230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0997 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0997  Na+/melibiose symporter and related transporters-like  100 
 
 
475 aa  941    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.281913  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3075  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  46.67 
 
 
482 aa  379  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.818183  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2664  hypothetical protein  36.17 
 
 
486 aa  255  1.0000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2853  sugar transporter  31.12 
 
 
485 aa  179  7e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.563006  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0571  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.66 
 
 
457 aa  144  3e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.74034  normal  0.0218606 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.84 
 
 
476 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0430  major facilitator transporter  27.85 
 
 
503 aa  136  7.000000000000001e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1406  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  28.69 
 
 
471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3858  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.06 
 
 
469 aa  130  7.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.784369  normal  0.0678057 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3583  galactoside symporter  26.94 
 
 
475 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2906  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.74 
 
 
460 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1019  major facilitator transporter  27.29 
 
 
500 aa  121  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3190  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.32 
 
 
460 aa  118  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2992  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.55 
 
 
472 aa  110  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0200  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  35.61 
 
 
544 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5276  major facilitator transporter  29.02 
 
 
505 aa  103  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000299294 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0290  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.43 
 
 
472 aa  101  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000222424  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1614  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.36 
 
 
448 aa  100  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0329184  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5398  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.2 
 
 
471 aa  99.8  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.243683  normal  0.179969 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3387  major facilitator superfamily MFS_1  24.95 
 
 
475 aa  97.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0724765 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3565  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.75 
 
 
447 aa  93.6  6e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.117988  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0388  major facilitator transporter  28.57 
 
 
497 aa  93.6  7e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.991466  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2284  putative cation symporter  24.24 
 
 
461 aa  93.2  9e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974122 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4479  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  35.67 
 
 
552 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.176062 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4415  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  35.67 
 
 
552 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0459  major facilitator transporter  29 
 
 
481 aa  90.5  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4313  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.54 
 
 
497 aa  89.4  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0453293  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4400  sugar transporter family protein  27.17 
 
 
468 aa  88.2  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25 
 
 
460 aa  87.8  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736057  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1269  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  21.6 
 
 
465 aa  87.8  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.727469  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2622  sugar transporter, glycoside-pentoside-hexuronide  33.99 
 
 
479 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.455215  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3985  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.6 
 
 
476 aa  87  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.439786  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4262  sugar transporter family protein  26.95 
 
 
461 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4524  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.31 
 
 
465 aa  85.1  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2498  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.54 
 
 
480 aa  85.5  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358109  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4954  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  30.12 
 
 
463 aa  85.5  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843133  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4109  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.73 
 
 
461 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03762  predicted transporter  26.73 
 
 
468 aa  84.7  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03711  hypothetical protein  26.73 
 
 
468 aa  84.7  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5323  sugar transporter family protein  26.95 
 
 
461 aa  84.7  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.333242 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5322  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter family protein  25.56 
 
 
467 aa  84  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.357419 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3708  sugar:cation symporter family protein  23.04 
 
 
442 aa  84  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4227  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.96 
 
 
473 aa  84  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1619  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  27.67 
 
 
436 aa  83.2  0.000000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03761  predicted transporter  25.91 
 
 
467 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03710  hypothetical protein  25.91 
 
 
467 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0733  sodium:glactoside symporter family protein  22.2 
 
 
465 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.958172  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0456  putative symporter YagG  26.14 
 
 
459 aa  82.4  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0319555 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4399  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter family protein  25.56 
 
 
467 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4293  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.95 
 
 
472 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0966548  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4339  putative permease  24.95 
 
 
474 aa  82.4  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2049  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  26.36 
 
 
469 aa  82.4  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4261  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter family protein  25.28 
 
 
467 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4405  glucuronide carrier protein  26.11 
 
 
473 aa  82.4  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.196167  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4110  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.94 
 
 
467 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0748  sodium:glactoside symporter family protein  22.05 
 
 
454 aa  80.9  0.00000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.329176  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4248  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.74 
 
 
472 aa  80.9  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3732  sugar:cation symporter family protein  22.25 
 
 
443 aa  80.9  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170381  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17501  GPH family sugar transporter  32.26 
 
 
467 aa  80.9  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.276796  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1395  hypothetical protein  22.7 
 
 
443 aa  80.1  0.00000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00525698 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4228  inner membrane symporter YihP  27.27 
 
 
460 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2602  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.41 
 
 
475 aa  79.7  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.178809  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4406  inner membrane symporter YihP  26.61 
 
 
460 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0907861  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3697  sugar:cation symporter family protein  23.86 
 
 
467 aa  77.8  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.455392  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1315  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.36 
 
 
442 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4340  inner membrane symporter YihP  27.15 
 
 
460 aa  77  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8054  Na+/melibiose symporter and related transporter- like protein  26.99 
 
 
460 aa  77  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0444125  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4000  putative transporter  23.91 
 
 
460 aa  77  0.0000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.947516  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4294  inner membrane symporter YihP  27.15 
 
 
460 aa  77  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357729  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4249  inner membrane symporter YihP  27.15 
 
 
460 aa  77  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0048  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.91 
 
 
460 aa  77  0.0000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0054  putative transporter  23.91 
 
 
460 aa  77  0.0000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.320086 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4108  putative transporter  24.37 
 
 
479 aa  76.3  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2816  major facilitator superfamily protein  27.89 
 
 
459 aa  76.3  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3868  putative transporter  23.91 
 
 
479 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4161  putative transporter  23.91 
 
 
479 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0894  putative GPH family sugar transporter  32.37 
 
 
451 aa  75.5  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.351001  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0576  GPH family sugar transporter  28.76 
 
 
455 aa  75.9  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2697  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.06 
 
 
465 aa  75.1  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.296513 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14841  GPH family sugar transporter  36.48 
 
 
449 aa  75.1  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3967  putative transporter  22.71 
 
 
460 aa  75.1  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.286007  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4030  putative transporter  22.71 
 
 
460 aa  75.1  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4076  putative transporter  22.71 
 
 
460 aa  75.1  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.591118  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5030  putative transporter  23.91 
 
 
460 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3957  putative transporter  22.71 
 
 
460 aa  73.9  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2608  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.85 
 
 
442 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2993  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.54 
 
 
475 aa  73.6  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.624539  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05681  GPH family sugar transporter  26.97 
 
 
480 aa  73.6  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3350  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.4 
 
 
477 aa  73.6  0.000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13771  GPH family sugar transporter  31.44 
 
 
472 aa  73.2  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.66133  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15231  GPH family sugar transporter  35.85 
 
 
448 aa  73.2  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4367  major facilitator transporter  23.87 
 
 
493 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15091  GPH family sugar transporter  36.94 
 
 
448 aa  72.8  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0070  putative transporter  22.15 
 
 
464 aa  73.2  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.602143  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4221  major facilitator transporter  28.47 
 
 
472 aa  73.2  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.218171  normal  0.657626 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2706  hypothetical protein  32.14 
 
 
625 aa  72  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3738  hypothetical protein  24.26 
 
 
467 aa  72  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00183877  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1215  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.92 
 
 
441 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.525269  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3175  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  28.92 
 
 
442 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0664881  normal  0.904255 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1130  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.92 
 
 
441 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>