80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2807 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2807  PUCC protein  100 
 
 
472 aa  923    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2893  PUCC protein  56.28 
 
 
474 aa  501  1e-140  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00562586  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3165  PUCC protein  54.98 
 
 
474 aa  487  1e-136  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0360392  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0979  PUCC protein  36.98 
 
 
459 aa  228  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3083  chlorophyll major facilitator superfamily (MFS) exporter PucC  37.16 
 
 
475 aa  221  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0618  PUCC protein  35.44 
 
 
480 aa  218  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.328427  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0315  light-harvesting 1 (B870) complex assembly  36.25 
 
 
459 aa  216  5e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1960  PUCC protein  36.25 
 
 
459 aa  216  5e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.77527  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3731  PUCC protein  37.03 
 
 
477 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.532821  hitchhiker  0.00503136 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1735  PUCC protein  35.93 
 
 
477 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1632  PUCC protein  36.93 
 
 
475 aa  213  7.999999999999999e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.369944  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3787  PUCC protein  35.75 
 
 
483 aa  212  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6412  photosynthetic complex (LH1) assembly protein LhaA  35.37 
 
 
477 aa  210  6e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1680  PUCC protein  35.15 
 
 
478 aa  209  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4446  PucC chlorophyll MFS exporter  35.32 
 
 
473 aa  209  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.742071 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2898  pucC  36.69 
 
 
467 aa  208  1e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4031  PucC protein, chlorophyll MFS exporter  35.07 
 
 
473 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.344544  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1843  PUCC protein  36.19 
 
 
475 aa  207  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.085296 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3976  LhaA protein  37.79 
 
 
477 aa  205  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27032  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1240  PUCC protein  35.09 
 
 
484 aa  205  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000359132  unclonable  0.0000000283623 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1903  PUCC protein  33.48 
 
 
433 aa  205  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00453505 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2037  PUCC protein  35.85 
 
 
476 aa  204  3e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2398  PUCC protein  34.55 
 
 
475 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.6432  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3785  PUCC protein  34.29 
 
 
475 aa  203  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0284698 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3539  PUCC protein  36.04 
 
 
481 aa  202  9.999999999999999e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1583  PUCC protein  35.95 
 
 
465 aa  202  9.999999999999999e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.652092  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5356  PUCC protein  37.05 
 
 
481 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4811  PUCC protein  35.12 
 
 
481 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.200059 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1287  PUCC protein  34.15 
 
 
432 aa  200  5e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1318  PUCC protein  36.07 
 
 
477 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153345  normal  0.172961 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1543  PUCC protein  34.72 
 
 
433 aa  190  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000848404 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1005  PUCC protein  36.76 
 
 
479 aa  189  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3723  PUCC protein  35.58 
 
 
476 aa  188  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0690908 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0290  light-harvesting 1 (B870) complex assembly  39.1 
 
 
479 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5278  PUCC protein  33.71 
 
 
481 aa  187  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1933  PUCC protein  39.1 
 
 
479 aa  187  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0156  PUCC protein  34.06 
 
 
478 aa  176  7e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1022  PUCC protein  28.43 
 
 
434 aa  162  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3432  PUCC protein  29.38 
 
 
434 aa  160  5e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0654139 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0355  PUCC protein  29.98 
 
 
488 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.446739 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1534  PUCC protein  29.44 
 
 
457 aa  152  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00123663  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0518  PUCC protein  30.47 
 
 
449 aa  151  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1689  PUCC protein  28.54 
 
 
487 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1707  PUCC protein  28.54 
 
 
487 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.711762  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1912  PUCC protein  29.95 
 
 
457 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.199112  unclonable  0.0000123013 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1461  PucC protein  30.13 
 
 
449 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.833113  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1668  PUCC protein  30.41 
 
 
448 aa  143  5e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1762  hypothetical protein  30.39 
 
 
483 aa  142  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1560  PUCC protein  31.28 
 
 
450 aa  139  8.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.507042  hitchhiker  0.000951091 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0459  PUCC protein  28.54 
 
 
478 aa  137  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.222585  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1849  PUCC protein  30.42 
 
 
448 aa  136  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0658  PUCC protein  29.78 
 
 
472 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.573961 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0028  PUCC protein  28.79 
 
 
477 aa  134  3e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.30591  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3332  PUCC protein  29.37 
 
 
481 aa  134  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0614362 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03411  Na+/melibiose symporter  30.15 
 
 
472 aa  133  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0911  PUCC protein  29.75 
 
 
449 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.592939  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3131  PUCC protein  27.88 
 
 
452 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.400987  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0990  PUCC protein  29.59 
 
 
452 aa  131  3e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3529  PUCC protein  28.1 
 
 
433 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.513682 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3991  light harvesting pigment MFS transporter Bch2  29.02 
 
 
447 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.772479  normal  0.25213 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0689  PucC protein  30.72 
 
 
448 aa  126  8.000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.85813  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3746  PUCC protein  29.08 
 
 
447 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00047851 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1921  PUCC protein  28.44 
 
 
427 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.824161 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1720  PUCC protein  29.79 
 
 
438 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0278  putative light-harvesting 1 (B870) complex assembly protein PucC  28.64 
 
 
427 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3713  PUCC protein  28.54 
 
 
448 aa  120  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368833  hitchhiker  0.000507532 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1017  PUCC protein  27.21 
 
 
427 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1303  PUCC protein  27.15 
 
 
452 aa  113  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2062  PUCC protein  28.75 
 
 
455 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.035842 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0628  PUCC protein  26.56 
 
 
449 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.319243  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6423  light harvesting pigment major facilitator family (MFS) transporter, Bch2-like protein  26.96 
 
 
444 aa  109  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1853  PUCC protein  27.56 
 
 
512 aa  104  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0108975 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5288  PUCC protein  28.15 
 
 
458 aa  104  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.212977  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4821  PUCC protein  28.92 
 
 
459 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.052711 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5366  PUCC protein  28.16 
 
 
455 aa  101  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.238327  normal  0.20788 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1652  light-harvesting 1 (B870) complex assembly protein PucC-like  29.29 
 
 
459 aa  99.8  9e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1601  PUCC protein  25.11 
 
 
447 aa  91.3  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0166  PUCC protein  25.54 
 
 
417 aa  82.4  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0707  hypothetical protein  23.92 
 
 
463 aa  53.1  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1579  multidrug resistance protein MdtH  28.7 
 
 
402 aa  44.3  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>