107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2441 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2441  transporter, putative  100 
 
 		 453 aa  917    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0973262  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0041  major facilitator superfamily permease  64.94 
 
 		 471 aa  629  1e-179  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000141077  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0084  major facilitator transporter  53.45 
 
 		 461 aa  511  1e-143  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380135  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0087  major facilitator transporter  53.3 
 
 		 457 aa  497  1e-139  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000315537  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0893  major facilitator superfamily permease  53.35 
 
 		 450 aa  488  1e-136  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0053  major facilitator transporter  56.06 
 
 		 449 aa  486  1e-136  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000090495  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0832  major facilitator superfamily permease  52.67 
 
 		 453 aa  481  1e-135  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000561592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0994  major facilitator superfamily permease  53.46 
 
 		 450 aa  480  1e-134  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.211502  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1614  major facilitator transporter  50.68 
 
 		 448 aa  459  9.999999999999999e-129  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000115723  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0898  major facilitator superfamily permease  50.46 
 
 		 454 aa  455  1e-127  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0975  hypothetical protein  33.74 
 
 		 498 aa  276  4e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.798408  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01889  sugar transporter  35.55 
 
 		 493 aa  275  1.0000000000000001e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.660327  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5086  major facilitator superfamily MFS_1  34.47 
 
 		 457 aa  256  7e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0501179  normal  0.911731 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2108  major facilitator transporter  29.9 
 
 		 531 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.753085 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1870  major facilitator transporter  29.7 
 
 		 531 aa  233  6e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1925  major facilitator transporter  29.5 
 
 		 531 aa  229  6e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1886  major facilitator transporter  29.89 
 
 		 501 aa  228  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.156331  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1500  major facilitator transporter  30.88 
 
 		 448 aa  223  4e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.21091 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2458  transporter, putative  28.21 
 
 		 529 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1021  major facilitator superfamily MFS_1  30.38 
 
 		 495 aa  209  9e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0864  major facilitator transporter  31.67 
 
 		 441 aa  201  1.9999999999999998e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1089  major facilitator superfamily MFS_1  27.09 
 
 		 509 aa  195  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.339374  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02413  sugar transporter  29.27 
 
 		 443 aa  180  4.999999999999999e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2003  major facilitator transporter  38.72 
 
 		 530 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0599  transporter, putative  38.27 
 
 		 501 aa  174  3.9999999999999995e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1657  major facilitator transporter  39.09 
 
 		 518 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2202  major facilitator transporter  37.44 
 
 		 551 aa  172  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000401875 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2347  major facilitator transporter  36.25 
 
 		 551 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2336  major facilitator transporter  36.25 
 
 		 551 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2452  major facilitator transporter  36.25 
 
 		 551 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2011  major facilitator superfamily MFS_1  36.25 
 
 		 551 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000990966  hitchhiker  0.000202625 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1403  major facilitator transporter  36.28 
 
 		 505 aa  171  4e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.206645  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1877  major facilitator transporter  27.94 
 
 		 458 aa  170  5e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1776  major facilitator transporter  36.96 
 
 		 519 aa  169  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0516559  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05075  putative sugar transporter  34.84 
 
 		 507 aa  169  1e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0544446  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1874  major facilitator transporter  36.4 
 
 		 524 aa  167  4e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322942  normal  0.129685 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1015  major facilitator transporter  35.22 
 
 		 502 aa  166  5.9999999999999996e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2187  major facilitator transporter  35.17 
 
 		 502 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4087  major facilitator transporter  27.21 
 
 		 514 aa  160  6e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2738  major facilitator transporter  37.13 
 
 		 510 aa  157  4e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.934726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0596  major facilitator transporter  37.44 
 
 		 500 aa  155  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.377823  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01240  sugar transporter  27.08 
 
 		 428 aa  141  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.686511  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3953  major facilitator superfamily MFS_1  24.45 
 
 		 457 aa  131  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01510  conserved hypothetical protein  21.02 
 
 		 459 aa  66.2  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2885  major facilitator transporter  22.37 
 
 		 432 aa  64.3  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00035649  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0523  major facilitator transporter  26.26 
 
 		 416 aa  62.8  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0200  major facilitator superfamily MFS_1  23.39 
 
 		 415 aa  62  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01690  conserved hypothetical protein  23.65 
 
