73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1610 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1610  major facilitator transporter  100 
 
 		 404 aa  765    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0921  major facilitator transporter  50.76 
 
 		 402 aa  348  1e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3554  major facilitator transporter  29.04 
 
 		 423 aa  120  6e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3996  major facilitator transporter  29.54 
 
 		 438 aa  103  7e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3775  major facilitator superfamily MFS_1  30.49 
 
 		 425 aa  95.1  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2979  major facilitator superfamily MFS_1  29.65 
 
 		 421 aa  95.1  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0876079  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3267  major facilitator transporter  28.42 
 
 		 415 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0780681  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1988  major facilitator superfamily MFS_1  28.8 
 
 		 425 aa  82.4  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4281  major facilitator superfamily MFS_1  27.74 
 
 		 423 aa  79.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.502977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0255  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 440 aa  79.3  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02710  Major Facilitator Superfamily transporter  28.41 
 
 		 428 aa  76.3  0.0000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0846  glycoside-Pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  25.5 
 
 		 416 aa  75.9  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0427  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 		 426 aa  73.9  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0454  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 404 aa  72  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal  0.684757 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6833  transporter, major facilitator superfamily  26.98 
 
 		 423 aa  69.7  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal  0.570568 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0034  major facilitator superfamily MFS_1  27.63 
 
 		 435 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4387  major facilitator superfamily MFS_1  28.2 
 
 		 429 aa  65.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.591192  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2450  major facilitator superfamily MFS_1  25.76 
 
 		 407 aa  64.7  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.557384  normal  0.479748 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3224  major facilitator superfamily MFS_1  26.53 
 
 		 433 aa  63.2  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2955  major facilitator superfamily MFS_1  27.37 
 
 		 405 aa  61.6  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0892  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 424 aa  60.5  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.805867  normal  0.497197 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05075  putative sugar transporter  35.48 
 
 		 507 aa  58.5  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0544446  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1832  glycoside-Pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  26.57 
 
 		 353 aa  57.4  0.0000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0806  major facilitator transporter  25.21 
 
 		 419 aa  56.6  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2779  major facilitator transporter  26.74 
 
 		 443 aa  56.2  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.617635  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1403  major facilitator transporter  34.07 
 
 		 505 aa  55.5  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.206645  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3659  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 406 aa  51.6  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2202  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 551 aa  51.6  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000401875 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1657  major facilitator transporter  34.12 
 
 		 518 aa  51.2  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1271  major facilitator transporter  28.2 
 
 		 403 aa  50.8  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.879022 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4087  major facilitator transporter  32 
 
 		 514 aa  49.7  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0715  general substrate transporter  32.35 
 
 		 442 aa  49.7  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.345459  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5086  major facilitator superfamily MFS_1  32.71 
 
 		 457 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0501179  normal  0.911731 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1015  major facilitator transporter  30.59 
 
 		 502 aa  48.9  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2003  major facilitator transporter  31.76 
 
 		 530 aa  47.8  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0599  transporter, putative  30.59 
 
 		 501 aa  47.4  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1860  proline/glycine betaine transporter  25.81 
 
 		 500 aa  47.4  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1874  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 524 aa  47  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322942  normal  0.129685 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1776  major facilitator transporter  30.59 
 
 		 519 aa  46.6  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0516559  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0041  major facilitator superfamily permease  25.84 
 
 		 471 aa  47  0.0007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000141077  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  26.87 
 
 		 409 aa  46.6  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2336  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 551 aa  46.6  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2011  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 551 aa  46.6  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000990966  hitchhiker  0.000202625 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2452  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 551 aa  46.6  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2347  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 551 aa  46.6  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23660  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.97 
 
 		 461 aa  46.2  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.629317  normal  0.503051 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2458  transporter, putative  30.59 
 
 		 529 aa  45.8  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2108  major facilitator transporter  30.59 
 
 		 531 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.753085 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4939  major facilitator transporter  27.46 
 
 		 414 aa  46.2  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2454  major facilitator transporter  26.86 
 
 		 389 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1886  major facilitator transporter  31.09 
 
 		 501 aa  45.8  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.156331  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1925  major facilitator transporter  30.59 
 
 		 531 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0832  major facilitator superfamily permease  23.71 
 
 		 453 aa  45.8  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000561592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1870  major facilitator transporter  30.59 
 
 		 531 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1037  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  25.7 
 
 		 445 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0132433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03160  Na+/melibiose symporter-like transporter  27.22 
 
 		 419 aa  45.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2534  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 446 aa  44.7  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0983  General substrate transporter  28.23 
 
 		 481 aa  44.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1420  proline/glycine betaine transporter  23.84 
 
 		 500 aa  44.3  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00160587  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0893  major facilitator superfamily permease  22.83 
 
 		 450 aa  44.3  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1500  major facilitator transporter  31.73 
 
 		 448 aa  44.3  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.21091 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1439  major facilitator superfamily MFS_1  23.92 
 
 		 426 aa  43.9  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0835777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3913  general substrate transporter  26.51 
 
 		 460 aa  43.9  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.231848  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1406  major facilitator transporter  23.4 
 
 		 401 aa  43.5  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000773977  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2114  major facilitator superfamily MFS_1  44.68 
 
 		 363 aa  43.9  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3987  general substrate transporter  26.51 
 
 		 460 aa  43.9  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3928  general substrate transporter  26.51 
 
 		 460 aa  43.9  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.721766  normal  0.0801744 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0864  major facilitator transporter  32.56 
 
 		 441 aa  43.5  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  26.59 
 
 		 431 aa  43.1  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2738  major facilitator transporter  32.43 
 
 		 510 aa  43.1  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.934726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18730  arabinose efflux permease family protein  24.29 
 
 		 480 aa  43.1  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.635364  normal  0.19264 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2187  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 502 aa  42.7  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48630  putative MFS transporter  39.5 
 
 		 409 aa  42.7  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0171421  normal  0.0121812 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>