83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0689 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1560  PUCC protein  70.6 
 
 		 450 aa  644    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.507042  hitchhiker  0.000951091 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1849  PUCC protein  77.23 
 
 		 448 aa  676    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1668  PUCC protein  78.73 
 
 		 448 aa  704    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0911  PUCC protein  70.98 
 
 		 449 aa  648    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.592939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0689  PucC protein  100 
 
 		 448 aa  887    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.85813  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1461  PucC protein  69.46 
 
 		 449 aa  624  1e-178  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.833113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0990  PUCC protein  68.68 
 
 		 452 aa  620  1e-176  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0658  PUCC protein  29.64 
 
 		 472 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.573961 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1534  PUCC protein  29.78 
 
 		 457 aa  179  9e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00123663  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1903  PUCC protein  29.98 
 
 		 433 aa  178  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453505 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1912  PUCC protein  30.16 
 
 		 457 aa  177  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.199112  unclonable  0.0000123013 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3432  PUCC protein  28.03 
 
 		 434 aa  176  7e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0654139 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3332  PUCC protein  27.99 
 
 		 481 aa  176  8e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0614362 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1022  PUCC protein  29.58 
 
 		 434 aa  172  7.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1287  PUCC protein  30.52 
 
 		 432 aa  170  4e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1762  hypothetical protein  29 
 
 		 483 aa  169  8e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0355  PUCC protein  28.54 
 
 		 488 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.446739 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0028  PUCC protein  28.02 
 
 		 477 aa  164  3e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.30591  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1543  PUCC protein  30.27 
 
 		 433 aa  158  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000848404 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2893  PUCC protein  30.57 
 
 		 474 aa  155  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00562586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03411  Na+/melibiose symporter  29.58 
 
 		 472 aa  155  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3165  PUCC protein  29.57 
 
 		 474 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0360392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3746  PUCC protein  30.87 
 
 		 447 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00047851 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1707  PUCC protein  25.42 
 
 		 487 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.711762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1689  PUCC protein  25.42 
 
 		 487 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0459  PUCC protein  26.48 
 
 		 478 aa  148  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.222585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1303  PUCC protein  29.34 
 
 		 452 aa  147  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3991  light harvesting pigment MFS transporter Bch2  30.63 
 
 		 447 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.772479  normal  0.25213 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1720  PUCC protein  30.23 
 
 		 438 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3131  PUCC protein  28.82 
 
 		 452 aa  144  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.400987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0628  PUCC protein  27.19 
 
 		 449 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.319243  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5366  PUCC protein  29.15 
 
 		 455 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.238327  normal  0.20788 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2807  PUCC protein  30.68 
 
 		 472 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2898  pucC  28.16 
 
 		 467 aa  126  6e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1853  PUCC protein  28.82 
 
 		 512 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0108975 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0979  PUCC protein  28.64 
 
 		 459 aa  119  9e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2062  PUCC protein  30.57 
 
 		 455 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.035842 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6423  light harvesting pigment major facilitator family (MFS) transporter, Bch2-like protein  25.38 
 
 		 444 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0518  PUCC protein  26.43 
 
 		 449 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4821  PUCC protein  29.84 
 
 		 459 aa  111  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.052711 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1601  PUCC protein  27.31 
 
 		 447 aa  110  7.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1960  PUCC protein  28.53 
 
 		 459 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.77527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0315  light-harvesting 1 (B870) complex assembly  28.53 
 
 		 459 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5288  PUCC protein  29.91 
 
 		 458 aa  106  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.212977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0618  PUCC protein  28.76 
 
 		 480 aa  105  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.328427  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3529  PUCC protein  27.08 
 
 		 433 aa  105  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.513682 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1017  PUCC protein  27.48 
 
 		 427 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3787  PUCC protein  27.19 
 
 		 483 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1318  PUCC protein  29.37 
 
 		 477 aa  100  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153345  normal  0.172961 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0278  putative light-harvesting 1 (B870) complex assembly protein PucC  28 
 
 		 427 aa  99.8  9e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1921  PUCC protein  28 
 
 		 427 aa  99.8  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.824161 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3083  chlorophyll major facilitator superfamily (MFS) exporter PucC  25.28 
 
 		 475 aa  99.4  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4446  PucC chlorophyll MFS exporter  27.63 
 
 		 473 aa  98.2  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.742071 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4031  PucC protein, chlorophyll MFS exporter  27.38 
 
 		 473 aa  97.1  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.344544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2398  PUCC protein  27.03 
 
 		 475 aa  96.3  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.6432  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3785  PUCC protein  27.03 
 
 		 475 aa  96.3  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0284698 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1632  PUCC protein  27.56 
 
 		 475 aa  96.3  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.369944  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1680  PUCC protein  27.73 
 
 		 478 aa  95.5  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6412  photosynthetic complex (LH1) assembly protein LhaA  26.84 
 
 		 477 aa  95.5  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3539  PUCC protein  28.01 
 
 		 481 aa  94.7  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1652  light-harvesting 1 (B870) complex assembly protein PucC-like  23.77 
 
 		 459 aa  93.6  7e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1735  PUCC protein  27.63 
 
 		 477 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1583  PUCC protein  27.51 
 
 		 465 aa  92.8  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.652092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3713  PUCC protein  29 
 
 		 448 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368833  hitchhiker  0.000507532 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3731  PUCC protein  29.82 
 
 		 477 aa  89.7  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.532821  hitchhiker  0.00503136 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3976  LhaA protein  28.99 
 
 		 477 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27032  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0166  PUCC protein  28.84 
 
 		 417 aa  85.1  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1240  PUCC protein  26.45 
 
 		 484 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000359132  unclonable  0.0000000283623 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0156  PUCC protein  26.98 
 
 		 478 aa  84.3  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0290  light-harvesting 1 (B870) complex assembly  26.43 
 
 		 479 aa  84  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1933  PUCC protein  26.43 
 
 		 479 aa  84  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0707  hypothetical protein  25.48 
 
 		 463 aa  79.3  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2037  PUCC protein  28.06 
 
 		 476 aa  79  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5356  PUCC protein  27.8 
 
 		 481 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1005  PUCC protein  29.32 
 
 		 479 aa  74.7  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3723  PUCC protein  28.16 
 
 		 476 aa  73.9  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0690908 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4811  PUCC protein  27.44 
 
 		 481 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.200059 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5278  PUCC protein  27.78 
 
 		 481 aa  69.7  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1843  PUCC protein  24.44 
 
 		 475 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.085296 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2885  major facilitator transporter  24.41 
 
 		 432 aa  57  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00035649  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5086  major facilitator superfamily MFS_1  21.46 
 
 		 457 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0501179  normal  0.911731 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0035  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 808 aa  45.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0511713  decreased coverage  0.0019821 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11276  drug-transport integral membrane protein  32.38 
 
 		 579 aa  43.1  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.201451 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>