203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2534 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2534  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 446 aa  855    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2528  major facilitator superfamily MFS_1  56.76 
 
 		 451 aa  438  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0427  major facilitator superfamily MFS_1  35.04 
 
 		 426 aa  228  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1988  major facilitator superfamily MFS_1  36.05 
 
 		 425 aa  218  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1836  major facilitator transporter  35.38 
 
 		 440 aa  207  3e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.860837  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3554  major facilitator transporter  36.03 
 
 		 423 aa  183  6e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0806  major facilitator transporter  30.36 
 
 		 419 aa  177  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3996  major facilitator transporter  32.13 
 
 		 438 aa  176  8e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0255  major facilitator transporter  30.58 
 
 		 440 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2779  major facilitator transporter  32.14 
 
 		 443 aa  154  4e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.617635  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0034  major facilitator superfamily MFS_1  30.34 
 
 		 435 aa  152  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6833  transporter, major facilitator superfamily  31.68 
 
 		 423 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal  0.570568 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3775  major facilitator superfamily MFS_1  29.37 
 
 		 425 aa  150  5e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4281  major facilitator superfamily MFS_1  28.89 
 
 		 423 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.502977  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3224  major facilitator superfamily MFS_1  33.01 
 
 		 433 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3267  major facilitator transporter  27.48 
 
 		 415 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0780681  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03160  Na+/melibiose symporter-like transporter  32.53 
 
 		 419 aa  122  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1439  major facilitator superfamily MFS_1  26.88 
 
 		 426 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0835777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02710  Major Facilitator Superfamily transporter  30.73 
 
 		 428 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2979  major facilitator superfamily MFS_1  31.94 
 
 		 421 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0876079  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0846  glycoside-Pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  25.89 
 
 		 416 aa  106  8e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4387  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 		 429 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.591192  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0454  major facilitator superfamily MFS_1  27.98 
 
 		 404 aa  94.4  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal  0.684757 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2955  major facilitator superfamily MFS_1  26.83 
 
 		 405 aa  92.4  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1330  Na+/sugar symporter  25.38 
 
 		 545 aa  86.7  8e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2450  major facilitator superfamily MFS_1  26.18 
 
 		 407 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.557384  normal  0.479748 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1832  glycoside-Pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  26.07 
 
 		 353 aa  83.2  0.000000000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0892  major facilitator transporter  29.77 
 
 		 424 aa  81.6  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.805867  normal  0.497197 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0506  putative permease  26.7 
 
 		 210 aa  75.1  0.000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  27.85 
 
 		 440 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14174  predicted protein  23.42 
 
 		 405 aa  64.3  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0894  major facilitator transporter  26.63 
 
 		 453 aa  62  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0340  major facilitator transporter  28.02 
 
 		 385 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0499  major facilitator family transporter  28.23 
 
 		 478 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.788244  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0780  major facilitator family transporter  26.97 
 
 		 490 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.114821  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1017  major facilitator superfamily MFS_1  28.99 
 
 		 525 aa  57.4  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0062  major facilitator family transporter  28.1 
 
 		 395 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.906812  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1528  major facilitator family transporter  28.1 
 
 		 395 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 421 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3094  major facilitator family transporter  28.16 
 
 		 385 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.948927  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4519  major facilitator transporter  29.63 
 
 		 464 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.301476  normal  0.140313 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5050  general substrate transporter  27.98 
 
 		 465 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243206 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2885  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 432 aa  55.1  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00035649  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0595  major facilitator family transporter  28.16 
 
 		 385 aa  55.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0610  major facilitator family transporter  28.16 
 
 		 385 aa  55.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2956  major facilitator family transporter  28.16 
 
 		 385 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45818  predicted protein  29.33 
 
 		 583 aa  55.1  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0729495  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0610  major facilitator superfamily MFS_1  25.94 
 
 		 395 aa  55.1  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495333  normal  0.0469856 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1607  major facilitator transporter  24.5 
 
 		 422 aa  54.3  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0422221  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2887  major facilitator superfamily MFS_1  24.25 
 
 		 455 aa  54.3  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1729  major facilitator transporter  29.24 
 
 		 423 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1776  major facilitator superfamily transporter  29.24 
 
 		 423 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1708  major facilitator transporter  29.24 
 
 		 423 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.841617  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1514  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 		 393 aa  53.9  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4107  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  26.57 
 
 		 385 aa  53.5  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0448  folate/biopterin transporter  28.76 
 
 		 483 aa  53.5  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1831  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 430 aa  53.5  0.000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.612991  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00379  hypothetical protein  29.69 
 
 		 454 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00375  predicted transporter  29.69 
 
 		 454 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3182  major facilitator superfamily MFS_1  29.69 
 
 		 454 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.565255  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3206  major facilitator transporter  29.69 
 
 		 454 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000090157 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0511  transporter, major facilitator family  29.69 
 
 		 454 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.905004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0349  transporter, major facilitator family  29.69 
 
 		 454 aa  52.8  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0513  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 464 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0200  major facilitator superfamily MFS_1  22.96 
 
 		 415 aa  53.1  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0537  major facilitator transporter  27.01 
 
 		 395 aa  53.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0463  major facilitator transporter  29.69 
 
 		 454 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0499  major facilitator transporter  29.69 
 
 		 454 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0459  major facilitator transporter  29.69 
 
 		 454 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0655  major facilitator family transporter  28.4 
 
 		 464 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3594  putative permease  24.57 
 
 		 422 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3274  major facilitator superfamily MFS_1  30.57 
 
 		 454 aa  52  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 405 aa  52  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3022  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 472 aa  51.2  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.358015  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3149  major facilitator superfamily MFS_1  32.69 
 
 		 460 aa  51.2  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09195  major facilitator transporter  29.87 
 
 		 462 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0308711  normal  0.679663 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3264  hypothetical protein  24.59 
 
 		 408 aa  50.8  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1607  permease  24.75 
 
 		 422 aa  51.2  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137367  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1559  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  24.83 
 
 		 422 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.285528  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6572  major facilitator transporter  25.47 
 
 		 395 aa  51.2  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1731  permease  24.75 
 
 		 422 aa  51.2  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4567  major facilitator transporter  30.99 
 
 		 424 aa  51.2  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.125283 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1037  major facilitator superfamily MFS_1  30.57 
 
 		 454 aa  51.2  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1085  major facilitator transporter  30.21 
 
 		 454 aa  51.2  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.00000502867 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0517  major facilitator transporter  27.57 
 
 		 464 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0921044 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1568  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  24.57 
 
 		 422 aa  50.4  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.766892  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0523  major facilitator transporter  26.22 
 
 		 416 aa  50.4  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2458  transporter, putative  25 
 
 		 529 aa  50.4  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1782  putative permease  24.5 
 
 		 422 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1862  putative permease  24.16 
 
 		 422 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0484  major facilitator family transporter  27.98 
 
 		 464 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291295 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1808  permease, putative  24.5 
 
 		 422 aa  50.1  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6108  major facilitator transporter  25.12 
 
 		 395 aa  50.1  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4719  major facilitator transporter  28.84 
 
 		 464 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.210959 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.91 
 
 		 554 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.315479  normal  0.0101645 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3078  major facilitator superfamily MFS_1  29.74 
 
 		 457 aa  49.7  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.493541  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2838  major facilitator transporter  25.59 
 
 		 395 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0298937  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0867  major facilitator transporter  30.49 
 
 		 454 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.551059  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  28.92 
 
 		 419 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2703  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.11 
 
 		 511 aa  48.9  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.445725  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>