66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3953 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3953  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
457 aa  924    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1877  major facilitator transporter  44.82 
 
 
458 aa  379  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02413  sugar transporter  47.22 
 
 
443 aa  374  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01240  sugar transporter  47.88 
 
 
428 aa  343  2.9999999999999997e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.686511  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1500  major facilitator transporter  41.03 
 
 
448 aa  300  3e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.21091 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1089  major facilitator superfamily MFS_1  36.29 
 
 
509 aa  294  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.339374  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0864  major facilitator transporter  40.79 
 
 
441 aa  288  2e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2452  major facilitator transporter  31.56 
 
 
551 aa  252  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2011  major facilitator superfamily MFS_1  31.56 
 
 
551 aa  252  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000990966  hitchhiker  0.000202625 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2347  major facilitator transporter  31.18 
 
 
551 aa  250  3e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0599  transporter, putative  32.86 
 
 
501 aa  249  7e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870524  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2336  major facilitator transporter  31.37 
 
 
551 aa  249  7e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1657  major facilitator transporter  32.17 
 
 
518 aa  231  2e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5086  major facilitator superfamily MFS_1  32.35 
 
 
457 aa  229  6e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0501179  normal  0.911731 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1886  major facilitator transporter  31.97 
 
 
501 aa  225  1e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.156331  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2738  major facilitator transporter  33 
 
 
510 aa  224  2e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.934726  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01889  sugar transporter  30.77 
 
 
493 aa  223  7e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.660327  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1021  major facilitator superfamily MFS_1  32.18 
 
 
495 aa  214  2.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0975  hypothetical protein  28.81 
 
 
498 aa  210  3e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.798408  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0994  major facilitator superfamily permease  30.42 
 
 
450 aa  178  2e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.211502  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1870  major facilitator transporter  41.38 
 
 
531 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2108  major facilitator transporter  41.38 
 
 
531 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.753085 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0893  major facilitator superfamily permease  29.45 
 
 
450 aa  175  9.999999999999999e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05075  putative sugar transporter  41.23 
 
 
507 aa  175  1.9999999999999998e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0544446  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1925  major facilitator transporter  41.38 
 
 
531 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2458  transporter, putative  41.81 
 
 
529 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2003  major facilitator transporter  39.43 
 
 
530 aa  173  5e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1403  major facilitator transporter  42.2 
 
 
505 aa  165  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.206645  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2187  major facilitator transporter  40.89 
 
 
502 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1874  major facilitator transporter  41.55 
 
 
524 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322942  normal  0.129685 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1015  major facilitator transporter  41.9 
 
 
502 aa  161  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2202  major facilitator transporter  40.72 
 
 
551 aa  162  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000401875 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0087  major facilitator transporter  27.39 
 
 
457 aa  160  5e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000315537  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1776  major facilitator transporter  38.5 
 
 
519 aa  159  8e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0516559  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0898  major facilitator superfamily permease  26.01 
 
 
454 aa  156  8e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4087  major facilitator transporter  42.67 
 
 
514 aa  147  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0053  major facilitator transporter  26.81 
 
 
449 aa  146  9e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000090495  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0041  major facilitator superfamily permease  26.3 
 
 
471 aa  144  3e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000141077  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1614  major facilitator transporter  25.11 
 
 
448 aa  140  4.999999999999999e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000115723  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0832  major facilitator superfamily permease  27.42 
 
 
453 aa  135  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000561592  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0084  major facilitator transporter  24.59 
 
 
461 aa  134  3.9999999999999996e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380135  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0596  major facilitator transporter  38.83 
 
 
500 aa  130  6e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.377823  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2441  transporter, putative  24.24 
 
 
453 aa  128  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0973262  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01510  conserved hypothetical protein  26.71 
 
 
459 aa  85.1  0.000000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02289  sucrose transporter, putative (Eurofung)  27.55 
 
 
635 aa  61.2  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02710  Major Facilitator Superfamily transporter  33.03 
 
 
428 aa  56.2  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199882  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0846  glycoside-Pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  26.5 
 
 
416 aa  54.7  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  31.98 
 
 
387 aa  50.8  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0892  major facilitator transporter  30.22 
 
 
424 aa  49.3  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.805867  normal  0.497197 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3996  major facilitator transporter  33.8 
 
 
438 aa  49.3  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01690  conserved hypothetical protein  24.01 
 
 
674 aa  47.4  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.887535  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03160  Na+/melibiose symporter-like transporter  33.33 
 
 
419 aa  47  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2885  major facilitator transporter  28.95 
 
 
432 aa  47  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00035649  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  27.84 
 
 
389 aa  47  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3190  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  38.24 
 
 
460 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2906  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  38.24 
 
 
460 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2315  hypothetical protein  31.25 
 
 
511 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.276879  normal  0.0219591 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3149  major facilitator superfamily MFS_1  34.29 
 
 
460 aa  45.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0034  major facilitator superfamily MFS_1  32.23 
 
 
435 aa  45.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2378  major facilitator superfamily MFS_1  30.86 
 
 
415 aa  45.1  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0248  major facilitator transporter  40.32 
 
 
486 aa  44.3  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.135747  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2711  major facilitator superfamily MFS_1  52.5 
 
 
442 aa  44.3  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.309074  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4281  major facilitator superfamily MFS_1  31.52 
 
 
423 aa  43.5  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.502977  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4313  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  21.75 
 
 
497 aa  43.5  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0453293  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1997  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.14 
 
 
477 aa  43.1  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4367  major facilitator transporter  40.74 
 
 
493 aa  43.1  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>