239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2885 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2885  major facilitator transporter  100 
 
 		 432 aa  870    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00035649  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0523  major facilitator transporter  35.52 
 
 		 416 aa  233  3e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1599  major facilitator transporter  32.65 
 
 		 421 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0200  major facilitator superfamily MFS_1  32.8 
 
 		 415 aa  207  3e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1406  major facilitator transporter  31.39 
 
 		 401 aa  186  7e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000773977  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0798  transporter, putative  28.05 
 
 		 442 aa  168  2e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0616  major facilitator superfamily MFS_1  24.09 
 
 		 443 aa  76.3  0.0000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0461422  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3858  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.23 
 
 		 469 aa  67  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.784369  normal  0.0678057 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01889  sugar transporter  24.02 
 
 		 493 aa  65.1  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.660327  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3738  hypothetical protein  23.15 
 
 		 467 aa  62.4  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00183877  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4367  major facilitator transporter  33.08 
 
 		 493 aa  63.2  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0832  major facilitator superfamily permease  23.8 
 
 		 453 aa  62.8  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000561592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4675  major facilitator superfamily MFS_1  22.47 
 
 		 411 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02710  Major Facilitator Superfamily transporter  20.62 
 
 		 428 aa  60.5  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1269  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.74 
 
 		 465 aa  58.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.727469  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2441  transporter, putative  21.84 
 
 		 453 aa  58.2  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0973262  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0041  major facilitator superfamily permease  21.83 
 
 		 471 aa  58.2  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000141077  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5086  major facilitator superfamily MFS_1  24.16 
 
 		 457 aa  58.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0501179  normal  0.911731 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2611  major facilitator transporter  24.83 
 
 		 480 aa  58.2  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.803344  normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0248  major facilitator transporter  24.12 
 
 		 486 aa  57.8  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.135747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1461  PucC protein  23.98 
 
 		 449 aa  57.4  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.833113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3267  major facilitator transporter  24.32 
 
 		 415 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0780681  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0893  major facilitator superfamily permease  22.03 
 
 		 450 aa  56.6  0.0000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0975  hypothetical protein  23.51 
 
 		 498 aa  56.2  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.798408  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1406  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.28 
 
 		 471 aa  56.2  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0846  glycoside-Pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  23.56 
 
 		 416 aa  56.2  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0994  major facilitator superfamily permease  23.56 
 
 		 450 aa  55.8  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.211502  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0427  major facilitator superfamily MFS_1  26.58 
 
 		 426 aa  55.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1458  major facilitator transporter  22.37 
 
 		 480 aa  55.5  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1028  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.46 
 
 		 483 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.634124  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1388  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.27 
 
 		 483 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3583  galactoside symporter  22.13 
 
 		 475 aa  54.3  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06480  Na+/melibiose symporter-like transporter  23.73 
 
 		 460 aa  53.9  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.610657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0898  major facilitator superfamily permease  22.02 
 
 		 454 aa  53.9  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1624  major facilitator superfamily MFS_1  24.05 
 
 		 421 aa  54.3  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767884  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.46 
 
 		 483 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146647  normal  0.357206 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4335  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.27 
 
 		 483 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3149  major facilitator superfamily MFS_1  32.14 
 
 		 460 aa  53.1  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0689  PucC protein  23.46 
 
 		 448 aa  53.1  0.000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.85813  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1089  major facilitator superfamily MFS_1  25.11 
 
 		 509 aa  53.1  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.339374  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1745  RemN protein  25.35 
 
 		 582 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0892  major facilitator transporter  30.12 
 
 		 424 aa  52.8  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.805867  normal  0.497197 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0034  major facilitator superfamily MFS_1  26.15 
 
 		 435 aa  53.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1560  PUCC protein  21.23 
 
 		 450 aa  52  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.507042  hitchhiker  0.000951091 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1975  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  21.99 
 
 		 394 aa  52.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2452  major facilitator transporter  23.58 
 
 		 551 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  24.42 
 
 		 370 aa  52.4  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3190  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.62 
 
