More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_pSN254_0040 on replicon NC_009140
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009140  SNSL254_pSN254_0040  florfenicol/chloramphenicol resistance protein FloR  100 
 
 		 404 aa  784    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009636  Smed_2519  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  65.42 
 
 		 399 aa  486  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.632928 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1232  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  62.66 
 
 		 396 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.104179  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1320  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  64.16 
 
 		 395 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3862  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  59.45 
 
 		 399 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.984629 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4704  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  58.94 
 
 		 399 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381793  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3944  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  59.14 
 
 		 401 aa  441  9.999999999999999e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_3659  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  58.94 
 
 		 399 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154078  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1335  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  60.72 
 
 		 397 aa  425  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.409904  n/a   
 
 
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NC_011071  Smal_3550  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  58.38 
 
 		 395 aa  410  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2449  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  58.08 
 
 		 410 aa  392  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3389  hypothetical protein  84.48 
 
 		 244 aa  372  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0402028 
 
 
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NC_011092  SeSA_B0064  chloramphenicol resistance protein  48.77 
 
 		 419 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.629663 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2204  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  44.56 
 
 		 402 aa  278  2e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0543  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily protein  33.63 
 
 		 400 aa  162  9e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00469398  normal  1 
 
 
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NC_009727  CBUD_1271  multidrug resistance transporter, Bcr family  29.81 
 
 		 398 aa  160  3e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0103038  n/a   
 
 
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NC_010117  COXBURSA331_A1329  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.81 
 
 		 398 aa  160  3e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00139075  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0297  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.74 
 
 		 401 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.169159  n/a   
 
 
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NC_010506  Swoo_0254  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.85 
 
 		 400 aa  155  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.662405 
 
 
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NC_007963  Csal_2509  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.33 
 
 		 389 aa  154  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009831  Ssed_0254  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.95 
 
 		 400 aa  153  7e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009901  Spea_3956  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.27 
 
 		 400 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00358  permease  31.38 
 
 		 423 aa  147  5e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007954  Sden_3494  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.44 
 
 		 402 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.61895  n/a   
 
 
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NC_008700  Sama_3448  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  32.44 
 
 		 400 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011663  Sbal223_0196  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.99 
 
 		 402 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009052  Sbal_0196  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.99 
 
 		 402 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009997  Sbal195_4271  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.99 
 
 		 402 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0763382 
 
 
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NC_009092  Shew_3588  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.85 
 
 		 400 aa  145  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009665  Shew185_4138  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.99 
 
 		 402 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011312  VSAL_I2992  MFS transporter  31.55 
 
 		 401 aa  144  3e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_2744  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.04 
 
 		 397 aa  140  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000519122 
 
 
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NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.62 
 
 		 405 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013456  VEA_002080  putative multidrug resistance protein  30.46 
 
 		 397 aa  139  7.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B1765  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.02 
 
 		 413 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236916  hitchhiker  0.00655505 
 
 
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NC_009438  Sputcn32_0325  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.81 
 
 		 402 aa  137  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008322  Shewmr7_3823  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.16 
 
 		 402 aa  136  5e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008321  Shewmr4_3750  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.44 
 
 		 402 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008577  Shewana3_3948  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.16 
 
 		 402 aa  135  9e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_004347  SO_4555  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  31.44 
 
 		 402 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.01 
 
 		 394 aa  133  6e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
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NC_008786  Veis_4226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.71 
 
 		 465 aa  132  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.693691  normal  1 
 
 
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NC_008541  Arth_3242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.12 
 
 		 425 aa  130  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008782  Ajs_1702  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.73 
 
 		 412 aa  130  5.0000000000000004e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
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NC_009457  VC0395_A2445  putative multidrug resistance protein  30.4 
 
 		 400 aa  130  6e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.63 
 
 		 392 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_3271  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.78 
 
 		 411 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.638949 
 
 
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NC_013421  Pecwa_2254  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.14 
 
 		 399 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.637118  n/a   
 
 
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NC_006369  lpl2359  hypothetical protein  27.89 
 
 		 371 aa  127  5e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_012917  PC1_1958  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.98 
 
 		 400 aa  127  5e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.799827  n/a   
 
 
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NC_006368  lpp2505  hypothetical protein  27.89 
 
