78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0707 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0707  hypothetical protein  100 
 
 		 463 aa  894    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1652  light-harvesting 1 (B870) complex assembly protein PucC-like  59.69 
 
 		 459 aa  478  1e-133  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1762  hypothetical protein  35.85 
 
 		 483 aa  239  6.999999999999999e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0355  PUCC protein  32.54 
 
 		 488 aa  215  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.446739 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3332  PUCC protein  30.62 
 
 		 481 aa  209  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0614362 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1707  PUCC protein  31.69 
 
 		 487 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.711762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1689  PUCC protein  31.69 
 
 		 487 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0028  PUCC protein  30.48 
 
 		 477 aa  196  7e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.30591  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0658  PUCC protein  29.41 
 
 		 472 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.573961 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0459  PUCC protein  28.63 
 
 		 478 aa  183  6e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.222585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03411  Na+/melibiose symporter  29 
 
 		 472 aa  166  9e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1461  PucC protein  26.07 
 
 		 449 aa  123  5e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.833113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1534  PUCC protein  27.29 
 
 		 457 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00123663  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1912  PUCC protein  27.23 
 
 		 457 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.199112  unclonable  0.0000123013 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0990  PUCC protein  25.86 
 
 		 452 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1560  PUCC protein  23.97 
 
 		 450 aa  118  3e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.507042  hitchhiker  0.000951091 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0689  PucC protein  25.64 
 
 		 448 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.85813  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1668  PUCC protein  25.38 
 
 		 448 aa  110  5e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2893  PUCC protein  28.07 
 
 		 474 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00562586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1903  PUCC protein  26.92 
 
 		 433 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453505 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1849  PUCC protein  23.94 
 
 		 448 aa  105  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3432  PUCC protein  26.15 
 
 		 434 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0654139 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1287  PUCC protein  26.56 
 
 		 432 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1022  PUCC protein  27.81 
 
 		 434 aa  100  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1543  PUCC protein  25.97 
 
 		 433 aa  100  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000848404 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0911  PUCC protein  22.68 
 
 		 449 aa  99.8  8e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.592939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3131  PUCC protein  26.15 
 
 		 452 aa  99.8  9e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.400987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3165  PUCC protein  26.88 
 
 		 474 aa  99  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0360392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1318  PUCC protein  29.2 
 
 		 477 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153345  normal  0.172961 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0518  PUCC protein  27.07 
 
 		 449 aa  95.5  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0618  PUCC protein  30.62 
 
 		 480 aa  95.1  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.328427  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0290  light-harvesting 1 (B870) complex assembly  28 
 
 		 479 aa  89.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1933  PUCC protein  28 
 
 		 479 aa  88.6  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3991  light harvesting pigment MFS transporter Bch2  27.77 
 
 		 447 aa  87  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.772479  normal  0.25213 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1005  PUCC protein  26.89 
 
 		 479 aa  86.7  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6412  photosynthetic complex (LH1) assembly protein LhaA  29.08 
 
 		 477 aa  86.3  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3539  PUCC protein  28.26 
 
 		 481 aa  85.1  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3746  PUCC protein  27.54 
 
 		 447 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00047851 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1017  PUCC protein  28.83 
 
 		 427 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0156  PUCC protein  32.11 
 
 		 478 aa  83.6  0.000000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3787  PUCC protein  28.64 
 
 		 483 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0278  putative light-harvesting 1 (B870) complex assembly protein PucC  27.9 
 
 		 427 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1921  PUCC protein  27.9 
 
 		 427 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.824161 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3731  PUCC protein  29.02 
 
 		 477 aa  80.9  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.532821  hitchhiker  0.00503136 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0979  PUCC protein  25.6 
 
 		 459 aa  80.1  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2898  pucC  26.23 
 
 		 467 aa  79.7  0.00000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0628  PUCC protein  27.42 
 
 		 449 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.319243  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2807  PUCC protein  25.19 
 
 		 472 aa  79  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3529  PUCC protein  27.55 
 
 		 433 aa  78.2  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.513682 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1735  PUCC protein  27.39 
 
 		 477 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1303  PUCC protein  28.13 
 
 		 452 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4811  PUCC protein  29.32 
 
 		 481 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.200059 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2398  PUCC protein  26.47 
 
 		 475 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.6432  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1720  PUCC protein  25.74 
 
 		 438 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3976  LhaA protein  27.98 
 
 		 477 aa  77  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27032  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4031  PucC protein, chlorophyll MFS exporter  27.79 
 
 		 473 aa  77.4  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.344544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4446  PucC chlorophyll MFS exporter  27.55 
 
 		 473 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.742071 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3785  PUCC protein  26.47 
 
 		 475 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0284698 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0315  light-harvesting 1 (B870) complex assembly  25.51 
 
 		 459 aa  74.7  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5356  PUCC protein  29.32 
 
 		 481 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1960  PUCC protein  25.51 
 
 		 459 aa  74.7  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.77527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3723  PUCC protein  29.72 
 
 		 476 aa  73.9  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0690908 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1240  PUCC protein  26.85 
 
 		 484 aa  73.6  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000359132  unclonable  0.0000000283623 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1632  PUCC protein  25.54 
 
 		 475 aa  72.4  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.369944  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1583  PUCC protein  26.94 
 
 		 465 aa  72  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.652092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2062  PUCC protein  28.47 
 
 		 455 aa  70.5  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.035842 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1680  PUCC protein  23.95 
 
 		 478 aa  70.5  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0166  PUCC protein  26.21 
 
 		 417 aa  68.2  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3083  chlorophyll major facilitator superfamily (MFS) exporter PucC  26.44 
 
 		 475 aa  67.8  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2037  PUCC protein  29.52 
 
 		 476 aa  67  0.0000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1601  PUCC protein  27.62 
 
 		 447 aa  63.9  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6423  light harvesting pigment major facilitator family (MFS) transporter, Bch2-like protein  25.24 
 
 		 444 aa  63.5  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5278  PUCC protein  29.87 
 
 		 481 aa  62  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1853  PUCC protein  25.76 
 
 		 512 aa  52  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0108975 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4821  PUCC protein  25.89 
 
 		 459 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.052711 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5288  PUCC protein  25.63 
 
 		 458 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.212977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5366  PUCC protein  26.22 
 
 		 455 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.238327  normal  0.20788 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1843  PUCC protein  36.36 
 
 		 475 aa  43.1  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.085296 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>