65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0893 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0893  major facilitator superfamily permease  100 
 
 		 450 aa  904    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0994  major facilitator superfamily permease  94 
 
 		 450 aa  855    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.211502  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0087  major facilitator transporter  63.68 
 
 		 457 aa  575  1.0000000000000001e-163  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000315537  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0053  major facilitator transporter  65.56 
 
 		 449 aa  572  1.0000000000000001e-162  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000090495  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0832  major facilitator superfamily permease  60.94 
 
 		 453 aa  560  1e-158  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000561592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1614  major facilitator transporter  55.56 
 
 		 448 aa  499  1e-140  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000115723  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0041  major facilitator superfamily permease  54.55 
 
 		 471 aa  496  1e-139  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000141077  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2441  transporter, putative  53.02 
 
 		 453 aa  468  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0973262  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0898  major facilitator superfamily permease  51.36 
 
 		 454 aa  464  1e-129  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0084  major facilitator transporter  47.13 
 
 		 461 aa  399  9.999999999999999e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380135  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0975  hypothetical protein  36.46 
 
 		 498 aa  290  3e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.798408  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01889  sugar transporter  37.01 
 
 		 493 aa  284  2.0000000000000002e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.660327  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5086  major facilitator superfamily MFS_1  34.68 
 
 		 457 aa  260  3e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0501179  normal  0.911731 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1500  major facilitator transporter  32.88 
 
 		 448 aa  238  1e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.21091 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1089  major facilitator superfamily MFS_1  28.97 
 
 		 509 aa  237  3e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.339374  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1021  major facilitator superfamily MFS_1  34.3 
 
 		 495 aa  236  5.0000000000000005e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1874  major facilitator transporter  31.76 
 
 		 524 aa  229  5e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322942  normal  0.129685 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1886  major facilitator transporter  31.8 
 
 		 501 aa  227  4e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.156331  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1657  major facilitator transporter  30.6 
 
 		 518 aa  220  3e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0864  major facilitator transporter  32.58 
 
 		 441 aa  220  5e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1015  major facilitator transporter  30.22 
 
 		 502 aa  205  1e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1403  major facilitator transporter  43.3 
 
 		 505 aa  191  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.206645  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05075  putative sugar transporter  44.34 
 
 		 507 aa  191  2.9999999999999997e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0544446  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0599  transporter, putative  38.59 
 
 		 501 aa  187  5e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4087  major facilitator transporter  29.93 
 
 		 514 aa  186  6e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1925  major facilitator transporter  29.69 
 
 		 531 aa  182  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02413  sugar transporter  30.45 
 
 		 443 aa  180  4e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2003  major facilitator transporter  43.18 
 
 		 530 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3953  major facilitator superfamily MFS_1  29.45 
 
 		 457 aa  175  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0596  major facilitator transporter  40.62 
 
 		 500 aa  173  5.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.377823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2347  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 551 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2011  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 551 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000990966  hitchhiker  0.000202625 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1877  major facilitator transporter  28.19 
 
 		 458 aa  171  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2452  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 551 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2336  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 551 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1870  major facilitator transporter  40.17 
 
 		 531 aa  168  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2202  major facilitator transporter  39.46 
 
 		 551 aa  167  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000401875 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2108  major facilitator transporter  40.17 
 
 		 531 aa  168  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.753085 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2187  major facilitator transporter  41.4 
 
 		 502 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1776  major facilitator transporter  37.08 
 
 		 519 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0516559  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2738  major facilitator transporter  38.89 
 
 		 510 aa  163  7e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.934726  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2458  transporter, putative  39.37 
 
 		 529 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01240  sugar transporter  28.31 
 
 		 428 aa  157  4e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.686511  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0200  major facilitator superfamily MFS_1  25.73 
 
 		 415 aa  87.8  4e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0523  major facilitator transporter  24.07 
 
 		 416 aa  79.3  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01510  conserved hypothetical protein  31.88 
 
 		 459 aa  71.6  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3738  hypothetical protein  23.14 
 
 		 467 aa  61.2  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00183877  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2885  major facilitator transporter  22.03 
 
 		 432 aa  56.6  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00035649  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1599  major facilitator transporter  27.92 
 
 		 421 aa  53.1  0.000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0892  major facilitator transporter  24.61 
 
 		 424 aa  52.4  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.805867  normal  0.497197 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1406  major facilitator transporter  28.29 
 
 		 401 aa  52.4  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000773977  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0616  major facilitator superfamily MFS_1  21.02 
 
 		 443 aa  50.4  0.00007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0461422  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0454  major facilitator superfamily MFS_1  23.56 
 
 		 404 aa  50.1  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal  0.684757 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2444  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 527 aa  48.5  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2955  major facilitator superfamily MFS_1  26.56 
 
 		 405 aa  48.9  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02289  sucrose transporter, putative (Eurofung)  23.7 
 
 		 635 aa  47.8  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.64 
 
 		 476 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3583  galactoside symporter  23.58 
 
 		 475 aa  47  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0819  oligogalacturonide transporter  24.8 
 
 		 524 aa  47  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0685  Na+/melibiose symporter and related transporters-like  27.66 
 
 		 455 aa  46.6  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000328828 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0575  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 461 aa  46.2  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14174  predicted protein  29.91 
 
 		 405 aa  45.1  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4367  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 493 aa  44.3  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2622  sugar transporter, glycoside-pentoside-hexuronide  55.81 
 
 		 479 aa  43.9  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.455215  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2049  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  38.89 
 
 		 469 aa  43.9  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal  0.648168 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>