 		 674 aa  55.5  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.887535  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2505  putative symporter YagG  27.89 
 
 		 442 aa  54.3  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0819  oligogalacturonide transporter  22.06 
 
 		 524 aa  53.1  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02289  sucrose transporter, putative (Eurofung)  22.71 
 
 		 635 aa  52.8  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2315  hypothetical protein  24.41 
 
 		 511 aa  52.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.276879  normal  0.0219591 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2955  major facilitator superfamily MFS_1  32.33 
 
 		 405 aa  52  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0290  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  31.09 
 
 		 472 aa  52  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000222424  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0454  major facilitator superfamily MFS_1  29.08 
 
 		 404 aa  51.6  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal  0.684757 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3542  oligogalacturonide transporter  23.08 
 
 		 519 aa  51.2  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.578582  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1599  major facilitator transporter  23.67 
 
 		 421 aa  51.2  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1182  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.65 
 
 		 441 aa  50.8  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.020658  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3732  sugar:cation symporter family protein  31.01 
 
 		 443 aa  50.8  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170381  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3738  hypothetical protein  40.58 
 
 		 467 aa  50.8  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00183877  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2081  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.39 
 
 		 481 aa  50.8  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0834729  hitchhiker  0.000000228967 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1215  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.65 
 
 		 441 aa  50.8  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.525269  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0806  major facilitator transporter  34.44 
 
 		 419 aa  50.8  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3175  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.65 
 
 		 442 aa  50.8  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0664881  normal  0.904255 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0853  major facilitator superfamily MFS_1  22.44 
 
 		 523 aa  50.8  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3380  oligogalacturonide transporter  22.49 
 
 		 519 aa  50.8  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1130  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.65 
 
 		 441 aa  50.8  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1406  major facilitator transporter  32.63 
 
 		 401 aa  50.4  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000773977  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1395  hypothetical protein  32.33 
 
 		 443 aa  49.7  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00525698 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2444  major facilitator transporter  23.98 
 
 		 527 aa  49.7  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3149  major facilitator superfamily MFS_1  23.65 
 
 		 460 aa  49.7  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1994  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.4 
 
 		 481 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00859833  hitchhiker  0.00113965 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1981  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.4 
 
 		 481 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00156524  hitchhiker  0.000367008 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1367  Na+/xyloside symporter or related transporter  25.69 
 
 		 634 aa  48.9  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.316422  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0575  major facilitator transporter  24.64 
 
 		 461 aa  48.9  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1146  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.26 
 
 		 442 aa  48.9  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0798  transporter, putative  23.51 
 
 		 442 aa  48.1  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3190  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.11 
 
 		 460 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1315  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.6 
 
 		 442 aa  47.8  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2052  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.4 
 
 		 471 aa  47.8  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2155  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.93 
 
 		 471 aa  47.8  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00011339  normal  0.022313 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4367  major facilitator transporter  28.04 
 
 		 493 aa  47.4  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2906  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.11 
 
 		 460 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03437  putative permease  26.32 
 
 		 466 aa  47.4  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0733  sodium:glactoside symporter family protein  62.16 
 
 		 465 aa  47  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.958172  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3908  sugar glycoside-pentoside-hexuronide family protein  26.32 
 
 		 466 aa  47.4  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.845629  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03388  hypothetical protein  26.32 
 
 		 466 aa  47.4  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4282  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.08 
 
 		 444 aa  47  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.368763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4394  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.08 
 
 		 444 aa  47  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0181186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4396  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.08 
 
 		 444 aa  47  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4311  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.08 
 
 		 444 aa  47  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4463  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.08 
 
 		 444 aa  47  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2608  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.47 
 
 		 442 aa  46.2  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1401  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  29.63 
 
 		 444 aa  46.2  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.738999  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03160  Na+/melibiose symporter-like transporter  36 
 
 		 419 aa  46.2  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0305  Na+/xyloside symporter or related transporter  29.6 
 
 		 479 aa  45.8  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0574168  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5276  major facilitator transporter  22.32 
 
 		 505 aa  45.8  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000299294 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8054  Na+/melibiose symporter and related transporter- like protein  29.06 
 
 		 460 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0444125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4951  sugar transporter, glycoside-pentoside-hexuronide family  26.32 
 
 		 466 aa  45.8  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.841107 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0034  major facilitator superfamily MFS_1  32.76 
 
 		 435 aa  45.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>