81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0628 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0628  PUCC protein  100 
 
 		 449 aa  851    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.319243  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3746  PUCC protein  61.42 
 
 		 447 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00047851 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3991  light harvesting pigment MFS transporter Bch2  60.71 
 
 		 447 aa  478  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.772479  normal  0.25213 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1720  PUCC protein  59.35 
 
 		 438 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1303  PUCC protein  58.66 
 
 		 452 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5366  PUCC protein  56.51 
 
 		 455 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.238327  normal  0.20788 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3529  PUCC protein  53.44 
 
 		 433 aa  404  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.513682 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1601  PUCC protein  54.79 
 
 		 447 aa  396  1e-109  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2062  PUCC protein  56.25 
 
 		 455 aa  392  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.035842 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1853  PUCC protein  55.69 
 
 		 512 aa  388  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0108975 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4821  PUCC protein  56.74 
 
 		 459 aa  384  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.052711 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5288  PUCC protein  55.56 
 
 		 458 aa  378  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.212977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6423  light harvesting pigment major facilitator family (MFS) transporter, Bch2-like protein  53.57 
 
 		 444 aa  376  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0278  putative light-harvesting 1 (B870) complex assembly protein PucC  51.15 
 
 		 427 aa  368  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1921  PUCC protein  51.15 
 
 		 427 aa  368  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.824161 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1017  PUCC protein  51.61 
 
 		 427 aa  364  2e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3713  PUCC protein  54.69 
 
 		 448 aa  359  5e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368833  hitchhiker  0.000507532 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0166  PUCC protein  42.82 
 
 		 417 aa  237  4e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2893  PUCC protein  30.22 
 
 		 474 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00562586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1668  PUCC protein  27.01 
 
 		 448 aa  150  5e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1461  PucC protein  29.42 
 
 		 449 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.833113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1560  PUCC protein  28.25 
 
 		 450 aa  146  6e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.507042  hitchhiker  0.000951091 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3165  PUCC protein  29.36 
 
 		 474 aa  143  8e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0360392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0990  PUCC protein  28.38 
 
 		 452 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1287  PUCC protein  28.93 
 
 		 432 aa  140  4.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0689  PucC protein  28.13 
 
 		 448 aa  138  2e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.85813  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1534  PUCC protein  30.27 
 
 		 457 aa  137  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00123663  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1903  PUCC protein  28.9 
 
 		 433 aa  134  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453505 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1849  PUCC protein  27.02 
 
 		 448 aa  133  6.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3432  PUCC protein  29.45 
 
 		 434 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0654139 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1912  PUCC protein  28.67 
 
 		 457 aa  131  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.199112  unclonable  0.0000123013 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0911  PUCC protein  27.35 
 
 		 449 aa  129  8.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.592939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3539  PUCC protein  26.37 
 
 		 481 aa  125  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1022  PUCC protein  28.54 
 
 		 434 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0459  PUCC protein  28.41 
 
 		 478 aa  124  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.222585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3131  PUCC protein  27.83 
 
 		 452 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.400987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0518  PUCC protein  30.25 
 
 		 449 aa  118  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1689  PUCC protein  27.11 
 
 		 487 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1707  PUCC protein  27.11 
 
 		 487 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.711762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1762  hypothetical protein  28.91 
 
 		 483 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0355  PUCC protein  27.39 
 
 		 488 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.446739 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1543  PUCC protein  28.44 
 
 		 433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000848404 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2807  PUCC protein  26.56 
 
 		 472 aa  114  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3332  PUCC protein  28.29 
 
 		 481 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0614362 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0979  PUCC protein  28.41 
 
 		 459 aa  111  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0658  PUCC protein  27.23 
 
 		 472 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.573961 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6412  photosynthetic complex (LH1) assembly protein LhaA  27.39 
 
 		 477 aa  110  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0618  PUCC protein  26.93 
 
 		 480 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.328427  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0028  PUCC protein  26.49 
 
 		 477 aa  108  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.30591  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2898  pucC  28.85 
 
 		 467 aa  105  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0156  PUCC protein  29.52 
 
 		 478 aa  102  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1960  PUCC protein  28.04 
 
 		 459 aa  101  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.77527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0315  light-harvesting 1 (B870) complex assembly  28.04 
 
 		 459 aa  101  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3787  PUCC protein  27.97 
 
 		 483 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1632  PUCC protein  27.43 
 
 		 475 aa  100  4e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.369944  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03411  Na+/melibiose symporter  26.32 
 
 		 472 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3785  PUCC protein  29.72 
 
 		 475 aa  99  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0284698 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1680  PUCC protein  28.41 
 
 		 478 aa  98.2  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4031  PucC protein, chlorophyll MFS exporter  29.45 
 
 		 473 aa  97.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.344544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2398  PUCC protein  29.52 
 
 		 475 aa  97.1  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.6432  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4446  PucC chlorophyll MFS exporter  29.22 
 
 		 473 aa  95.9  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.742071 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1583  PUCC protein  28.94 
 
 		 465 aa  95.5  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.652092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3083  chlorophyll major facilitator superfamily (MFS) exporter PucC  26.21 
 
 		 475 aa  94.7  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1240  PUCC protein  28.24 
 
 		 484 aa  94  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000359132  unclonable  0.0000000283623 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1318  PUCC protein  28.46 
 
 		 477 aa  90.9  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153345  normal  0.172961 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0290  light-harvesting 1 (B870) complex assembly  27.27 
 
 		 479 aa  90.5  5e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1933  PUCC protein  27.27 
 
 		 479 aa  90.1  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4811  PUCC protein  28.07 
 
 		 481 aa  87  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.200059 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5356  PUCC protein  26.98 
 
 		 481 aa  86.7  8e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1652  light-harvesting 1 (B870) complex assembly protein PucC-like  27.04 
 
 		 459 aa  86.3  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1843  PUCC protein  27.84 
 
 		 475 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.085296 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1735  PUCC protein  27.78 
 
 		 477 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3731  PUCC protein  27.55 
 
 		 477 aa  83.2  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.532821  hitchhiker  0.00503136 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5278  PUCC protein  29.39 
 
 		 481 aa  80.5  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3976  LhaA protein  27.72 
 
 		 477 aa  79.7  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27032  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1005  PUCC protein  27.86 
 
 		 479 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2037  PUCC protein  28.87 
 
 		 476 aa  72  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3723  PUCC protein  26.33 
 
 		 476 aa  66.6  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0690908 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0326  major facilitator transporter  30.91 
 
 		 462 aa  45.4  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000804058  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2141  major facilitator superfamily MFS_1  30.4 
 
 		 462 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.154122 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0707  hypothetical protein  25.85 
 
 		 463 aa  44.3  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>