79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1583 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1583  PUCC protein  100 
 
 		 465 aa  902    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.652092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2898  pucC  67.41 
 
 		 467 aa  543  1e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0979  PUCC protein  62.53 
 
 		 459 aa  528  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1960  PUCC protein  60.22 
 
 		 459 aa  499  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.77527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0315  light-harvesting 1 (B870) complex assembly  60.22 
 
 		 459 aa  499  1e-140  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2398  PUCC protein  61.35 
 
 		 475 aa  495  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.6432  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4031  PucC protein, chlorophyll MFS exporter  62.39 
 
 		 473 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.344544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3083  chlorophyll major facilitator superfamily (MFS) exporter PucC  61.45 
 
 		 475 aa  494  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3785  PUCC protein  61.57 
 
 		 475 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0284698 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4446  PucC chlorophyll MFS exporter  61.94 
 
 		 473 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.742071 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3787  PUCC protein  61.59 
 
 		 483 aa  491  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1240  PUCC protein  63.99 
 
 		 484 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000359132  unclonable  0.0000000283623 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1680  PUCC protein  58.17 
 
 		 478 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0618  PUCC protein  56.26 
 
 		 480 aa  449  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.328427  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2037  PUCC protein  57.68 
 
 		 476 aa  441  1e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4811  PUCC protein  57.08 
 
 		 481 aa  419  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.200059 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6412  photosynthetic complex (LH1) assembly protein LhaA  54.92 
 
 		 477 aa  418  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5356  PUCC protein  57.08 
 
 		 481 aa  414  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3723  PUCC protein  57.24 
 
 		 476 aa  410  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0690908 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3976  LhaA protein  55.6 
 
 		 477 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27032  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1843  PUCC protein  58.24 
 
 		 475 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.085296 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1318  PUCC protein  54.51 
 
 		 477 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153345  normal  0.172961 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3731  PUCC protein  54.51 
 
 		 477 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.532821  hitchhiker  0.00503136 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1735  PUCC protein  53.85 
 
 		 477 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5278  PUCC protein  57.3 
 
 		 481 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3539  PUCC protein  52.61 
 
 		 481 aa  381  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1632  PUCC protein  50.22 
 
 		 475 aa  379  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.369944  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0156  PUCC protein  51.66 
 
 		 478 aa  355  6.999999999999999e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1933  PUCC protein  50.78 
 
 		 479 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0290  light-harvesting 1 (B870) complex assembly  50.33 
 
 		 479 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1005  PUCC protein  50.88 
 
 		 479 aa  336  5e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2893  PUCC protein  39.07 
 
 		 474 aa  231  1e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00562586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2807  PUCC protein  36.53 
 
 		 472 aa  221  3e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3165  PUCC protein  38.21 
 
 		 474 aa  219  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0360392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1022  PUCC protein  32.73 
 
 		 434 aa  161  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1903  PUCC protein  31.34 
 
 		 433 aa  161  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453505 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1287  PUCC protein  31.66 
 
 		 432 aa  159  8e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3432  PUCC protein  31.54 
 
 		 434 aa  159  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0654139 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0028  PUCC protein  28.29 
 
 		 477 aa  139  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.30591  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0355  PUCC protein  28.86 
 
 		 488 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.446739 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1543  PUCC protein  30.65 
 
 		 433 aa  137  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000848404 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0990  PUCC protein  28.61 
 
 		 452 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3332  PUCC protein  27.25 
 
 		 481 aa  133  9e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0614362 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1720  PUCC protein  30.22 
 
 		 438 aa  126  9e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3746  PUCC protein  31.14 
 
 		 447 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00047851 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0518  PUCC protein  27.17 
 
 		 449 aa  123  7e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1668  PUCC protein  28.24 
 
 		 448 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3991  light harvesting pigment MFS transporter Bch2  29.32 
 
 		 447 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.772479  normal  0.25213 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0459  PUCC protein  26.6 
 
 		 478 aa  118  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.222585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1303  PUCC protein  29.96 
 
 		 452 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1689  PUCC protein  24.84 
 
 		 487 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1707  PUCC protein  24.84 
 
 		 487 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.711762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1762  hypothetical protein  28.75 
 
 		 483 aa  116  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1461  PucC protein  28.91 
 
 		 449 aa  113  7.000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.833113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1849  PUCC protein  27.93 
 
 		 448 aa  110  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1652  light-harvesting 1 (B870) complex assembly protein PucC-like  28.23 
 
 		 459 aa  108  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0911  PUCC protein  27.47 
 
 		 449 aa  107  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.592939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0658  PUCC protein  27.76 
 
 		 472 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.573961 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1560  PUCC protein  28.07 
 
 		 450 aa  105  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.507042  hitchhiker  0.000951091 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5366  PUCC protein  29.72 
 
 		 455 aa  104  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.238327  normal  0.20788 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0689  PucC protein  28.24 
 
 		 448 aa  102  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.85813  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0628  PUCC protein  29.66 
 
 		 449 aa  101  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.319243  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3529  PUCC protein  29.14 
 
 		 433 aa  99  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.513682 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2062  PUCC protein  28.28 
 
 		 455 aa  98.2  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.035842 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4821  PUCC protein  29.23 
 
 		 459 aa  93.6  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.052711 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3713  PUCC protein  32.53 
 
 		 448 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368833  hitchhiker  0.000507532 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1921  PUCC protein  28.04 
 
 		 427 aa  92.8  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.824161 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03411  Na+/melibiose symporter  25.53 
 
 		 472 aa  92.8  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0278  putative light-harvesting 1 (B870) complex assembly protein PucC  27.7 
 
 		 427 aa  92  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1017  PUCC protein  27.83 
 
 		 427 aa  92  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1601  PUCC protein  30.26 
 
 		 447 aa  90.9  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5288  PUCC protein  28.61 
 
 		 458 aa  90.1  9e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.212977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1853  PUCC protein  28.54 
 
 		 512 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0108975 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1534  PUCC protein  25.07 
 
 		 457 aa  84.3  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00123663  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6423  light harvesting pigment major facilitator family (MFS) transporter, Bch2-like protein  26.45 
 
 		 444 aa  81.3  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1912  PUCC protein  25.33 
 
 		 457 aa  80.5  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.199112  unclonable  0.0000123013 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3131  PUCC protein  25.29 
 
 		 452 aa  79  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.400987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0166  PUCC protein  27.73 
 
 		 417 aa  73.6  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0707  hypothetical protein  30.1 
 
 		 463 aa  55.5  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>