 		 371 aa  126  7e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_011992  Dtpsy_2001  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.38 
 
 		 412 aa  125  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0443671  n/a   
 
 
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NC_008391  Bamb_3668  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.73 
 
 		 411 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.55924 
 
 
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NC_012917  PC1_1452  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.72 
 
 		 418 aa  125  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266521  n/a   
 
 
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NC_007948  Bpro_3211  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.57 
 
 		 424 aa  125  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008543  Bcen2424_4246  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.49 
 
 		 411 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381159  normal  0.103625 
 
 
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NC_007925  RPC_4760  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.29 
 
 		 399 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  1 
 
 
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NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  29.29 
 
 		 420 aa  124  4e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
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NC_013730  Slin_3348  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.49 
 
 		 411 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.241483 
 
 
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NC_010002  Daci_5152  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.68 
 
 		 413 aa  121  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.600108 
 
 
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NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.86 
 
 		 405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
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NC_007802  Jann_3375  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.99 
 
 		 405 aa  121  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0699824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0774  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.51 
 
 		 403 aa  121  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0782  n/a   
 
 
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NC_008061  Bcen_4120  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.21 
 
 		 411 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174908  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20220  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.89 
 
 		 415 aa  120  3.9999999999999996e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.179817 
 
 
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NC_008835  BMA10229_1058  Bcr/CflA family drug resistance transporter  27.03 
 
 		 403 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2033  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.03 
 
 		 403 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.67 
 
 		 414 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0765  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.03 
 
 		 403 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.356599  n/a   
 
 
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NC_008255  CHU_2159  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.62 
 
 		 410 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1774  Bcr/CflA family drug resistance transporter  27.03 
 
 		 395 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_5989  sugar (and other) transporter  33.61 
 
 		 411 aa  120  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.291494  normal  0.241739 
 
 
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NC_010465  YPK_2106  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.31 
 
 		 397 aa  119  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.758817  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_1996  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.31 
 
 		 397 aa  119  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0683  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.77 
 
 		 403 aa  119  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.8441  n/a   
 
 
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NC_008825  Mpe_A3595  putative membrane transport protein  30.37 
 
 		 404 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007958  RPD_3380  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.23 
 
 		 444 aa  119  9e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.27624  decreased coverage  0.00175601 
 
 
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NC_012791  Vapar_3322  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.66 
 
 		 406 aa  119  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013421  Pecwa_1841  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.79 
 
 		 418 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007778  RPB_2009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.19 
 
 		 429 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175256  normal  0.467375 
 
 
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NC_012791  Vapar_2897  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.38 
 
 		 396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151649  n/a   
 
 
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NC_011989  Avi_3518  MFS permease  26.68 
 
 		 401 aa  117  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009485  BBta_4704  putative drug resistance transporter  35.59 
 
 		 402 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.096379  normal  0.25889 
 
 
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NC_009952  Dshi_0717  multidrug resistance protein  37.15 
 
 		 408 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.29522  normal  1 
 
 
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NC_007435  BURPS1710b_A2059  putative transporter protein  27.03 
 
 		 403 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
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NC_012912  Dd1591_3852  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.94 
 
 		 407 aa  117  5e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.64308  n/a   
 
 
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NC_007650  BTH_II1915  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.99 
 
 		 411 aa  116  6e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009717  Xaut_4936  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.89 
 
 		 409 aa  116  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380942  normal  1 
 
 
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NC_009484  Acry_0848  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.55 
 
 		 404 aa  116  7.999999999999999e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.19 
 
 		 401 aa  116  8.999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
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NC_008599  CFF8240_0011  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.61 
 
 		 400 aa  116  8.999999999999998e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.461677  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.7 
 
 		 424 aa  115  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal  1 
 
 
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NC_010322  PputGB1_0634  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.32 
 
 		 393 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000940614 
 
 
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NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.41 
 
 		 398 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.17 
 
 		 393 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
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NC_007974  Rmet_4752  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  31.43 
 
 		 426 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.328295 
 
 
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NC_013037  Dfer_1982  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.48 
 
 		 416 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011992  Dtpsy_2456  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.86 
 
 		 418 aa  114  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.202004  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  29.4 
 
 		 392 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.04 
 
 		 409 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.707115 
 
 
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