139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0200 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0200  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
415 aa  800    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0523  major facilitator transporter  44.07 
 
 
416 aa  302  6.000000000000001e-81  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1599  major facilitator transporter  40.65 
 
 
421 aa  288  1e-76  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1406  major facilitator transporter  41.41 
 
 
401 aa  267  2e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000773977  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2885  major facilitator transporter  32.8 
 
 
432 aa  213  4.9999999999999996e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00035649  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0798  transporter, putative  32.96 
 
 
442 aa  198  1.0000000000000001e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0893  major facilitator superfamily permease  25.73 
 
 
450 aa  94.4  3e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0616  major facilitator superfamily MFS_1  26.16 
 
 
443 aa  88.6  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0461422  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0994  major facilitator superfamily permease  26.1 
 
 
450 aa  87  6e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.211502  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4675  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 
411 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0975  hypothetical protein  25.84 
 
 
498 aa  77.8  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.798408  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0832  major facilitator superfamily permease  23.84 
 
 
453 aa  77.4  0.0000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000561592  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0898  major facilitator superfamily permease  25.33 
 
 
454 aa  75.9  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1614  major facilitator transporter  24.49 
 
 
448 aa  74.3  0.000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000115723  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0454  major facilitator superfamily MFS_1  24.87 
 
 
404 aa  71.2  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal  0.684757 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1403  major facilitator transporter  28.57 
 
 
505 aa  68.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.206645  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0053  major facilitator transporter  24.15 
 
 
449 aa  67.8  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000090495  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0041  major facilitator superfamily permease  23.59 
 
 
471 aa  66.6  0.0000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000141077  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2458  transporter, putative  25.28 
 
 
529 aa  65.9  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05075  putative sugar transporter  24.79 
 
 
507 aa  65.5  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0544446  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0087  major facilitator transporter  23.44 
 
 
457 aa  64.7  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000315537  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1925  major facilitator transporter  25.69 
 
 
531 aa  63.5  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0805  major facilitator family transporter  24.44 
 
 
417 aa  63.5  0.000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.03228  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3858  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.33 
 
 
469 aa  63.5  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.784369  normal  0.0678057 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2441  transporter, putative  30.13 
 
 
453 aa  63.2  0.000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0973262  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1870  major facilitator transporter  25.69 
 
 
531 aa  63.2  0.000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2011  major facilitator superfamily MFS_1  23.68 
 
 
551 aa  62.8  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000990966  hitchhiker  0.000202625 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2108  major facilitator transporter  25.69 
 
 
531 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.753085 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2336  major facilitator transporter  23.68 
 
 
551 aa  62.8  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2452  major facilitator transporter  23.68 
 
 
551 aa  62.8  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01889  sugar transporter  23.04 
 
 
493 aa  62.8  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.660327  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2347  major facilitator transporter  23.36 
 
 
551 aa  61.2  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2187  major facilitator transporter  27.85 
 
 
502 aa  60.1  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1776  major facilitator transporter  23.91 
 
 
519 aa  60.1  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0516559  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2003  major facilitator transporter  24.32 
 
 
530 aa  58.9  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1344  major facilitator transporter  26.42 
 
 
454 aa  58.5  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1015  major facilitator transporter  22.71 
 
 
502 aa  58.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0599  transporter, putative  24.05 
 
 
501 aa  57  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870524  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02710  Major Facilitator Superfamily transporter  22.8 
 
 
428 aa  55.8  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199882  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0892  major facilitator transporter  25 
 
 
424 aa  56.2  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.805867  normal  0.497197 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2202  major facilitator transporter  24.27 
 
 
551 aa  55.5  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000401875 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1587  hypothetical protein  24.18 
 
 
413 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0149232 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3382  major facilitator superfamily MFS_1  27 
 
 
393 aa  53.9  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1406  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.64 
 
 
471 aa  53.9  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1657  major facilitator transporter  24.68 
 
 
518 aa  53.5  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0729  major facilitator transporter  23.25 
 
