79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3991 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1303  PUCC protein  83.48 
 
 		 452 aa  708    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1720  PUCC protein  87.25 
 
 		 438 aa  746    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3746  PUCC protein  90.6 
 
 		 447 aa  792    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00047851 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3991  light harvesting pigment MFS transporter Bch2  100 
 
 		 447 aa  863    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.772479  normal  0.25213 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6423  light harvesting pigment major facilitator family (MFS) transporter, Bch2-like protein  65.74 
 
 		 444 aa  502  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0628  PUCC protein  60.71 
 
 		 449 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.319243  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5366  PUCC protein  58.53 
 
 		 455 aa  428  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.238327  normal  0.20788 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4821  PUCC protein  58.7 
 
 		 459 aa  409  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.052711 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5288  PUCC protein  58.93 
 
 		 458 aa  402  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.212977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3713  PUCC protein  58.28 
 
 		 448 aa  403  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368833  hitchhiker  0.000507532 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2062  PUCC protein  57.77 
 
 		 455 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.035842 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3529  PUCC protein  52.41 
 
 		 433 aa  390  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.513682 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1601  PUCC protein  55.88 
 
 		 447 aa  390  1e-107  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1853  PUCC protein  55.63 
 
 		 512 aa  385  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0108975 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1921  PUCC protein  51.91 
 
 		 427 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.824161 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0278  putative light-harvesting 1 (B870) complex assembly protein PucC  51.91 
 
 		 427 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1017  PUCC protein  51.55 
 
 		 427 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0166  PUCC protein  43.37 
 
 		 417 aa  237  3e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1903  PUCC protein  33.03 
 
 		 433 aa  162  9e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453505 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2893  PUCC protein  31.49 
 
 		 474 aa  162  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00562586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1543  PUCC protein  33.58 
 
 		 433 aa  150  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000848404 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3165  PUCC protein  31.49 
 
 		 474 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0360392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1534  PUCC protein  31.48 
 
 		 457 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00123663  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1022  PUCC protein  31.23 
 
 		 434 aa  147  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1668  PUCC protein  30.33 
 
 		 448 aa  144  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3332  PUCC protein  29.57 
 
 		 481 aa  142  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0614362 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1912  PUCC protein  29.84 
 
 		 457 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.199112  unclonable  0.0000123013 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0689  PucC protein  30.5 
 
 		 448 aa  140  3e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.85813  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1849  PUCC protein  29.19 
 
 		 448 aa  139  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1560  PUCC protein  29.23 
 
 		 450 aa  139  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.507042  hitchhiker  0.000951091 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0459  PUCC protein  27.59 
 
 		 478 aa  138  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.222585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0990  PUCC protein  28.51 
 
 		 452 aa  138  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1461  PucC protein  29.79 
 
 		 449 aa  138  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.833113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3432  PUCC protein  29.11 
 
 		 434 aa  136  7.000000000000001e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0654139 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1287  PUCC protein  27.65 
 
 		 432 aa  136  7.000000000000001e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0658  PUCC protein  27.98 
 
 		 472 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.573961 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0911  PUCC protein  29.53 
 
 		 449 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.592939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0355  PUCC protein  29.95 
 
 		 488 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.446739 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0518  PUCC protein  29.28 
 
 		 449 aa  131  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0979  PUCC protein  27.99 
 
 		 459 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3539  PUCC protein  30.24 
 
 		 481 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2807  PUCC protein  29.02 
 
 		 472 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3131  PUCC protein  26.19 
 
 		 452 aa  127  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.400987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0618  PUCC protein  29.23 
 
 		 480 aa  125  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.328427  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0028  PUCC protein  28.7 
 
 		 477 aa  125  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.30591  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0315  light-harvesting 1 (B870) complex assembly  28.09 
 
 		 459 aa  123  7e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1960  PUCC protein  28.09 
 
 		 459 aa  123  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.77527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1762  hypothetical protein  30.64 
 
 		 483 aa  122  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3787  PUCC protein  28.99 
 
 		 483 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2898  pucC  28.27 
 
 		 467 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3083  chlorophyll major facilitator superfamily (MFS) exporter PucC  28.6 
 
 		 475 aa  119  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1707  PUCC protein  26.15 
 
 		 487 aa  119  9e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.711762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1689  PUCC protein  26.15 
 
 		 487 aa  119  9e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6412  photosynthetic complex (LH1) assembly protein LhaA  28.98 
 
 		 477 aa  119  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1240  PUCC protein  29.3 
 
 		 484 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000359132  unclonable  0.0000000283623 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1735  PUCC protein  29.68 
 
 		 477 aa  117  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0290  light-harvesting 1 (B870) complex assembly  30.88 
 
 		 479 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1933  PUCC protein  30.88 
 
 		 479 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2398  PUCC protein  29.37 
 
 		 475 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.6432  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3785  PUCC protein  29.37 
 
 		 475 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0284698 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1680  PUCC protein  29.28 
 
 		 478 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4446  PucC chlorophyll MFS exporter  28.81 
 
 		 473 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.742071 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4031  PucC protein, chlorophyll MFS exporter  28.85 
 
 		 473 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.344544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0156  PUCC protein  30.5 
 
 		 478 aa  111  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1632  PUCC protein  27.29 
 
 		 475 aa  109  9.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.369944  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1583  PUCC protein  28.83 
 
 		 465 aa  108  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.652092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3731  PUCC protein  29.1 
 
 		 477 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.532821  hitchhiker  0.00503136 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3976  LhaA protein  30.31 
 
 		 477 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27032  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03411  Na+/melibiose symporter  26.81 
 
 		 472 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1318  PUCC protein  29.07 
 
 		 477 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153345  normal  0.172961 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1005  PUCC protein  30.18 
 
 		 479 aa  100  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2037  PUCC protein  28.17 
 
 		 476 aa  100  8e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5356  PUCC protein  28.47 
 
 		 481 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4811  PUCC protein  28.12 
 
 		 481 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.200059 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3723  PUCC protein  29.04 
 
 		 476 aa  93.6  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0690908 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5278  PUCC protein  29.06 
 
 		 481 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1652  light-harvesting 1 (B870) complex assembly protein PucC-like  25.92 
 
 		 459 aa  83.6  0.000000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1843  PUCC protein  27.17 
 
 		 475 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.085296 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0707  hypothetical protein  26.72 
 
 		 463 aa  46.2  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>