73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5086 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5086  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 457 aa  922    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0501179  normal  0.911731 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0975  hypothetical protein  44.96 
 
 		 498 aa  423  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.798408  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1657  major facilitator transporter  45.26 
 
 		 518 aa  419  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01889  sugar transporter  45.17 
 
 		 493 aa  421  1e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.660327  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1925  major facilitator transporter  44.07 
 
 		 531 aa  414  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2108  major facilitator transporter  43.87 
 
 		 531 aa  412  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.753085 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2458  transporter, putative  43.28 
 
 		 529 aa  409  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0599  transporter, putative  43.71 
 
 		 501 aa  409  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1870  major facilitator transporter  43.87 
 
 		 531 aa  410  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2738  major facilitator transporter  44.36 
 
 		 510 aa  394  1e-108  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.934726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1015  major facilitator transporter  43.03 
 
 		 502 aa  382  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1500  major facilitator transporter  45.66 
 
 		 448 aa  380  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.21091 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0864  major facilitator transporter  44.19 
 
 		 441 aa  352  8e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1886  major facilitator transporter  40.3 
 
 		 501 aa  349  7e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.156331  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0596  major facilitator transporter  42.48 
 
 		 500 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.377823  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05075  putative sugar transporter  53.75 
 
 		 507 aa  288  1e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0544446  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1089  major facilitator superfamily MFS_1  35.8 
 
 		 509 aa  285  1.0000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.339374  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1403  major facilitator transporter  55.46 
 
 		 505 aa  281  2e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.206645  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0053  major facilitator transporter  37.3 
 
 		 449 aa  273  4.0000000000000004e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000090495  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1874  major facilitator transporter  54.81 
 
 		 524 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322942  normal  0.129685 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2452  major facilitator transporter  51.16 
 
 		 551 aa  266  5e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2336  major facilitator transporter  52.92 
 
 		 551 aa  266  5e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2011  major facilitator superfamily MFS_1  51.16 
 
 		 551 aa  266  5e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000990966  hitchhiker  0.000202625 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2347  major facilitator transporter  51.16 
 
 		 551 aa  266  5e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2187  major facilitator transporter  54.19 
 
 		 502 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2003  major facilitator transporter  54.46 
 
 		 530 aa  263  4e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0041  major facilitator superfamily permease  34.77 
 
 		 471 aa  263  4e-69  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000141077  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0087  major facilitator transporter  35.51 
 
 		 457 aa  262  1e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000315537  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0994  major facilitator superfamily permease  35.19 
 
 		 450 aa  262  1e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.211502  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1776  major facilitator transporter  52.36 
 
 		 519 aa  261  1e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0516559  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2202  major facilitator transporter  53.36 
 
 		 551 aa  260  3e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000401875 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0893  major facilitator superfamily permease  34.68 
 
 		 450 aa  260  3e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1877  major facilitator transporter  34.86 
 
 		 458 aa  259  9e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4087  major facilitator transporter  53.28 
 
 		 514 aa  252  9.000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2441  transporter, putative  34.08 
 
 		 453 aa  249  9e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0973262  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1614  major facilitator transporter  34.87 
 
 		 448 aa  247  4e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000115723  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0084  major facilitator transporter  36.18 
 
 		 461 aa  245  9e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380135  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0898  major facilitator superfamily permease  34.82 
 
 		 454 aa  244  1.9999999999999999e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0832  major facilitator superfamily permease  32.65 
 
 		 453 aa  240  2.9999999999999997e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000561592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1021  major facilitator superfamily MFS_1  53.42 
 
 		 495 aa  235  1.0000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3953  major facilitator superfamily MFS_1  32.35 
 
 		 457 aa  229  6e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02413  sugar transporter  33.97 
 
 		 443 aa  228  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01240  sugar transporter  32.73 
 
 		 428 aa  224  3e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.686511  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01510  conserved hypothetical protein  28.87 
 
 		 459 aa  108  3e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02289  sucrose transporter, putative (Eurofung)  23.42 
 
 		 635 aa  73.6  0.000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01690  conserved hypothetical protein  23.36 
 
 		 674 aa  68.2  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.887535  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1599  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 421 aa  64.3  0.000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2885  major facilitator transporter  24.16 
 
 		 432 aa  58.2  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00035649  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0454  major facilitator superfamily MFS_1  25.42 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal  0.684757 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0523  major facilitator transporter  24.48 
 
 		 416 aa  57  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0798  transporter, putative  25.42 
 
 		 442 aa  53.9  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3149  major facilitator superfamily MFS_1  27.56 
 
 		 460 aa  50.1  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1610  major facilitator transporter  32.71 
 
 		 404 aa  49.3  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1560  PUCC protein  22.94 
 
 		 450 aa  49.7  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.507042  hitchhiker  0.000951091 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  23.02 
 
 		 411 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0616  major facilitator superfamily MFS_1  22.45 
 
 		 443 aa  48.9  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0461422  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1406  major facilitator transporter  20.7 
 
 		 401 aa  48.9  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000773977  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2622  sugar transporter, glycoside-pentoside-hexuronide  33.66 
 
 		 479 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.455215  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3738  hypothetical protein  34.95 
 
 		 467 aa  48.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00183877  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1406  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.93 
 
 		 471 aa  48.1  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2450  major facilitator superfamily MFS_1  23.47 
 
 		 407 aa  46.6  0.0009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.557384  normal  0.479748 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0034  major facilitator superfamily MFS_1  29.75 
 
 		 435 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2904  tetracycline resistance protein  23.26 
 
 		 411 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.316872  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0575  major facilitator transporter  27.56 
 
 		 461 aa  45.8  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3554  major facilitator transporter  24.21 
 
 		 423 aa  45.8  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14174  predicted protein  30.77 
 
 		 405 aa  45.1  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0269  major facilitator transporter  28.26 
 
 		 506 aa  45.1  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02710  Major Facilitator Superfamily transporter  26.74 
 
 		 428 aa  44.3  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4281  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 423 aa  44.3  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.502977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4367  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 493 aa  43.9  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0200  major facilitator superfamily MFS_1  21.57 
 
 		 415 aa  43.9  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0353  major facilitator transporter  22.66 
 
 		 464 aa  43.5  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.939472  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2247  major facilitator transporter  25.78 
 
 		 399 aa  43.5  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224163  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>