 
420 aa  53.5  0.000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.463384  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0911  PUCC protein  24.94 
 
 
449 aa  53.5  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.592939  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0380  major facilitator family transporter  24.58 
 
 
408 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0827  major facilitator transporter  22.58 
 
 
406 aa  52.4  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1224  major facilitator family transporter  24.58 
 
 
413 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1109  major facilitator transporter  22.53 
 
 
426 aa  52.8  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1569  major facilitator family transporter  24.58 
 
 
413 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1756  major facilitator family transporter  24.58 
 
 
413 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2864  major facilitator family transporter  24.58 
 
 
413 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0423  major facilitator family transporter  24.58 
 
 
413 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0084  major facilitator transporter  22.7 
 
 
461 aa  52.4  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380135  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  25.99 
 
 
424 aa  52.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1765  major facilitator transporter  23.4 
 
 
376 aa  52.4  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1059  major facilitator superfamily MFS_1  25.77 
 
 
420 aa  53.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1560  PUCC protein  24.63 
 
 
450 aa  52.8  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.507042  hitchhiker  0.000951091 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  25.56 
 
 
423 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1874  major facilitator transporter  23.77 
 
 
524 aa  52.4  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322942  normal  0.129685 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3289  major facilitator superfamily MFS_1  23 
 
 
416 aa  50.8  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2738  major facilitator transporter  26.28 
 
 
510 aa  50.8  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.934726  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1056  major facilitator transporter  35.71 
 
 
396 aa  51.2  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0999083  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3730  hypothetical protein  23.19 
 
 
412 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218361  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0682  major facilitator transporter  24.89 
 
 
454 aa  50.8  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_709  permease of the major facilitator superfamily  22.99 
 
 
420 aa  50.8  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.768296  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3264  hypothetical protein  23.84 
 
 
408 aa  50.4  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0654  major facilitator transporter  27.02 
 
 
399 aa  50.4  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0842351 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2115  major facilitator transporter  25.37 
 
 
386 aa  50.4  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1990  putative multidrug resistance protein  27.25 
 
 
409 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.492861  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0864  major facilitator transporter  24.69 
 
 
441 aa  50.1  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  24.25 
 
 
423 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06480  Na+/melibiose symporter-like transporter  20.9 
 
 
460 aa  49.3  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.610657  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2534  major facilitator superfamily MFS_1  23.43 
 
 
446 aa  49.3  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  26.16 
 
 
424 aa  49.3  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4313  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.63 
 
 
497 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0453293  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3641  hypothetical protein  23.5 
 
 
412 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3324  multidrug resistance protein B; transporter permease  24.85 
 
 
412 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0999  major facilitator transporter  24 
 
 
390 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0123393 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1500  major facilitator transporter  22.15 
 
 
448 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.21091 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5086  major facilitator superfamily MFS_1  22.32 
 
 
457 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0501179  normal  0.911731 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02413  sugar transporter  29.36 
 
 
443 aa  48.5  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1527  Na+/xyloside symporter  24.38 
 
 
444 aa  48.9  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  26.11 
 
 
423 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3285  major facilitator transporter  24.63 
 
 
405 aa  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1458  major facilitator transporter  24.55 
 
 
480 aa  48.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2744  major facilitator family transporter  21.77 
 
 
393 aa  47.4  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14174  predicted protein  18.61 
 
 
405 aa  47.8  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0297  major facilitator superfamily MFS_1  26.34 
 
 
441 aa  47.8  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.321668  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4087  major facilitator transporter  24 
 
 
514 aa  47.8  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  23.88 
 
 
423 aa  47.4  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  23.88 
 
 
423 aa  47.4  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  23.88 
 
 
423 aa  47.4  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  23.88 
 
 
423 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 
418 aa  47  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1461  PucC protein  22.35 
 
 
449 aa  46.6  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.833113  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0906  major facilitator transporter  22.77 
 
 
386 aa  46.6  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0319355 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  24.28 
 
 
424 aa  46.6  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>