 		 460 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2336  major facilitator transporter  23.58 
 
 		 551 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1344  major facilitator transporter  21.43 
 
 		 454 aa  52  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0393  major facilitator transporter  25.35 
 
 		 553 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223586  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2011  major facilitator superfamily MFS_1  23.58 
 
 		 551 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000990966  hitchhiker  0.000202625 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2375  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  21.28 
 
 		 394 aa  51.6  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.525477 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2906  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.09 
 
 		 460 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4479  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.99 
 
 		 505 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0571  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.67 
 
 		 457 aa  51.2  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.74034  normal  0.0218606 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2711  major facilitator superfamily MFS_1  38.16 
 
 		 442 aa  51.2  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.309074  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3710  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.9 
 
 		 489 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2315  hypothetical protein  28.03 
 
 		 511 aa  51.2  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.276879  normal  0.0219591 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3850  major facilitator superfamily MFS_1  26.9 
 
 		 491 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.330919  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3767  major facilitator superfamily MFS_1  26.9 
 
 		 491 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.952675  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1015  major facilitator transporter  21.79 
 
 		 502 aa  50.8  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2347  major facilitator transporter  25 
 
 		 551 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0084  major facilitator transporter  20.38 
 
 		 461 aa  50.8  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380135  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2284  putative cation symporter  21.95 
 
 		 461 aa  50.8  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974122 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.13 
 
 		 522 aa  50.4  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4300  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  24.63 
 
 		 504 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3775  major facilitator superfamily MFS_1  22.7 
 
 		 425 aa  50.1  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1654  major facilitator transporter  24.58 
 
 		 416 aa  50.1  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3697  sugar:cation symporter family protein  25.9 
 
 		 467 aa  50.1  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.455392  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2992  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.97 
 
 		 472 aa  49.7  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1354  major facilitator transporter  24.43 
 
 		 414 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00928923  normal  0.137177 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1988  major facilitator superfamily MFS_1  19.47 
 
 		 425 aa  49.7  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1056  major facilitator transporter  23.4 
 
 		 396 aa  49.3  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0999083  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0947  drug resistance transporter  28.37 
 
 		 392 aa  49.3  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05075  putative sugar transporter  22.87 
 
 		 507 aa  49.3  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0544446  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1886  major facilitator transporter  25.98 
 
 		 501 aa  49.7  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.156331  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3554  major facilitator transporter  26.81 
 
 		 423 aa  49.7  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.88 
 
 		 498 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.074494 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1527  Na+/xyloside symporter  21.5 
 
 		 444 aa  48.9  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0806  major facilitator transporter  30.19 
 
 		 419 aa  48.5  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2993  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.54 
 
 		 475 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.624539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1928  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 539 aa  48.9  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00178599  normal  0.278275 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3075  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  27.03 
 
 		 482 aa  48.9  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.818183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0375  major facilitator superfamily permease  24.18 
 
 		 411 aa  48.9  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00039813  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  34.31 
 
 		 1816 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1614  major facilitator transporter  21.66 
 
 		 448 aa  48.9  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000115723  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1912  PUCC protein  23.46 
 
 		 457 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.199112  unclonable  0.0000123013 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0454  major facilitator superfamily MFS_1  30.43 
 
 		 404 aa  48.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal  0.684757 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2179  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.57 
 
 		 587 aa  48.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00530113  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3944  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 401 aa  48.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14174  predicted protein  22.94 
 
 		 405 aa  48.1  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4370  major facilitator transporter  23.66 
 
 		 413 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0342792 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1086  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.14 
 
 		 640 aa  48.5  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  28.87 
 
 		 492 aa  47.8  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0599  transporter, putative  23.63 
 
 		 501 aa  47.8  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3844  major facilitator transporter  25.18 
 
 		 481 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.50058  normal  0.461173 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2979  major facilitator superfamily MFS_1  21.35 
 
 		 421 aa  47.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0876079  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0733  sodium:glactoside symporter family protein  30.26 
 
 		 465 aa  47.8  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.958172  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0167  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30 
 
 		 398 aa  47.8  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>