79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0156 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3539  PUCC protein  71.85 
 
 		 481 aa  660    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0156  PUCC protein  100 
 
 		 478 aa  944    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1933  PUCC protein  65.26 
 
 		 479 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0290  light-harvesting 1 (B870) complex assembly  65.05 
 
 		 479 aa  560  1e-158  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1005  PUCC protein  65.89 
 
 		 479 aa  556  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0618  PUCC protein  57.54 
 
 		 480 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.328427  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6412  photosynthetic complex (LH1) assembly protein LhaA  55.95 
 
 		 477 aa  465  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3723  PUCC protein  57.88 
 
 		 476 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0690908 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4811  PUCC protein  57.84 
 
 		 481 aa  443  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.200059 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2037  PUCC protein  57.86 
 
 		 476 aa  441  1e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5356  PUCC protein  57.62 
 
 		 481 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1318  PUCC protein  55.39 
 
 		 477 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153345  normal  0.172961 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1735  PUCC protein  55.81 
 
 		 477 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3731  PUCC protein  56.21 
 
 		 477 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.532821  hitchhiker  0.00503136 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3976  LhaA protein  56.09 
 
 		 477 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27032  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5278  PUCC protein  57.84 
 
 		 481 aa  426  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1843  PUCC protein  57.39 
 
 		 475 aa  422  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.085296 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3083  chlorophyll major facilitator superfamily (MFS) exporter PucC  54.59 
 
 		 475 aa  419  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3787  PUCC protein  55.78 
 
 		 483 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1240  PUCC protein  54.99 
 
 		 484 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000359132  unclonable  0.0000000283623 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1680  PUCC protein  53.22 
 
 		 478 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3785  PUCC protein  53.71 
 
 		 475 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0284698 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2398  PUCC protein  53.71 
 
 		 475 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.6432  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4446  PucC chlorophyll MFS exporter  53.12 
 
 		 473 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.742071 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4031  PucC protein, chlorophyll MFS exporter  53.73 
 
 		 473 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.344544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0979  PUCC protein  48.8 
 
 		 459 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2898  pucC  52.42 
 
 		 467 aa  380  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1583  PUCC protein  51.66 
 
 		 465 aa  365  1e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.652092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0315  light-harvesting 1 (B870) complex assembly  49.12 
 
 		 459 aa  358  9e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1960  PUCC protein  49.12 
 
 		 459 aa  358  9e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.77527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1632  PUCC protein  46.59 
 
 		 475 aa  354  2e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.369944  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2893  PUCC protein  34.27 
 
 		 474 aa  212  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00562586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3165  PUCC protein  34.27 
 
 		 474 aa  198  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0360392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2807  PUCC protein  33.17 
 
 		 472 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1903  PUCC protein  31.15 
 
 		 433 aa  159  8e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453505 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1287  PUCC protein  29.9 
 
 		 432 aa  143  9e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3432  PUCC protein  27.46 
 
 		 434 aa  139  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0654139 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1022  PUCC protein  27.95 
 
 		 434 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0355  PUCC protein  28.29 
 
 		 488 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.446739 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3991  light harvesting pigment MFS transporter Bch2  28.33 
 
 		 447 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.772479  normal  0.25213 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0028  PUCC protein  26.81 
 
 		 477 aa  132  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.30591  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1017  PUCC protein  28.67 
 
 		 427 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1543  PUCC protein  29.71 
 
 		 433 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000848404 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0459  PUCC protein  29.27 
 
 		 478 aa  128  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.222585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1720  PUCC protein  29.34 
 
 		 438 aa  126  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1303  PUCC protein  28.22 
 
 		 452 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03411  Na+/melibiose symporter  28.67 
 
 		 472 aa  126  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3529  PUCC protein  27.75 
 
 		 433 aa  126  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.513682 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3332  PUCC protein  27.19 
 
 		 481 aa  125  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0614362 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0628  PUCC protein  28 
 
 		 449 aa  124  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.319243  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1921  PUCC protein  27.96 
 
 		 427 aa  123  9e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.824161 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3746  PUCC protein  27.84 
 
 		 447 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00047851 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2062  PUCC protein  27.21 
 
 		 455 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.035842 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1689  PUCC protein  25 
 
 		 487 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1707  PUCC protein  25 
 
 		 487 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.711762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0278  putative light-harvesting 1 (B870) complex assembly protein PucC  27.63 
 
 		 427 aa  121  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0658  PUCC protein  28.1 
 
 		 472 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.573961 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1762  hypothetical protein  28.33 
 
 		 483 aa  119  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6423  light harvesting pigment major facilitator family (MFS) transporter, Bch2-like protein  27.29 
 
 		 444 aa  119  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1601  PUCC protein  31.49 
 
 		 447 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0990  PUCC protein  26.44 
 
 		 452 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1668  PUCC protein  25.69 
 
 		 448 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4821  PUCC protein  28.87 
 
 		 459 aa  114  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.052711 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5366  PUCC protein  28.53 
 
 		 455 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.238327  normal  0.20788 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1461  PucC protein  28.64 
 
 		 449 aa  113  9e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.833113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5288  PUCC protein  29.13 
 
 		 458 aa  108  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.212977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0518  PUCC protein  27.48 
 
 		 449 aa  107  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0911  PUCC protein  26.38 
 
 		 449 aa  107  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.592939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1912  PUCC protein  25.9 
 
 		 457 aa  103  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.199112  unclonable  0.0000123013 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1849  PUCC protein  26.05 
 
 		 448 aa  103  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1534  PUCC protein  27.19 
 
 		 457 aa  100  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00123663  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1853  PUCC protein  27.25 
 
 		 512 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0108975 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1560  PUCC protein  25.67 
 
 		 450 aa  96.3  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.507042  hitchhiker  0.000951091 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3713  PUCC protein  28.89 
 
 		 448 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368833  hitchhiker  0.000507532 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0689  PucC protein  25.47 
 
 		 448 aa  94.4  4e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.85813  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1652  light-harvesting 1 (B870) complex assembly protein PucC-like  26.94 
 
 		 459 aa  90.1  7e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0166  PUCC protein  27.65 
 
 		 417 aa  86.3  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3131  PUCC protein  25.87 
 
 		 452 aa  81.6  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.400987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0707  hypothetical protein  32.69 
 
 		 463 aa  54.3  0.000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>