS_1  40.37 
 
 		 428 aa  286  4e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.389524 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0936  MFS transporter family protein  38.57 
 
 		 458 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1624  major facilitator superfamily MFS_1  39.14 
 
 		 421 aa  280  3e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767884  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0721  major facilitator transporter  37.45 
 
 		 465 aa  275  9e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1324  MFS transporter family protein  40.05 
 
 		 425 aa  273  3e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1654  major facilitator transporter  37.71 
 
 		 416 aa  269  5.9999999999999995e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0322  major facilitator transporter  37.84 
 
 		 467 aa  267  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169916  normal  0.209035 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2758  major facilitator transporter  35.1 
 
 		 447 aa  260  4e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1429  major facilitator transporter  36.82 
 
 		 466 aa  253  7e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3421  major facilitator transporter  38.48 
 
 		 466 aa  252  8.000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564111  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1316  major facilitator transporter  35.54 
 
 		 492 aa  246  4e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.387007  hitchhiker  0.0000142592 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4238  major facilitator superfamily MFS_1  33.7 
 
 		 462 aa  246  6e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.239966 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3914  major facilitator superfamily MFS_1  33.26 
 
 		 462 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.133818 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2515  major facilitator superfamily MFS_1  37.14 
 
 		 433 aa  241  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3337  major facilitator superfamily (MFS) transporter  33.02 
 
 		 443 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0568  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 		 468 aa  239  5e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685546 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2368  major facilitator superfamily MFS_1  35.28 
 
 		 445 aa  239  6.999999999999999e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.854492  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2044  major facilitator transporter  37.59 
 
 		 436 aa  238  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0220318 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25210  major facilitator superfamily permease  36.36 
 
 		 449 aa  237  4e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.302409  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1817  hypothetical protein  35.16 
 
 		 455 aa  236  7e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404559  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0635  major facilitator superfamily MFS_1  35.34 
 
 		 456 aa  234  3e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.636916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1317  major facilitator transporter  33.04 
 
 		 474 aa  233  4.0000000000000004e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.8065  hitchhiker  0.00000263926 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4369  hypothetical protein  34.51 
 
 		 440 aa  231  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.486519  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3661  major facilitator superfamily MFS_1  35.55 
 
 		 467 aa  230  3e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1274  putative integral membrane protein  37.35 
 
 		 430 aa  230  4e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0574  major facilitator superfamily MFS_1  34.16 
 
 		 440 aa  229  9e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0343  major facilitator transporter  33.72 
 
 		 454 aa  228  2e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.911823 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3166  major facilitator superfamily MFS_1  34.58 
 
 		 462 aa  228  2e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.704444  normal  0.18034 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1085  major facilitator transporter  34.43 
 
 		 493 aa  226  8e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.445039  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3874  major facilitator transporter  36.5 
 
 		 467 aa  224  3e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22460  major facilitator superfamily MFS_1  34.21 
 
 		 421 aa  222  9.999999999999999e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2069  major facilitator transporter  33.7 
 
 		 460 aa  217  2.9999999999999998e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.692197  normal  0.259713 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2546  major facilitator transporter  36.32 
 
 		 449 aa  217  4e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.146508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1700  major facilitator superfamily MFS_1  35.16 
 
 		 472 aa  214  2.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1854  major facilitator superfamily permease/ BtlA-like  35.33 
 
 		 440 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000121925  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0146  major facilitator superfamily MFS_1  33.88 
 
 		 414 aa  211  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.243784  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3188  major facilitator transporter  32.88 
 
 		 463 aa  206  6e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.988714 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18980  major facilitator superfamily permease  34.51 
 
 		 440 aa  205  1e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.273601  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0020  major facilitator transporter  34.22 
 
 		 456 aa  202  8e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.482167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3642  major facilitator transporter  36.54 
 
 		 454 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.266137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3637  major facilitator transporter  36.54 
 
 		 454 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35063  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3710  major facilitator superfamily transporter  36.54 
 
