81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_1707 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1707  PUCC protein  100 
 
 
487 aa  967    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.711762  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1689  PUCC protein  100 
 
 
487 aa  967    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0355  PUCC protein  59.46 
 
 
488 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.446739 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0459  PUCC protein  56.29 
 
 
478 aa  541  1e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.222585  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0658  PUCC protein  56.48 
 
 
472 aa  524  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.573961 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3332  PUCC protein  52.17 
 
 
481 aa  496  1e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0614362 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1762  hypothetical protein  51.2 
 
 
483 aa  488  1e-137  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0028  PUCC protein  52.3 
 
 
477 aa  479  1e-134  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.30591  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03411  Na+/melibiose symporter  36.06 
 
 
472 aa  273  5.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1652  light-harvesting 1 (B870) complex assembly protein PucC-like  30.45 
 
 
459 aa  187  2e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1903  PUCC protein  28.23 
 
 
433 aa  183  7e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00453505 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0990  PUCC protein  28.96 
 
 
452 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1287  PUCC protein  28.29 
 
 
432 aa  171  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1543  PUCC protein  27.35 
 
 
433 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000848404 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1534  PUCC protein  28.81 
 
 
457 aa  167  4e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00123663  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1912  PUCC protein  29.44 
 
 
457 aa  166  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.199112  unclonable  0.0000123013 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1560  PUCC protein  27.16 
 
 
450 aa  162  1e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.507042  hitchhiker  0.000951091 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3432  PUCC protein  27.39 
 
 
434 aa  160  6e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0654139 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1022  PUCC protein  27.97 
 
 
434 aa  158  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2893  PUCC protein  28.87 
 
 
474 aa  156  9e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00562586  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1461  PucC protein  27.97 
 
 
449 aa  151  3e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.833113  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0707  hypothetical protein  31.05 
 
 
463 aa  150  4e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2807  PUCC protein  28.54 
 
 
472 aa  150  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3165  PUCC protein  26.28 
 
 
474 aa  144  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0360392  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1668  PUCC protein  25.79 
 
 
448 aa  144  3e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0911  PUCC protein  26.47 
 
 
449 aa  144  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.592939  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0689  PucC protein  25 
 
 
448 aa  144  5e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.85813  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1849  PUCC protein  26.2 
 
 
448 aa  144  5e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0518  PUCC protein  26.19 
 
 
449 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0618  PUCC protein  27.97 
 
 
480 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.328427  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3131  PUCC protein  24.95 
 
 
452 aa  133  6e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.400987  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3991  light harvesting pigment MFS transporter Bch2  26.15 
 
 
447 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.772479  normal  0.25213 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3746  PUCC protein  26.5 
 
 
447 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00047851 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6412  photosynthetic complex (LH1) assembly protein LhaA  26.33 
 
 
477 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1720  PUCC protein  26.02 
 
 
438 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4811  PUCC protein  26.23 
 
 
481 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.200059 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5356  PUCC protein  26.49 
 
 
481 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3539  PUCC protein  27.42 
 
 
481 aa  113  6e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1680  PUCC protein  25.73 
 
 
478 aa  113  9e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2037  PUCC protein  25.31 
 
 
476 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1632  PUCC protein  23.91 
 
 
475 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.369944  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0628  PUCC protein  26.9 
 
 
449 aa  111  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.319243  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4031  PucC protein, chlorophyll MFS exporter  25.4 
 
 
473 aa  111  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.344544  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3785  PUCC protein  26.33 
 
 
475 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0284698 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3787  PUCC protein  24.71 
 
 
483 aa  110  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1240  PUCC protein  26.09 
 
 
484 aa  110  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000359132  unclonable  0.0000000283623 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2398  PUCC protein  26.33 
 
 
475 aa  110  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.6432  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4446  PucC chlorophyll MFS exporter  25.17 
 
 
473 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.742071 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3529  PUCC protein  26 
 
 
433 aa  109  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.513682 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1318  PUCC protein  25.85 
 
 
477 aa  107  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153345  normal  0.172961 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2898  pucC  24.36 
 
 
467 aa  107  6e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1303  PUCC protein  24.46 
 
 
452 aa  106  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3083  chlorophyll major facilitator superfamily (MFS) exporter PucC  26.15 
 
 
475 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0979  PUCC protein  26.75 
 
 
459 aa  105  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1735  PUCC protein  25.71 
 
 
477 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0290  light-harvesting 1 (B870) complex assembly  24.46 
 
 
479 aa  100  8e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1933  PUCC protein  25.07 
 
 
479 aa  99.8  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1843  PUCC protein  25.4 
 
 
475 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.085296 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5278  PUCC protein  25.97 
 
 
481 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0278  putative light-harvesting 1 (B870) complex assembly protein PucC  26.27 
 
 
427 aa  99.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1921  PUCC protein  26.27 
 
 
427 aa  99  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.824161 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3723  PUCC protein  25.65 
 
 
476 aa  98.2  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0690908 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3731  PUCC protein  24.88 
 
 
477 aa  96.7  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.532821  hitchhiker  0.00503136 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1583  PUCC protein  24.3 
 
 
465 aa  96.7  9e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.652092  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0156  PUCC protein  24.41 
 
 
478 aa  96.3  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0315  light-harvesting 1 (B870) complex assembly  26.21 
 
 
459 aa  94.4  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1960  PUCC protein  26.21 
 
 
459 aa  94.4  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.77527  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6423  light harvesting pigment major facilitator family (MFS) transporter, Bch2-like protein  24.18 
 
 
444 aa  94  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1017  PUCC protein  26.61 
 
 
427 aa  92.8  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1005  PUCC protein  24.16 
 
 
479 aa  93.2  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3976  LhaA protein  26.37 
 
 
477 aa  91.3  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27032  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5366  PUCC protein  25.72 
 
 
455 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.238327  normal  0.20788 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5288  PUCC protein  25.67 
 
 
458 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.212977  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0166  PUCC protein  26.09 
 
 
417 aa  80.1  0.00000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4821  PUCC protein  25.58 
 
 
459 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.052711 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1601  PUCC protein  25.31 
 
 
447 aa  78.6  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2062  PUCC protein  23.66 
 
 
455 aa  73.9  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.035842 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1853  PUCC protein  23.53 
 
 
512 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0108975 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3713  PUCC protein  26.46 
 
 
448 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368833  hitchhiker  0.000507532 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1232  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.25 
 
 
396 aa  47.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.104179  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0040  florfenicol/chloramphenicol resistance protein FloR  35.06 
 
 
404 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>