79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2893 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3165  PUCC protein  86.71 
 
 		 474 aa  786    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0360392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2893  PUCC protein  100 
 
 		 474 aa  907    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00562586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2807  PUCC protein  56.28 
 
 		 472 aa  501  1e-140  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1680  PUCC protein  38.27 
 
 		 478 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0618  PUCC protein  36.73 
 
 		 480 aa  233  8.000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.328427  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2898  pucC  35.96 
 
 		 467 aa  229  8e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3785  PUCC protein  39.04 
 
 		 475 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0284698 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4446  PucC chlorophyll MFS exporter  38.61 
 
 		 473 aa  226  7e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.742071 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4031  PucC protein, chlorophyll MFS exporter  38.61 
 
 		 473 aa  226  8e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.344544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2398  PUCC protein  39.04 
 
 		 475 aa  226  9e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.6432  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3083  chlorophyll major facilitator superfamily (MFS) exporter PucC  36.26 
 
 		 475 aa  225  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1240  PUCC protein  37.17 
 
 		 484 aa  220  5e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000359132  unclonable  0.0000000283623 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3787  PUCC protein  36.14 
 
 		 483 aa  217  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1583  PUCC protein  38.64 
 
 		 465 aa  214  3.9999999999999995e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.652092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0979  PUCC protein  35.5 
 
 		 459 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4811  PUCC protein  37.14 
 
 		 481 aa  208  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.200059 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6412  photosynthetic complex (LH1) assembly protein LhaA  34.66 
 
 		 477 aa  206  6e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3539  PUCC protein  37.53 
 
 		 481 aa  206  7e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1287  PUCC protein  35.33 
 
 		 432 aa  206  8e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1632  PUCC protein  34.8 
 
 		 475 aa  203  5e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.369944  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5356  PUCC protein  36.9 
 
 		 481 aa  203  5e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2037  PUCC protein  37.5 
 
 		 476 aa  202  8e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1903  PUCC protein  34.54 
 
 		 433 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453505 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3432  PUCC protein  33.49 
 
 		 434 aa  199  7e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0654139 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1843  PUCC protein  38.66 
 
 		 475 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.085296 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1960  PUCC protein  35.91 
 
 		 459 aa  196  9e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.77527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0315  light-harvesting 1 (B870) complex assembly  35.91 
 
 		 459 aa  196  9e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3723  PUCC protein  36.79 
 
 		 476 aa  194  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0690908 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1318  PUCC protein  35.56 
 
 		 477 aa  193  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153345  normal  0.172961 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1022  PUCC protein  32.75 
 
 		 434 aa  193  6e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5278  PUCC protein  35.84 
 
 		 481 aa  192  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1005  PUCC protein  36.74 
 
 		 479 aa  189  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1933  PUCC protein  36.98 
 
 		 479 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0290  light-harvesting 1 (B870) complex assembly  37.35 
 
 		 479 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1735  PUCC protein  33.78 
 
 		 477 aa  186  9e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1543  PUCC protein  35.25 
 
 		 433 aa  186  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000848404 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0156  PUCC protein  34.72 
 
 		 478 aa  184  3e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3731  PUCC protein  34 
 
 		 477 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.532821  hitchhiker  0.00503136 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1461  PucC protein  30.73 
 
 		 449 aa  179  1e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.833113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3976  LhaA protein  33.56 
 
 		 477 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27032  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0355  PUCC protein  31.03 
 
 		 488 aa  173  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.446739 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1560  PUCC protein  29.38 
 
 		 450 aa  167  4e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.507042  hitchhiker  0.000951091 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1668  PUCC protein  30.8 
 
 		 448 aa  167  4e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1762  hypothetical protein  32.19 
 
 		 483 aa  166  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3332  PUCC protein  30.05 
 
 		 481 aa  164  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0614362 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0658  PUCC protein  30 
 
 		 472 aa  163  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.573961 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0990  PUCC protein  29.31 
 
 		 452 aa  162  1e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3991  light harvesting pigment MFS transporter Bch2  31.49 
 
 		 447 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.772479  normal  0.25213 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1534  PUCC protein  29.6 
 
 		 457 aa  161  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00123663  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3746  PUCC protein  30.26 
 
 		 447 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00047851 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1849  PUCC protein  29.32 
 
 		 448 aa  158  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1720  PUCC protein  30.52 
 
 		 438 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0518  PUCC protein  31.83 
 
 		 449 aa  157  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1912  PUCC protein  28.9 
 
 		 457 aa  156  6e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.199112  unclonable  0.0000123013 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0911  PUCC protein  29.5 
 
 		 449 aa  157  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.592939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0459  PUCC protein  28.61 
 
 		 478 aa  156  8e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.222585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1689  PUCC protein  28.87 
 
 		 487 aa  156  9e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1707  PUCC protein  28.87 
 
 		 487 aa  156  9e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.711762  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0028  PUCC protein  29.33 
 
 		 477 aa  154  5e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.30591  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1303  PUCC protein  29.6 
 
 		 452 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3529  PUCC protein  29.08 
 
 		 433 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.513682 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1921  PUCC protein  30.9 
 
 		 427 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.824161 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0278  putative light-harvesting 1 (B870) complex assembly protein PucC  30.37 
 
 		 427 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0628  PUCC protein  29.48 
 
 		 449 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.319243  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0689  PucC protein  29.43 
 
 		 448 aa  146  6e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.85813  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03411  Na+/melibiose symporter  28.26 
 
 		 472 aa  143  8e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1017  PUCC protein  29.52 
 
 		 427 aa  141  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6423  light harvesting pigment major facilitator family (MFS) transporter, Bch2-like protein  29.29 
 
 		 444 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3713  PUCC protein  29.36 
 
 		 448 aa  139  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368833  hitchhiker  0.000507532 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3131  PUCC protein  26.76 
 
 		 452 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.400987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1853  PUCC protein  32.24 
 
 		 512 aa  133  9e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0108975 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5366  PUCC protein  28.6 
 
 		 455 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.238327  normal  0.20788 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4821  PUCC protein  29.31 
 
 		 459 aa  124  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.052711 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2062  PUCC protein  28.4 
 
 		 455 aa  124  4e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.035842 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5288  PUCC protein  29.31 
 
 		 458 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.212977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1601  PUCC protein  29.35 
 
 		 447 aa  120  6e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1652  light-harvesting 1 (B870) complex assembly protein PucC-like  29.32 
 
 		 459 aa  112  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0166  PUCC protein  29.89 
 
 		 417 aa  104  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0707  hypothetical protein  28 
 
 		 463 aa  62.4  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>