74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01889 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0975  hypothetical protein  70.48 
 
 		 498 aa  701    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.798408  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01889  sugar transporter  100 
 
 		 493 aa  981    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.660327  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5086  major facilitator superfamily MFS_1  45.17 
 
 		 457 aa  421  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0501179  normal  0.911731 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1870  major facilitator transporter  39.27 
 
 		 531 aa  383  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2108  major facilitator transporter  39.27 
 
 		 531 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.753085 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1657  major facilitator transporter  39.15 
 
 		 518 aa  378  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0599  transporter, putative  39.85 
 
 		 501 aa  372  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870524  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05075  putative sugar transporter  38.05 
 
 		 507 aa  369  1e-101  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0544446  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1403  major facilitator transporter  38.12 
 
 		 505 aa  372  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.206645  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1925  major facilitator transporter  37.68 
 
 		 531 aa  369  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2458  transporter, putative  38.38 
 
 		 529 aa  362  7.0000000000000005e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1874  major facilitator transporter  38.31 
 
 		 524 aa  341  2e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322942  normal  0.129685 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2738  major facilitator transporter  39.25 
 
 		 510 aa  338  1.9999999999999998e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.934726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1015  major facilitator transporter  35.2 
 
 		 502 aa  330  5.0000000000000004e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1500  major facilitator transporter  36.76 
 
 		 448 aa  324  3e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.21091 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1021  major facilitator superfamily MFS_1  37.38 
 
 		 495 aa  318  2e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4087  major facilitator transporter  37.96 
 
 		 514 aa  307  3e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1886  major facilitator transporter  36.15 
 
 		 501 aa  305  1.0000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.156331  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2336  major facilitator transporter  36.23 
 
 		 551 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2452  major facilitator transporter  36.23 
 
 		 551 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2011  major facilitator superfamily MFS_1  36.23 
 
 		 551 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000990966  hitchhiker  0.000202625 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0864  major facilitator transporter  38.43 
 
 		 441 aa  304  3.0000000000000004e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2347  major facilitator transporter  36.04 
 
 		 551 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0053  major facilitator transporter  38.88 
 
 		 449 aa  291  1e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000090495  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1089  major facilitator superfamily MFS_1  34.4 
 
 		 509 aa  292  1e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.339374  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0087  major facilitator transporter  37.76 
 
 		 457 aa  287  2.9999999999999996e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000315537  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0994  major facilitator superfamily permease  37.78 
 
 		 450 aa  286  4e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.211502  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0893  major facilitator superfamily permease  37.01 
 
 		 450 aa  284  2.0000000000000002e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0832  major facilitator superfamily permease  34.93 
 
 		 453 aa  279  9e-74  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000561592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1614  major facilitator transporter  35.16 
 
 		 448 aa  274  2.0000000000000002e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000115723  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0041  major facilitator superfamily permease  32.57 
 
 		 471 aa  269  1e-70  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000141077  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2441  transporter, putative  34.93 
 
 		 453 aa  266  4e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0973262  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0898  major facilitator superfamily permease  34.22 
 
 		 454 aa  254  2.0000000000000002e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2187  major facilitator transporter  54.59 
 
 		 502 aa  249  7e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0084  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 461 aa  248  1e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380135  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2003  major facilitator transporter  51.82 
 
 		 530 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1776  major facilitator transporter  48.35 
 
 		 519 aa  242  1e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0516559  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2202  major facilitator transporter  47.28 
 
 		 551 aa  239  1e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000401875 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3953  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 457 aa  223  8e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02413  sugar transporter  30.09 
 
 		 443 aa  203  6e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1877  major facilitator transporter  28.11 
 
 		 458 aa  202  8e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01240  sugar transporter  30.32 
 
 		 428 aa  202  9.999999999999999e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.686511  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0596  major facilitator transporter  44.05 
 
 		 500 aa  186  6e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.377823  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01510  conserved hypothetical protein  26.18 
 
 		 459 aa  80.9  0.00000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2885  major facilitator transporter  24.02 
 
 		 432 aa  65.1  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00035649  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02289  sucrose transporter, putative (Eurofung)  23.27 
 
 		 635 aa  61.2  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01690  conserved hypothetical protein  23.9 
 
 		 674 aa  60.5  0.00000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.887535  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1599  major facilitator transporter  28.22 
 
 		 421 aa  59.3  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1269  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.58 
 
 		 465 aa  56.2  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.727469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0200  major facilitator superfamily MFS_1  23.04 
 
 		 415 aa  55.5  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0034  major facilitator superfamily MFS_1  35.25 
 
 		 435 aa  54.3  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0523  major facilitator transporter  22.83 
 
 		 416 aa  53.5  0.000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2049  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  28.57 
 
 		 469 aa  53.5  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0454  major facilitator superfamily MFS_1  25.68 
 
 		 404 aa  52.8  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal  0.684757 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3267  major facilitator transporter  36.36 
 
 		 415 aa  52.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0780681  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0892  major facilitator transporter  29.06 
 
 		 424 aa  50.1  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.805867  normal  0.497197 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1406  major facilitator transporter  23.02 
 
 		 401 aa  48.9  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000773977  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14174  predicted protein  30.97 
 
 		 405 aa  47.8  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1700  major facilitator superfamily MFS_1  23.19 
 
 		 391 aa  47.8  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0353  major facilitator transporter  25.54 
 
 		 464 aa  47.4  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.939472  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  24.12 
 
 		 461 aa  47.4  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  24.12 
 
 		 461 aa  47.4  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  24.12 
 
 		 461 aa  47.4  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3554  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 423 aa  46.2  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2622  sugar transporter, glycoside-pentoside-hexuronide  31.96 
 
 		 479 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.455215  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_31966  predicted protein  24.46 
 
 		 536 aa  46.2  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0575  major facilitator transporter  23.04 
 
 		 461 aa  45.1  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0654  major facilitator transporter  25 
 
 		 399 aa  43.9  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0842351 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1988  major facilitator superfamily MFS_1  26.45 
 
 		 425 aa  43.9  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0997  Na+/melibiose symporter and related transporters-like  35.35 
 
 		 475 aa  43.5  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.281913  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  28.89 
 
 		 447 aa  43.5  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1406  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.96 
 
 		 471 aa  43.5  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3738  hypothetical protein  22.77 
 
 		 467 aa  43.5  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00183877  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 410 aa  43.5  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>