78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5366 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_5288  PUCC protein  93.08 
 
 		 458 aa  695    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.212977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4821  PUCC protein  91.23 
 
 		 459 aa  704    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.052711 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5366  PUCC protein  100 
 
 		 455 aa  864    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.238327  normal  0.20788 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1853  PUCC protein  71.95 
 
 		 512 aa  527  1e-148  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0108975 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3713  PUCC protein  68.76 
 
 		 448 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368833  hitchhiker  0.000507532 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3991  light harvesting pigment MFS transporter Bch2  58.53 
 
 		 447 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.772479  normal  0.25213 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3746  PUCC protein  59.76 
 
 		 447 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00047851 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1720  PUCC protein  59.04 
 
 		 438 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1303  PUCC protein  56.42 
 
 		 452 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0628  PUCC protein  56.51 
 
 		 449 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.319243  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6423  light harvesting pigment major facilitator family (MFS) transporter, Bch2-like protein  53.1 
 
 		 444 aa  391  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2062  PUCC protein  55.4 
 
 		 455 aa  377  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.035842 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3529  PUCC protein  53.49 
 
 		 433 aa  372  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.513682 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1601  PUCC protein  52.98 
 
 		 447 aa  351  1e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0278  putative light-harvesting 1 (B870) complex assembly protein PucC  52.4 
 
 		 427 aa  348  8e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1921  PUCC protein  52.4 
 
 		 427 aa  348  1e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.824161 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1017  PUCC protein  51.92 
 
 		 427 aa  331  2e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0166  PUCC protein  43.41 
 
 		 417 aa  228  2e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2893  PUCC protein  30.19 
 
 		 474 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00562586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1668  PUCC protein  27.4 
 
 		 448 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1903  PUCC protein  29.3 
 
 		 433 aa  132  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453505 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1287  PUCC protein  29.28 
 
 		 432 aa  129  9.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0689  PucC protein  29.16 
 
 		 448 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.85813  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0979  PUCC protein  29.12 
 
 		 459 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3165  PUCC protein  28.43 
 
 		 474 aa  123  6e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0360392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1461  PucC protein  27.38 
 
 		 449 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.833113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1849  PUCC protein  27.4 
 
 		 448 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1560  PUCC protein  27.29 
 
 		 450 aa  122  9.999999999999999e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.507042  hitchhiker  0.000951091 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1543  PUCC protein  29.56 
 
 		 433 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000848404 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1762  hypothetical protein  30.72 
 
 		 483 aa  119  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3539  PUCC protein  27.84 
 
 		 481 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1022  PUCC protein  29.28 
 
 		 434 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0911  PUCC protein  27.34 
 
 		 449 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.592939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3432  PUCC protein  28.6 
 
 		 434 aa  117  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0654139 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0990  PUCC protein  27.15 
 
 		 452 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1960  PUCC protein  28.44 
 
 		 459 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.77527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1534  PUCC protein  29.22 
 
 		 457 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00123663  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0315  light-harvesting 1 (B870) complex assembly  28.44 
 
 		 459 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1912  PUCC protein  29.27 
 
 		 457 aa  110  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.199112  unclonable  0.0000123013 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6412  photosynthetic complex (LH1) assembly protein LhaA  29.14 
 
 		 477 aa  109  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0618  PUCC protein  28.41 
 
 		 480 aa  109  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.328427  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1933  PUCC protein  29.82 
 
 		 479 aa  109  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1632  PUCC protein  28.24 
 
 		 475 aa  108  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.369944  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0518  PUCC protein  28.38 
 
 		 449 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0290  light-harvesting 1 (B870) complex assembly  29.47 
 
 		 479 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0658  PUCC protein  26.77 
 
 		 472 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.573961 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2807  PUCC protein  29.18 
 
 		 472 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0459  PUCC protein  26.61 
 
 		 478 aa  103  7e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.222585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0355  PUCC protein  28.83 
 
 		 488 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.446739 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0156  PUCC protein  29.78 
 
 		 478 aa  102  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1318  PUCC protein  30.79 
 
 		 477 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153345  normal  0.172961 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03411  Na+/melibiose symporter  26.8 
 
 		 472 aa  99.8  8e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1735  PUCC protein  29.49 
 
 		 477 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3787  PUCC protein  26.95 
 
 		 483 aa  98.2  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3332  PUCC protein  28.6 
 
 		 481 aa  97.8  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0614362 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0028  PUCC protein  26.92 
 
 		 477 aa  95.1  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.30591  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3731  PUCC protein  28.95 
 
 		 477 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.532821  hitchhiker  0.00503136 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5356  PUCC protein  29.81 
 
 		 481 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4811  PUCC protein  30.08 
 
 		 481 aa  94  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.200059 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3083  chlorophyll major facilitator superfamily (MFS) exporter PucC  27.82 
 
 		 475 aa  93.2  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1583  PUCC protein  29.33 
 
 		 465 aa  93.2  8e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.652092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2398  PUCC protein  29.41 
 
 		 475 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.6432  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2037  PUCC protein  30.31 
 
 		 476 aa  91.3  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3785  PUCC protein  29.19 
 
 		 475 aa  90.9  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0284698 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1689  PUCC protein  25.82 
 
 		 487 aa  90.5  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1707  PUCC protein  25.82 
 
 		 487 aa  90.5  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.711762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2898  pucC  27.17 
 
 		 467 aa  90.9  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1680  PUCC protein  27.05 
 
 		 478 aa  90.5  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1240  PUCC protein  27.74 
 
 		 484 aa  89.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000359132  unclonable  0.0000000283623 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3976  LhaA protein  30.11 
 
 		 477 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27032  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4031  PucC protein, chlorophyll MFS exporter  30.22 
 
 		 473 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.344544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3723  PUCC protein  29.03 
 
 		 476 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0690908 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4446  PucC chlorophyll MFS exporter  29.98 
 
 		 473 aa  87.8  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.742071 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1005  PUCC protein  26.47 
 
 		 479 aa  87  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5278  PUCC protein  31.7 
 
 		 481 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1843  PUCC protein  29.43 
 
 		 475 aa  83.6  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.085296 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3131  PUCC protein  25.39 
 
 		 452 aa  78.2  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.400987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1652  light-harvesting 1 (B870) complex assembly protein PucC-like  27.19 
 
 		 459 aa  61.2  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>