75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0599 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0599  transporter, putative  100 
 
 		 501 aa  1018    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1925  major facilitator transporter  62.73 
 
 		 531 aa  632  1e-180  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2108  major facilitator transporter  62.73 
 
 		 531 aa  634  1e-180  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.753085 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1870  major facilitator transporter  62.73 
 
 		 531 aa  634  1e-180  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2011  major facilitator superfamily MFS_1  61.88 
 
 		 551 aa  621  1e-177  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000990966  hitchhiker  0.000202625 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2452  major facilitator transporter  61.88 
 
 		 551 aa  621  1e-177  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2347  major facilitator transporter  61.48 
 
 		 551 aa  618  1e-176  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2458  transporter, putative  60.97 
 
 		 529 aa  618  1e-176  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2336  major facilitator transporter  61.68 
 
 		 551 aa  618  1e-176  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1776  major facilitator transporter  60.99 
 
 		 519 aa  609  1e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0516559  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1874  major facilitator transporter  60.92 
 
 		 524 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322942  normal  0.129685 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2003  major facilitator transporter  58.41 
 
 		 530 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1657  major facilitator transporter  58.68 
 
 		 518 aa  590  1e-167  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2202  major facilitator transporter  57.45 
 
 		 551 aa  590  1e-167  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000401875 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2187  major facilitator transporter  56.14 
 
 		 502 aa  587  1e-166  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05075  putative sugar transporter  54.84 
 
 		 507 aa  557  1e-157  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0544446  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1015  major facilitator transporter  54.95 
 
 		 502 aa  551  1e-156  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1403  major facilitator transporter  53.72 
 
 		 505 aa  551  1e-156  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.206645  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1021  major facilitator superfamily MFS_1  55.73 
 
 		 495 aa  522  1e-147  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4087  major facilitator transporter  56.54 
 
 		 514 aa  520  1e-146  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2738  major facilitator transporter  51.12 
 
 		 510 aa  511  1e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.934726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1886  major facilitator transporter  50.21 
 
 		 501 aa  470  1.0000000000000001e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.156331  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5086  major facilitator superfamily MFS_1  43.71 
 
 		 457 aa  422  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0501179  normal  0.911731 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0596  major facilitator transporter  47.45 
 
 		 500 aa  420  1e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.377823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01889  sugar transporter  39.85 
 
 		 493 aa  392  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.660327  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0975  hypothetical protein  37.52 
 
 		 498 aa  376  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.798408  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0864  major facilitator transporter  42.3 
 
 		 441 aa  360  3e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1089  major facilitator superfamily MFS_1  39.04 
 
 		 509 aa  337  3.9999999999999995e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.339374  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3953  major facilitator superfamily MFS_1  32.86 
 
 		 457 aa  258  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1500  major facilitator transporter  54.72 
 
 		 448 aa  249  6e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.21091 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02413  sugar transporter  34.48 
 
 		 443 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1877  major facilitator transporter  48.58 
 
 		 458 aa  189  9e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0053  major facilitator transporter  40.09 
 
 		 449 aa  187  4e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000090495  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0893  major facilitator superfamily permease  38.59 
 
 		 450 aa  187  4e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0994  major facilitator superfamily permease  39.66 
 
 		 450 aa  186  1.0000000000000001e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.211502  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0087  major facilitator transporter  38.02 
 
 		 457 aa  175  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000315537  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01240  sugar transporter  44.76 
 
 		 428 aa  173  5e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.686511  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2441  transporter, putative  39.24 
 
 		 453 aa  172  1e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0973262  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1614  major facilitator transporter  36.71 
 
 		 448 aa  172  1e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000115723  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0041  major facilitator superfamily permease  37.34 
 
 		 471 aa  171  2e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000141077  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0832  major facilitator superfamily permease  37.19 
 
 		 453 aa  166  6.9999999999999995e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000561592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0084  major facilitator transporter  38.96 
 
 		 461 aa  163  8.000000000000001e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380135  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0898  major facilitator superfamily permease  32.92 
 
 		 454 aa  150  5e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01510  conserved hypothetical protein  28.48 
 
 		 459 aa  74.3  0.000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02289  sucrose transporter, putative (Eurofung)  26.55 
 
 		 635 aa  65.9  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1599  major facilitator transporter  26.49 
 
 		 421 aa  58.2  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3738  hypothetical protein  25.54 
 
 		 467 aa  57.8  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00183877  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02710  Major Facilitator Superfamily transporter  26.71 
 
 		 428 aa  56.6  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0523  major facilitator transporter  33.98 
 
 		 416 aa  54.3  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2049  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  25.42 
 
 		 469 aa  53.9  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0846  glycoside-Pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  24.85 
 
 		 416 aa  52.4  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3149  major facilitator superfamily MFS_1  27.11 
 
 		 460 aa  52.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0200  major facilitator superfamily MFS_1  24.05 
 
 		 415 aa  52  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0454  major facilitator superfamily MFS_1  32.63 
 
 		 404 aa  50.1  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal  0.684757 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1269  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  21.85 
 
 		 465 aa  48.9  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.727469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0034  major facilitator superfamily MFS_1  32.56 
 
 		 435 aa  49.3  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0290  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.8 
 
 		 472 aa  49.3  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000222424  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2885  major facilitator transporter  23.63 
 
 		 432 aa  48.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00035649  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4367  major facilitator transporter  23.94 
 
 		 493 aa  48.1  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1610  major facilitator transporter  30.59 
 
 		 404 aa  48.1  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01690  conserved hypothetical protein  29.73 
 
 		 674 aa  48.1  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.887535  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0269  major facilitator transporter  29.13 
 
 		 506 aa  47.4  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3267  major facilitator transporter  38.37 
 
 		 415 aa  47.4  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0780681  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0575  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 461 aa  46.2  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0892  major facilitator transporter  30.21 
 
 		 424 aa  46.2  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.805867  normal  0.497197 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4524  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.72 
 
 		 465 aa  46.6  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3554  major facilitator transporter  36 
 
 		 423 aa  45.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  29.79 
 
 		 447 aa  45.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0427  major facilitator superfamily MFS_1  28.3 
 
 		 426 aa  44.7  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2069  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 		 432 aa  44.3  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0086  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  32.04 
 
 		 1128 aa  43.9  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00331744  hitchhiker  0.000105918 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02748  cation symporter  25 
 
 		 462 aa  43.9  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4221  major facilitator transporter  29.6 
 
 		 472 aa  43.5  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.218171  normal  0.657626 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4675  major facilitator superfamily MFS_1  24.76 
 
 		 411 aa  43.5  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3697  sugar:cation symporter family protein  32.23 
 
 		 467 aa  43.1  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.455392  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>