 		 454 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.417195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2662  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 460 aa  199  9e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3450  major facilitator transporter  34.2 
 
 		 436 aa  199  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4097  major facilitator superfamily transporter  35.24 
 
 		 443 aa  197  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2014  major facilitator transporter  33.57 
 
 		 426 aa  196  9e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.273868  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2658  major facilitator transporter  31.36 
 
 		 469 aa  194  3e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.494745  normal  0.637588 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0297  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 441 aa  194  3e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.321668  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3164  major facilitator superfamily permease  35.8 
 
 		 453 aa  192  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0030  major facilitator transporter  35.12 
 
 		 456 aa  192  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2301  major facilitator superfamily permease  35.8 
 
 		 453 aa  191  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.334509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0458  hypothetical protein  31.08 
 
 		 427 aa  189  8e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000401747  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1362  major facilitator transporter  35.12 
 
 		 456 aa  189  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0379  major facilitator transporter  30.39 
 
 		 427 aa  189  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000550837  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0373  major facilitator transporter  31.18 
 
 		 427 aa  187  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000110963  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0507  hypothetical protein  30.84 
 
 		 427 aa  186  7e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.130258  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0507  hypothetical protein  31.08 
 
 		 427 aa  186  7e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0379  hypothetical protein  30.98 
 
 		 427 aa  186  9e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000021693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0370  major facilitator superfamily permease  30.98 
 
 		 427 aa  186  9e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.902830000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0367  major facilitator superfamily permease  30.98 
 
 		 427 aa  186  9e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000714912  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0335  major facilitator superfamily MFS_1  33.73 
 
 		 454 aa  186  9e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.121875 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0393  hypothetical protein  30.98 
 
 		 427 aa  186  9e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0437  hypothetical protein  30.98 
 
 		 427 aa  186  9e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4866  hypothetical protein  30.98 
 
 		 427 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0586  major facilitator superfamily MFS_1  31.21 
 
 		 444 aa  182  8.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01490  major facilitator superfamily permease  30.62 
 
 		 408 aa  181  2e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0591182  normal  0.340851 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2713  major facilitator superfamily MFS_1  32.52 
 
 		 424 aa  177  5e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1893  major facilitator superfamily MFS_1  31.96 
 
 		 458 aa  174  3.9999999999999995e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.117856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3786  major facilitator superfamily MFS_1  32.08 
 
 		 412 aa  170  4e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2277  major facilitator superfamily MFS_1  31.3 
 
 		 469 aa  168  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.419016  normal  0.219783 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2708  major facilitator superfamily MFS_1  34.59 
 
 		 450 aa  169  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0342766  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1758  putative transporter  33.8 
 
 		 460 aa  168  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1838  major facilitator superfamily MFS_1  35.36 
 
 		 439 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.047376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1720  major facilitator transporter  37.68 
 
 		 454 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.493867 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2972  major facilitator superfamily MFS_1  33.1 
 
 		 442 aa  166  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.737462  normal  0.183542 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1801  major facilitator superfamily protein  33.48 
 
 		 448 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.640412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2251  major facilitator superfamily MFS_1  27.74 
 
 		 439 aa  161  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0406  major facilitator superfamily MFS_1  32.35 
 
 		 404 aa  159  8e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0390  major facilitator superfamily permease  34.78 
 
 		 446 aa  158  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.778281  normal  0.55351 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12530  leucine and alanine rich integral membrane protein  32.45 
 
 		 445 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0104482 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14630  major facilitator superfamily permease  30.43 
 
 		 462 aa  153  5.9999999999999996e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415319 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2328  major facilitator transporter  29.89 
 
 		 465 aa  151  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1090  putative permease  27.95 
 
 		 425 aa  151  2e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0778903  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0030  permease  26.37 
 
 		 437 aa  150  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345375  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3202  major facilitator superfamily MFS_1  29.7 
 
 		 444 aa  149  7e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>